MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Paenibacillus terrae HPL-003 chromosome

Total Repeats: 20769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016641	A	6	6	285474	285479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_016641	ATT	2	6	285502	285507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_016641	TTG	2	6	285867	285872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_016641	AT	3	6	285890	285895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_016641	TAAA	2	8	285946	285953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_016641	A	8	8	285951	285958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_016641	AAG	2	6	286028	286033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_016641	CT	3	6	286704	286709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_016641	AAT	2	6	286844	286849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_016641	AGC	2	6	286868	286873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_016641	T	6	6	286892	286897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_016641	CAA	2	6	286898	286903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_016641	CAT	2	6	290601	290606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_016641	TG	3	6	290630	290635	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_016641	T	7	7	290752	290758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_016641	TGT	2	6	290769	290774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_016641	CAT	2	6	290821	290826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_016641	GGA	2	6	290831	290836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_016641	TTC	2	6	291115	291120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_016641	T	6	6	291135	291140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_016641	A	6	6	291147	291152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_016641	TGC	2	6	291214	291219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_016641	T	8	8	291275	291282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_016641	T	8	8	291287	291294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_016641	CTG	2	6	292898	292903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_016641	AGC	2	6	292909	292914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_016641	ATTT	2	8	293376	293383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_016641	TTC	2	6	293409	293414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_016641	AAAG	2	8	293415	293422	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_016641	AT	3	6	293457	293462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_016641	A	6	6	293515	293520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_016641	TTCT	2	8	293550	293557	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_016641	A	7	7	293599	293605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_016641	AAAG	2	8	293619	293626	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_016641	CTC	2	6	294310	294315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_016641	CTT	2	6	294321	294326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_016641	CT	3	6	295726	295731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_016641	GAT	2	6	295738	295743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_016641	ATC	2	6	295765	295770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1041	NC_016641	AATG	2	8	295831	295838	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_016641	ATT	2	6	296781	296786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_016641	TACT	2	8	296793	296800	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_016641	A	9	9	297217	297225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_016641	CTATA	2	10	297236	297245	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1046	NC_016641	TAC	2	6	297374	297379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_016641	GGC	2	6	297404	297409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1049	NC_016641	T	8	8	298069	298076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_016641	CTT	2	6	298123	298128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_016641	ATA	2	6	298135	298140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_016641	ATT	2	6	298187	298192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_016641	ATA	2	6	298230	298235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_016641	T	6	6	298518	298523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_016641	T	6	6	298586	298591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_016641	TA	3	6	298594	298599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_016641	AAGCG	2	10	298646	298655	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1058	NC_016641	TA	3	6	298793	298798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_016641	TAA	2	6	298857	298862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_016641	TTC	2	6	299083	299088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_016641	CTTC	2	8	299988	299995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_016641	ATG	2	6	300060	300065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_016641	ATA	2	6	300066	300071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_016641	A	7	7	300077	300083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_016641	A	6	6	300090	300095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_016641	TCC	2	6	300591	300596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_016641	TGAGG	2	10	300716	300725	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_016641	TCGGAT	2	12	302059	302070	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1069	NC_016641	CTGC	2	8	302141	302148	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_016641	AAC	2	6	302179	302184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_016641	A	6	6	302185	302190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_016641	TGA	2	6	302262	302267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_016641	CGG	2	6	302307	302312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_016641	AACA	2	8	303398	303405	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_016641	AAG	2	6	303406	303411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_016641	TCT	2	6	303430	303435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1078	NC_016641	ATGA	2	8	303491	303498	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_016641	TAATA	2	10	303811	303820	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_016641	T	6	6	304153	304158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1082	NC_016641	TTA	2	6	305942	305947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_016641	TGC	2	6	307706	307711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_016641	TA	3	6	307765	307770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_016641	ATG	2	6	307782	307787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1088	NC_016641	CCT	2	6	308830	308835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_016641	GTT	2	6	308855	308860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_016641	TCC	2	6	310652	310657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_016641	GTTT	2	8	310694	310701	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_016641	TAT	2	6	310711	310716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_016641	ATA	2	6	311722	311727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_016641	TGT	2	6	311743	311748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_016641	AT	3	6	311778	311783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_016641	TTG	2	6	311804	311809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1098	NC_016641	GGAA	2	8	311849	311856	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_016641	TGA	2	6	311875	311880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_016641	CAT	2	6	311900	311905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_016641	ATT	2	6	312269	312274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_016641	CCT	2	6	312275	312280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_016641	CT	3	6	312310	312315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_016641	TAT	2	6	312353	312358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_016641	ATC	2	6	312365	312370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1108	NC_016641	AGG	2	6	313780	313785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_016641	CTT	2	6	313796	313801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_016641	CTCC	2	8	316052	316059	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1111	NC_016641	ATT	3	9	316070	316078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_016641	TCA	2	6	316088	316093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_016641	