MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Paenibacillus terrae HPL-003 chromosome

Total Repeats: 20769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016641	ATG	2	6	421598	421603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_016641	GCCT	2	8	421717	421724	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1503	NC_016641	TTA	2	6	421766	421771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_016641	TTC	2	6	423414	423419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_016641	GTA	2	6	423461	423466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_016641	TATT	2	8	423474	423481	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_016641	TGA	2	6	423524	423529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_016641	TCC	2	6	424360	424365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1509	NC_016641	CTG	2	6	424387	424392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_016641	GGCT	2	8	424414	424421	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1511	NC_016641	AAG	2	6	424476	424481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_016641	CTG	2	6	424513	424518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_016641	CAT	2	6	424542	424547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_016641	A	7	7	425080	425086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_016641	CAG	2	6	425147	425152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_016641	CTC	2	6	426918	426923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1517	NC_016641	TTTA	2	8	427587	427594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_016641	AGGA	2	8	427598	427605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_016641	TCCAT	2	10	427681	427690	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1520	NC_016641	GCT	2	6	429599	429604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_016641	TC	3	6	429985	429990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_016641	CCTT	2	8	431345	431352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1523	NC_016641	TAT	2	6	431368	431373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_016641	TTA	2	6	431430	431435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_016641	A	6	6	431446	431451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_016641	TTG	2	6	431476	431481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_016641	TTTC	2	8	432056	432063	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1528	NC_016641	T	6	6	432085	432090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_016641	CTA	2	6	432104	432109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_016641	GAG	2	6	432471	432476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_016641	ATA	2	6	433210	433215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_016641	TTC	2	6	433247	433252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_016641	TAT	2	6	433258	433263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_016641	CA	3	6	433271	433276	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1535	NC_016641	A	6	6	433301	433306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_016641	GA	3	6	433362	433367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_016641	AGA	2	6	433441	433446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_016641	CGA	2	6	433501	433506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_016641	GA	3	6	433538	433543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_016641	CAG	2	6	433559	433564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1542	NC_016641	GGC	2	6	433668	433673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_016641	ACC	2	6	433686	433691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_016641	A	7	7	433727	433733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_016641	TGC	2	6	433735	433740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1548	NC_016641	CGA	2	6	433844	433849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_016641	GCC	2	6	433856	433861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_016641	GCG	2	6	433957	433962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_016641	A	6	6	433963	433968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_016641	CTG	2	6	433980	433985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_016641	CAT	3	9	434012	434020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1555	NC_016641	TGA	2	6	434193	434198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1557	NC_016641	TC	3	6	434386	434391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1558	NC_016641	TA	3	6	434411	434416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_016641	TACT	2	8	434484	434491	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1560	NC_016641	TTTC	2	8	434512	434519	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1561	NC_016641	ACG	2	6	434635	434640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_016641	GTT	2	6	434685	434690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_016641	TC	3	6	435387	435392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1564	NC_016641	A	6	6	435406	435411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_016641	ACA	2	6	435437	435442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1567	NC_016641	AAC	2	6	435453	435458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_016641	TTG	2	6	435461	435466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_016641	ATC	2	6	435503	435508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1571	NC_016641	GTT	2	6	436228	436233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_016641	ATC	2	6	436248	436253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_016641	ATC	2	6	436299	436304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_016641	TCG	2	6	436313	436318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1580	NC_016641	ATC	2	6	437071	437076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1586	NC_016641	TC	3	6	440243	440248	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1589	NC_016641	TTA	2	6	441209	441214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_016641	TACCT	2	10	441274	441283	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1591	NC_016641	CATC	2	8	441323	441330	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_016641	TCA	2	6	441359	441364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1594	NC_016641	TCA	2	6	441397	441402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1597	NC_016641	A	7	7	442816	442822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_016641	TA	3	6	443294	443299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_016641	GTCAAT	2	12	443310	443321	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1601	NC_016641	T	6	6	443352	443357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_016641	ATT	2	6	443407	443412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1609	NC_016641	CGGAC	2	10	443698	443707	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1611	NC_016641	GAAT	2	8	443799	443806	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1615	NC_016641	ATGC	2	8	443906	443913	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1616	NC_016641	CTC	2	6	443920	443925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1617	NC_016641	AAATC	2	10	443976	443985	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1618	NC_016641	GACTT	2	10	443987	443996	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1619	NC_016641	A	6	6	444041	444046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1622	NC_016641	TAT	2	6	444893	444898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_016641	TAGT	2	8	444914	444921	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_016641	TC	3	6	444948	444953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_016641	TCG	2	6	444979	444984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_016641	AGAA	2	8	445013	445020	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_016641	AT	3	6	445036	445041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_016641	TATTT	2	10	445524	445533	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_016641	ACTA	2	8	445539	445546	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1630	NC_016641	TAAT	2	8	446331	446338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_016641	CTC	2	6	446339	446344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1632	NC_016641	ACTA	2	8	446363	446370	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1633	NC_016641	TA	3	6	446369	446374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_016641	TTAG	2	8	446387	446394	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1636	NC_016641	AAG	2	6	446435	446440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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