MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Paenibacillus terrae HPL-003 chromosome

Total Repeats: 20769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016641	TGCC	2	8	1485934	1485941	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5002	NC_016641	TCTT	2	8	1485942	1485949	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5003	NC_016641	TC	3	6	1485954	1485959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5004	NC_016641	TTC	2	6	1485968	1485973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_016641	GGA	2	6	1486064	1486069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_016641	GTT	2	6	1486132	1486137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_016641	CCTT	2	8	1487678	1487685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5008	NC_016641	A	6	6	1487700	1487705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_016641	CCT	2	6	1487714	1487719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_016641	AAG	2	6	1487733	1487738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_016641	TAT	2	6	1487774	1487779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_016641	TAT	2	6	1487814	1487819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_016641	TAA	2	6	1487821	1487826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_016641	A	8	8	1487848	1487855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_016641	GC	3	6	1487939	1487944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5016	NC_016641	TTC	2	6	1488767	1488772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_016641	ATT	2	6	1488786	1488791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_016641	AAC	2	6	1488831	1488836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_016641	GT	3	6	1488862	1488867	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_016641	A	6	6	1488938	1488943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_016641	AGA	2	6	1488954	1488959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_016641	TGC	2	6	1489051	1489056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_016641	AAG	2	6	1489113	1489118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_016641	TCT	2	6	1489165	1489170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_016641	T	6	6	1490618	1490623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_016641	CTC	2	6	1492953	1492958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5027	NC_016641	TC	3	6	1492957	1492962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5028	NC_016641	AAC	2	6	1492965	1492970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_016641	AAG	2	6	1492991	1492996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_016641	CTTT	2	8	1493000	1493007	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5031	NC_016641	T	6	6	1493027	1493032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_016641	TACA	2	8	1493066	1493073	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5033	NC_016641	TAA	2	6	1493142	1493147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_016641	TACA	2	8	1493171	1493178	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5035	NC_016641	AAC	2	6	1493208	1493213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_016641	AGA	2	6	1494456	1494461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_016641	TGCC	2	8	1494471	1494478	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5038	NC_016641	CTGT	2	8	1494541	1494548	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5039	NC_016641	CTTT	2	8	1494586	1494593	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5040	NC_016641	T	6	6	1494605	1494610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_016641	TGGA	2	8	1494625	1494632	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_016641	TC	3	6	1495126	1495131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5043	NC_016641	ATT	2	6	1495142	1495147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_016641	A	6	6	1495151	1495156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_016641	TTAT	2	8	1495164	1495171	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_016641	CTGT	2	8	1495188	1495195	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5047	NC_016641	CTC	2	6	1495241	1495246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5048	NC_016641	TCC	2	6	1495656	1495661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5049	NC_016641	ACT	2	6	1495700	1495705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_016641	GAG	2	6	1495744	1495749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_016641	GAA	2	6	1495765	1495770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_016641	AGG	2	6	1495780	1495785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_016641	TCG	2	6	1497200	1497205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_016641	TCG	2	6	1497270	1497275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_016641	TCA	2	6	1497323	1497328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_016641	TAT	2	6	1497507	1497512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_016641	CTGT	2	8	1497533	1497540	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5058	NC_016641	TCC	2	6	1498564	1498569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5059	NC_016641	TCT	2	6	1498839	1498844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_016641	GAA	2	6	1499063	1499068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_016641	GAA	2	6	1499189	1499194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_016641	CAT	2	6	1499285	1499290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_016641	CCG	2	6	1502789	1502794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5064	NC_016641	CTG	2	6	1502840	1502845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_016641	AAG	2	6	1502893	1502898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_016641	CGT	2	6	1503026	1503031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_016641	AT	3	6	1503039	1503044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_016641	CTC	2	6	1503068	1503073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5069	NC_016641	GGA	3	9	1503104	1503112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_016641	ATC	2	6	1503123	1503128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_016641	TC	3	6	1503585	1503590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5072	NC_016641	ATT	2	6	1503601	1503606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_016641	A	7	7	1503610	1503616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_016641	CTT	2	6	1503702	1503707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_016641	TCTG	2	8	1503708	1503715	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5076	NC_016641	TTA	2	6	1503734	1503739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5078	NC_016641	ACT	2	6	1503804	1503809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_016641	TGCA	2	8	1503812	1503819	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5080	NC_016641	ATCAAA	2	12	1503827	1503838	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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5082	NC_016641	AGC	2	6	1504557	1504562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_016641	T	7	7	1504572	1504578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_016641	