MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Pseudovibrio sp. FO-BEG1 plasmid unnamed

Total Repeats: 994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016646	ACGC	2	8	102	109	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016646	GTG	2	6	122	127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016646	CAT	2	6	194	199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016646	TGA	2	6	235	240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016646	GCC	2	6	341	346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_016646	CAG	2	6	392	397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016646	CAA	3	9	490	498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016646	CGGA	2	8	500	507	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016646	CCTC	2	8	591	598	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_016646	GGA	2	6	610	615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016646	CGG	2	6	660	665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016646	TCT	2	6	709	714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016646	G	6	6	3361	3366	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016646	AGC	2	6	3392	3397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016646	GCT	2	6	3419	3424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016646	C	6	6	3430	3435	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_016646	CGG	2	6	5101	5106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016646	TA	3	6	5164	5169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016646	CTC	2	6	6071	6076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_016646	TTGA	2	8	6117	6124	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016646	TTA	2	6	6248	6253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016646	CG	4	8	8049	8056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016646	ATCA	2	8	8058	8065	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016646	TTTTC	2	10	8105	8114	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_016646	TTC	2	6	9257	9262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016646	TCA	2	6	11407	11412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016646	AT	3	6	11483	11488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016646	TAATC	2	10	11501	11510	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_016646	CAGAAG	2	12	11526	11537	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_016646	TAAA	2	8	11552	11559	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016646	ATT	2	6	11590	11595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016646	AAT	2	6	11596	11601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016646	TCA	2	6	11783	11788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016646	ATT	2	6	13254	13259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016646	CT	3	6	14166	14171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016646	A	6	6	14272	14277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016646	GTT	2	6	15458	15463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016646	GCG	2	6	15468	15473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016646	CAC	2	6	15490	15495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_016646	AACA	2	8	15581	15588	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016646	TTG	2	6	15639	15644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016646	GATCA	2	10	16152	16161	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_016646	GA	3	6	16173	16178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016646	T	6	6	16211	16216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016646	CTTTG	2	10	16276	16285	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_016646	TTC	2	6	16326	16331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016646	CTC	2	6	16359	16364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_016646	CTT	2	6	16405	16410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016646	TC	3	6	16434	16439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016646	GCA	2	6	16463	16468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016646	GGC	2	6	16587	16592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016646	ACCAA	2	10	16597	16606	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_016646	AAG	2	6	19134	19139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016646	TA	3	6	19489	19494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016646	TA	3	6	19505	19510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016646	TC	3	6	19682	19687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016646	CTT	2	6	21758	21763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016646	TCCC	2	8	21766	21773	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
59	NC_016646	TATATG	2	12	21846	21857	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016646	GC	3	6	21902	21907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016646	AAGA	2	8	21947	21954	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016646	AAAT	2	8	22562	22569	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016646	ATGTG	2	10	22625	22634	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016646	CAA	2	6	22728	22733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016646	GAC	2	6	22765	22770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016646	TTG	2	6	22829	22834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016646	AGG	2	6	23210	23215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016646	TCC	2	6	23293	23298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_016646	CGA	2	6	23318	23323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016646	GTC	2	6	23343	23348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016646	ATTT	2	8	23390	23397	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016646	ACC	2	6	24261	24266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_016646	CAC	2	6	24267	24272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_016646	GTG	2	6	24291	24296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016646	AC	4	8	24318	24325	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016646	CTA	2	6	24331	24336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016646	TCA	2	6	26429	26434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016646	ATT	2	6	26605	26610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016646	CAA	2	6	26617	26622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016646	ATC	2	6	26684	26689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016646	GCA	2	6	26705	26710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016646	AGA	2	6	26715	26720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016646	CGT	2	6	26788	26793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016646	ACG	2	6	26819	26824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016646	TCC	2	6	29358	29363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_016646	TAT	2	6	29418	29423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016646	T	6	6	29426	29431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016646	T	6	6	30095	30100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016646	CAAC	2	8	30135	30142	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016646	AT	3	6	30209	30214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016646	TTTC	2	8	31889	31896	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_016646	CCG	2	6	33971	33976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_016646	CT	3	6	34058	34063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_016646	