MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 plasmid pPECL-3

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016636	AGG	2	6	15	20	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016636	A	6	6	1482	1487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016636	AGA	2	6	1492	1497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016636	ATT	2	6	1576	1581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016636	TGG	2	6	1583	1588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016636	A	6	6	1624	1629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016636	CGAA	2	8	1707	1714	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_016636	T	6	6	1803	1808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016636	ATT	2	6	1812	1817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016636	TTA	2	6	2310	2315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016636	TTAT	2	8	2364	2371	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016636	TTTA	2	8	2447	2454	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016636	AT	3	6	2704	2709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016636	T	6	6	3348	3353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016636	A	6	6	3364	3369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016636	AT	4	8	3395	3402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016636	TTA	2	6	3418	3423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016636	TGT	2	6	5745	5750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016636	CCT	2	6	5813	5818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_016636	ATT	2	6	5824	5829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016636	AC	3	6	5844	5849	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016636	ATT	2	6	5907	5912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016636	A	6	6	5920	5925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016636	TA	3	6	5959	5964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016636	AATA	2	8	6067	6074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016636	ATC	2	6	6700	6705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016636	A	6	6	6724	6729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016636	TAA	2	6	6730	6735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016636	T	6	6	7372	7377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016636	GTT	2	6	7379	7384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016636	CTA	2	6	7426	7431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016636	TGG	2	6	7437	7442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016636	TCATT	2	10	7532	7541	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_016636	A	6	6	7557	7562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016636	GTT	2	6	7589	7594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016636	T	6	6	7593	7598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016636	ACA	2	6	7619	7624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016636	A	7	7	7649	7655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016636	CAAA	2	8	7679	7686	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016636	TTTC	2	8	7711	7718	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016636	TAAC	2	8	7742	7749	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016636	TTTAA	2	10	7764	7773	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016636	AAT	2	6	7780	7785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016636	CTG	2	6	8017	8022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016636	AT	4	8	8051	8058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016636	AACT	2	8	8142	8149	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_016636	T	6	6	8441	8446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016636	GTG	2	6	8470	8475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016636	TA	3	6	8481	8486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016636	TAGA	2	8	8563	8570	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016636	TAGA	2	8	8585	8592	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016636	TAGA	2	8	8607	8614	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016636	TAGA	2	8	8629	8636	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016636	TAGA	2	8	8651	8658	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016636	GTA	2	6	8664	8669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016636	TA	3	6	8671	8676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016636	AAAG	2	8	10215	10222	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016636	TTC	2	6	10307	10312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016636	ACC	2	6	10464	10469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_016636	A	6	6	10481	10486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016636	AG	3	6	10533	10538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016636	TAT	2	6	11476	11481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016636	T	6	6	11603	11608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016636	TAGA	2	8	11650	11657	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016636	AAC	2	6	11737	11742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016636	A	6	6	11743	11748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016636	GAC	2	6	11772	11777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016636	TCA	2	6	11789	11794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016636	A	6	6	11823	11828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016636	A	6	6	11839	11844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016636	GGT	2	6	12021	12026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016636	TGA	2	6	12050	12055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016636	GAT	2	6	12060	12065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016636	TTG	2	6	12120	12125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016636	GAT	2	6	12150	12155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016636	ATT	2	6	12247	12252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016636	ATTTC	2	10	12310	12319	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_016636	CTT	2	6	12359	12364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016636	ACA	2	6	12376	12381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016636	TCA	2	6	12392	12397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016636	TTG	2	6	12411	12416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016636	A	6	6	12426	12431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016636	TGTT	2	8	12448	12455	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016636	TATC	2	8	12511	12518	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_016636	CTG	2	6	14087	14092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016636	CCG	2	6	14096	14101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_016636	TTA	2	6	14115	14120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016636	GCC	2	6	14130	14135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_016636	GGC	2	6	14153	14158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016636	GTTC	2	8	14168	14175	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016636	CTT	2	6	14828	14833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016636	ACC	2	6	15473	15478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_016636	T	6	6	15525	15530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016636	CTG	2	6	16641	16646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016636	T	6	6	16663	16668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016636	GTT	2	6	16671	16676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016636	GAATG	2	10	16677	16686	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016636	T	6	6	16780	16785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016636	ATT	2	6	16872	16877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016636	CTG	2	6	17106	17111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016636	TTTTG	2	10	17123	17132	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016636	CTG	2	6	17162	17167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016636	TTA	2	6	17213	17218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016636	A	6	6	17371	17376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016636	AACG	2	8	17454	17461	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016636	GTG	2	6	17558	17563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016636	TA	3	6	17569	17574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016636	ACT	2	6	17804	17809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.