AGCC	2	8	1504635	1504642	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5085	NC_016641	GGCT	2	8	1504668	1504675	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5086	NC_016641	TTC	2	6	1506457	1506462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_016641	TCAA	2	8	1506470	1506477	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5088	NC_016641	AGC	2	6	1506480	1506485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_016641	TAC	2	6	1506532	1506537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5091	NC_016641	CAACT	2	10	1506715	1506724	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5092	NC_016641	TC	3	6	1506774	1506779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5093	NC_016641	TTC	2	6	1506783	1506788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_016641	GCC	2	6	1507570	1507575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5095	NC_016641	T	6	6	1508305	1508310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_016641	TA	3	6	1508448	1508453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_016641	AAT	2	6	1508855	1508860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_016641	C	6	6	1508888	1508893	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5099	NC_016641	ATGA	2	8	1508909	1508916	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_016641	ATG	2	6	1508927	1508932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_016641	ACAA	2	8	1509005	1509012	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5102	NC_016641	AAG	2	6	1510513	1510518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_016641	GGC	2	6	1510538	1510543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_016641	TAA	2	6	1511229	1511234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_016641	ACA	2	6	1511245	1511250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_016641	AGCATT	2	12	1511266	1511277	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5107	NC_016641	TTA	2	6	1511290	1511295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_016641	AAAAC	2	10	1511307	1511316	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5109	NC_016641	GGA	2	6	1511329	1511334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_016641	GGT	2	6	1511346	1511351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_016641	CCT	2	6	1512710	1512715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5112	NC_016641	TGCT	2	8	1512739	1512746	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5113	NC_016641	T	6	6	1512765	1512770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_016641	ATT	2	6	1512816	1512821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_016641	TCA	2	6	1512831	1512836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_016641	GA	3	6	1512871	1512876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_016641	CAG	2	6	1513314	1513319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_016641	CTGC	2	8	1513906	1513913	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5119	NC_016641	TCG	2	6	1513958	1513963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_016641	TAT	2	6	1514045	1514050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_016641	ATA	2	6	1514208	1514213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_016641	TGC	2	6	1514288	1514293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_016641	AGG	3	9	1514298	1514306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_016641	TAG	2	6	1514344	1514349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_016641	GA	3	6	1514367	1514372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_016641	AACAG	2	10	1514375	1514384	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5127	NC_016641	GC	3	6	1515369	1515374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5128	NC_016641	A	6	6	1515435	1515440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_016641	T	6	6	1515460	1515465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_016641	AGT	2	6	1515930	1515935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5132	NC_016641	ATT	2	6	1516101	1516106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5153	NC_016641	TTAGC	2	10	1520025	1520034	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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5267	NC_016641	TCT	2	6	1548700	1548705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5269	NC_016641	GTT	2	6	1548809	1548814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5280	NC_016641	TA	3	6	1556422	1556427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5281	NC_016641	CGTT	2	8	1556432	1556439	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5390	NC_016641	AGCG	2	8	1586789	1586796	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5392	NC_016641	CTC	2	6	1587930	1587935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5398	NC_016641	TGC	2	6	1589877	1589882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5399	NC_016641	ACC	2	6	1590731	1590736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5400	NC_016641	ATA	2	6	1590744	1590749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5401	NC_016641	TTG	2	6	1590857	1590862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5402	NC_016641	TCTAT	2	10	1590935	1590944	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5403	NC_016641	GTT	2	6	1591077	1591082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5404	NC_016641	A	7	7	1591107	1591113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5405	NC_016641	CTTT	2	8	1591139	1591146	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5415	NC_016641	ACC	2	6	1597691	1597696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5423	NC_016641	A	7	7	1598222	1598228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5431	NC_016641	AT	3	6	1598538	1598543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5432	NC_016641	CCT	2	6	1598626	1598631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5433	NC_016641	TCT	2	6	1598647	1598652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5447	NC_016641	AACAA	2	10	1606173	1606182	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5450	NC_016641	TA	3	6	1606511	1606516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5451	NC_016641	TTA	2	6	1606526	1606531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5453	NC_016641	AGG	2	6	1606570	1606575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5459	NC_016641	A	8	8	1610473	1610480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5479	NC_016641	CAG	2	6	1611357	1611362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5482	NC_016641	GGC	2	6	1611422	1611427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5495	NC_016641	TAC	2	6	1612071	1612076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5496	NC_016641	AC	3	6	1612234	1612239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5497	NC_016641	CAC	2	6	1612249	1612254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5498	NC_016641	ACA	2	6	1612263	1612268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5499	NC_016641	AGCC	2	8	1612298	1612305	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5500	NC_016641	GAT	2	6	1612321	1612326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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