A	6	6	34078	34083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016646	GGA	2	6	34087	34092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016646	TGA	2	6	34108	34113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016646	CAA	2	6	34125	34130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016646	CAG	2	6	34142	34147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016646	TTA	2	6	34159	34164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016646	ACT	2	6	34169	34174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016646	CATTT	2	10	34215	34224	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_016646	TTG	2	6	34279	34284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016646	TTTCC	2	10	34286	34295	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_016646	GAG	2	6	37396	37401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016646	TGC	2	6	39993	39998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016646	AAC	2	6	41494	41499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016646	CCA	2	6	42121	42126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_016646	GCA	2	6	42176	42181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016646	AAGG	2	8	42215	42222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016646	TCGAT	2	10	42271	42280	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_016646	TCT	2	6	42293	42298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016646	GGA	2	6	42392	42397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016646	ATGG	2	8	42416	42423	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016646	TGA	2	6	42462	42467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016646	ACC	2	6	42596	42601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_016646	AGTAT	2	10	42793	42802	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016646	GGA	2	6	43876	43881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016646	AAC	2	6	43926	43931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016646	ATTTT	2	10	43957	43966	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016646	ATG	2	6	43987	43992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016646	TTA	2	6	44019	44024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016646	CAA	2	6	44082	44087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016646	GTG	2	6	44713	44718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016646	GCG	2	6	44760	44765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016646	A	6	6	46464	46469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016646	TAA	2	6	46471	46476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016646	TTTAC	2	10	46510	46519	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_016646	CTG	2	6	47035	47040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016646	CG	3	6	47085	47090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_016646	GAA	2	6	47104	47109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016646	GCC	2	6	47150	47155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_016646	AGG	2	6	47174	47179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016646	TTTCG	2	10	47264	47273	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_016646	GTTG	2	8	47324	47331	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016646	GCC	2	6	48534	48539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_016646	ATT	2	6	48608	48613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016646	CAC	2	6	48658	48663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_016646	CAG	2	6	50009	50014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_016646	TC	3	6	51319	51324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_016646	AGT	2	6	51331	51336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016646	AGC	2	6	51372	51377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_016646	GCA	2	6	52960	52965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_016646	TGAA	2	8	52976	52983	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016646	ACGC	2	8	53132	53139	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_016646	GAA	2	6	53208	53213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016646	AGC	2	6	53305	53310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_016646	GCA	2	6	53404	53409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_016646	AAT	2	6	53415	53420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016646	GCC	2	6	53534	53539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_016646	ATT	2	6	53593	53598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016646	GCA	2	6	53610	53615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_016646	CCTC	2	8	53619	53626	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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284	NC_016646	GAG	2	6	106882	106887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
285	NC_016646	GCC	2	6	106930	106935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
286	NC_016646	TAAT	2	8	107159	107166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_016646	TGT	2	6	107310	107315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_016646	T	6	6	165875	165880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_016646	CTGG	2	8	165901	165908	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
423	NC_016646	ATATTT	2	12	165994	166005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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428	NC_016646	AATA	2	8	166263	166270	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
429	NC_016646	ATA	2	6	166334	166339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_016646	TTA	2	6	166379	166384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
431	NC_016646	TGT	3	9	166390	166398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
432	NC_016646	CAT	2	6	166489	166494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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434	NC_016646	A	6	6	166997	167002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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437	NC_016646	ATC	2	6	167268	167273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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441	NC_016646	TGA	2	6	167413	167418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_016646	AT	3	6	167530	167535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_016646	CT	3	6	167680	167685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
452	NC_016646	AG	3	6	167689	167694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
453	NC_016646	AAG	2	6	167706	167711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_016646	ACT	2	6	167749	167754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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461	NC_016646	TTG	2	6	170620	170625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
462	NC_016646	TC	3	6	170630	170635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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464	NC_016646	GCA	2	6	170780	170785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
465	NC_016646	AACTG	2	10	170815	170824	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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489	NC_016646	CT	3	6	184594	184599	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
490	NC_016646	CAA	2	6	184602	184607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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