TCC	2	6	316862	316867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_016641	ATA	2	6	319066	319071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_016641	TGG	2	6	319092	319097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_016641	A	8	8	319132	319139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_016641	CTC	2	6	319141	319146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_016641	GTA	2	6	319187	319192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_016641	CA	3	6	323124	323129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_016641	GCA	2	6	323130	323135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_016641	TCAC	2	8	323162	323169	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_016641	AAG	2	6	324382	324387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_016641	TATG	2	8	324443	324450	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_016641	TGG	2	6	324502	324507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_016641	ATT	2	6	324557	324562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_016641	GCC	2	6	324604	324609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_016641	TGCC	2	8	324619	324626	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_016641	TTG	2	6	324644	324649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_016641	A	7	7	325108	325114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_016641	GTA	2	6	326288	326293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_016641	ATACA	2	10	326305	326314	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1132	NC_016641	TGAG	2	8	327819	327826	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_016641	ATT	2	6	327847	327852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_016641	GCTC	2	8	327856	327863	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1135	NC_016641	T	6	6	327906	327911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_016641	ACATTC	2	12	328083	328094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_016641	TCA	2	6	329118	329123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_016641	TCC	2	6	329125	329130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1139	NC_016641	ATTT	2	8	329135	329142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_016641	ACC	2	6	329196	329201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1141	NC_016641	GCT	2	6	329249	329254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1142	NC_016641	CAG	2	6	329345	329350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1143	NC_016641	ACC	2	6	329374	329379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1144	NC_016641	TCA	2	6	329417	329422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1145	NC_016641	TCCT	2	8	330557	330564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1146	NC_016641	ATA	2	6	330593	330598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1147	NC_016641	TCA	2	6	330602	330607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1149	NC_016641	ATT	2	6	330875	330880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1150	NC_016641	AGGG	2	8	330924	330931	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1151	NC_016641	GCC	2	6	330962	330967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1152	NC_016641	CTTT	2	8	330968	330975	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1153	NC_016641	TA	3	6	331410	331415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1154	NC_016641	ACA	2	6	331486	331491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1155	NC_016641	TCA	2	6	331588	331593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1156	NC_016641	TCT	2	6	331594	331599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1158	NC_016641	C	6	6	331619	331624	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1159	NC_016641	CTTT	2	8	333455	333462	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1160	NC_016641	GGA	2	6	333527	333532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1161	NC_016641	TAA	2	6	335190	335195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1162	NC_016641	TAT	2	6	335207	335212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1163	NC_016641	A	6	6	335216	335221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1164	NC_016641	A	6	6	335223	335228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1165	NC_016641	ACAG	2	8	335268	335275	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1166	NC_016641	GAC	2	6	335280	335285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1167	NC_016641	TAA	2	6	335319	335324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1168	NC_016641	GA	3	6	335354	335359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1169	NC_016641	CA	3	6	335383	335388	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1170	NC_016641	GTT	2	6	335445	335450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1171	NC_016641	T	7	7	335449	335455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1172	NC_016641	TAG	3	9	335546	335554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1173	NC_016641	AGG	2	6	335563	335568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1174	NC_016641	TA	3	6	336947	336952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1175	NC_016641	GCT	2	6	337785	337790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1177	NC_016641	AT	3	6	337859	337864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1178	NC_016641	T	6	6	337894	337899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1179	NC_016641	CTT	2	6	339791	339796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1181	NC_016641	CATT	2	8	339857	339864	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1185	NC_016641	GCG	2	6	341967	341972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1197	NC_016641	A	6	6	347338	347343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1203	NC_016641	TGG	2	6	349403	349408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1213	NC_016641	GTGTA	2	10	352213	352222	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1214	NC_016641	TGA	2	6	352282	352287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1219	NC_016641	TTTA	2	8	353366	353373	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1222	NC_016641	A	6	6	358197	358202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1223	NC_016641	TGT	3	9	358236	358244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1226	NC_016641	GTT	2	6	358287	358292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1227	NC_016641	T	6	6	359407	359412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1228	NC_016641	ATGC	2	8	360492	360499	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1229	NC_016641	TAGA	2	8	360566	360573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1242	NC_016641	A	6	6	362471	362476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1247	NC_016641	TTG	2	6	362946	362951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1251	NC_016641	TGA	2	6	363243	363248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1252	NC_016641	AGT	2	6	363278	363283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1253	NC_016641	CAA	2	6	363297	363302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1254	NC_016641	TATG	2	8	363334	363341	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_016641	CAT	2	6	363363	363368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1258	NC_016641	TGT	2	6	370223	370228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1259	NC_016641	C	7	7	370233	370239	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1260	NC_016641	CCATA	2	10	372203	372212	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1261	NC_016641	C	7	7	373366	373372	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1263	NC_016641	TAA	2	6	373392	373397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1264	NC_016641	ATT	2	6	373419	373424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1265	NC_016641	T	6	6	373423	373428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1266	NC_016641	T	7	7	373436	373442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1267	NC_016641	ATTTT	2	10	373470	373479	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1268	NC_016641	TAC	2	6	373494	373499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1269	NC_016641	T	7	7	373519	373525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1270	NC_016641	ATT	2	6	373581	373586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1271	NC_016641	GAT	2	6	373614	373619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1273	NC_016641	ACAA	2	8	376560	376567	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1413	NC_016641	ATT	2	6	409905	409910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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