MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Pseudoxanthomonas spadix BD-a59 chromosome

Total Repeats: 9700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016147	GGGGT	2	10	1425844	1425853	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_016147	GGAGAA	2	12	1425966	1425977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_016147	GC	3	6	1427527	1427532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4004	NC_016147	CG	4	8	1427544	1427551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4005	NC_016147	CTG	2	6	1427575	1427580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_016147	CG	3	6	1427581	1427586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4007	NC_016147	CGGT	2	8	1427594	1427601	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4008	NC_016147	CGG	2	6	1427622	1427627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_016147	CCT	2	6	1428292	1428297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4010	NC_016147	AGGC	2	8	1428420	1428427	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4011	NC_016147	GC	3	6	1428426	1428431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4012	NC_016147	GC	3	6	1428436	1428441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4013	NC_016147	TTCT	2	8	1428462	1428469	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4014	NC_016147	CG	3	6	1429455	1429460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4015	NC_016147	GC	3	6	1429469	1429474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4016	NC_016147	GGC	2	6	1429476	1429481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_016147	TGC	2	6	1429496	1429501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_016147	TCAA	2	8	1430893	1430900	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4019	NC_016147	CG	3	6	1430912	1430917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4020	NC_016147	CGA	2	6	1430930	1430935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_016147	GAC	2	6	1430986	1430991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_016147	TGT	2	6	1431709	1431714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_016147	GCC	2	6	1431743	1431748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_016147	GCC	2	6	1431758	1431763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4025	NC_016147	CGT	2	6	1431782	1431787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_016147	CCGGC	2	10	1432506	1432515	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4027	NC_016147	GC	4	8	1432514	1432521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4028	NC_016147	GC	3	6	1432582	1432587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4029	NC_016147	CG	3	6	1432777	1432782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4030	NC_016147	GCTC	2	8	1433766	1433773	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4031	NC_016147	AGCC	2	8	1433802	1433809	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4032	NC_016147	GCC	2	6	1433815	1433820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_016147	GC	3	6	1433825	1433830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4034	NC_016147	GCG	3	9	1433911	1433919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4036	NC_016147	CGCCC	2	10	1433967	1433976	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
4037	NC_016147	C	7	7	1433989	1433995	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4038	NC_016147	GC	3	6	1433997	1434002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4039	NC_016147	GCC	2	6	1434995	1435000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4040	NC_016147	GCC	2	6	1435062	1435067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4041	NC_016147	CCGA	2	8	1435777	1435784	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4042	NC_016147	CGGG	2	8	1435801	1435808	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4043	NC_016147	CGT	2	6	1436045	1436050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4049	NC_016147	GCG	2	6	1436534	1436539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_016147	CGC	2	6	1436544	1436549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4052	NC_016147	GCG	2	6	1436618	1436623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4055	NC_016147	TGATT	2	10	1436997	1437006	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4059	NC_016147	ACCCA	2	10	1437792	1437801	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4060	NC_016147	GGGC	2	8	1437811	1437818	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4061	NC_016147	GCC	2	6	1437847	1437852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4062	NC_016147	GCC	2	6	1437887	1437892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4063	NC_016147	GCA	3	9	1437898	1437906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_016147	CGG	2	6	1437921	1437926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_016147	GCCG	2	8	1437933	1437940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4066	NC_016147	CAG	2	6	1437962	1437967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4070	NC_016147	T	7	7	1441547	1441553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_016147	CCG	2	6	1441619	1441624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4072	NC_016147	TAG	2	6	1441654	1441659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4078	NC_016147	AAT	2	6	1442045	1442050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_016147	GAT	2	6	1442092	1442097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4082	NC_016147	TA	4	8	1442366	1442373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_016147	GAT	2	6	1442432	1442437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_016147	AAG	2	6	1442492	1442497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4087	NC_016147	GC	3	6	1442551	1442556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4088	NC_016147	CT	3	6	1442560	1442565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_016147	GAT	2	6	1442584	1442589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4094	NC_016147	GGC	2	6	1442695	1442700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_016147	TAA	2	6	1442761	1442766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_016147	AGAA	2	8	1442784	1442791	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_016147	CTAG	2	8	1442815	1442822	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4098	NC_016147	AC	3	6	1442910	1442915	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4099	NC_016147	ATGC	2	8	1442982	1442989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4100	NC_016147	ATCC	2	8	1443000	1443007	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4101	NC_016147	CT	3	6	1443221	1443226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4102	NC_016147	T	6	6	1443318	1443323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_016147	G	6	6	1443351	1443356	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_016147	GAT	2	6	1443490	1443495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_016147	TGA	2	6	1443504	1443509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_016147	GC	3	6	1448434	1448439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4107	NC_016147	A	7	7	1448456	1448462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_016147	GC	3	6	1448515	1448520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4109	NC_016147	CAA	2	6	1450049	1450054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_016147	AGC	2	6	1450069	1450074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_016147	GTT	2	6	1450082	1450087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_016147	GCAG	2	8	1450095	1450102	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4113	NC_016147	GACG	2	8	1450177	1450184	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4114	NC_016147	TGGC	2	8	1450212	1450219	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4115	NC_016147	GGCCA	2	10	1453186	1453195	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4116	NC_016147	TGA	2	6	1453870	1453875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_016147	G	7	7	1453879	1453885	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_016147	GC	4	8	1453893	1453900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4119	NC_016147	GCG	2	6	1453918	1453923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_016147	CA	3	6	1455036	1455041	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4121	NC_016147	TGC	2	6	1455057	1455062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_016147	A	6	6	1455067	1455072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_016147	AGCC	2	8	1455080	1455087	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4124	NC_016147	GGCA	2	8	1455668	1455675	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4125	NC_016147	GTG	2	6	1455687	1455692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_016147	GGC	2	6	1455711	1455716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_016147	GCC	2	6	1455728	1455733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4128	NC_016147	T	9	9	1456200	1456208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_016147	AG	3	6	1456214	1456219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_016147	GC	4	8	1458574	1458581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4131	NC_016147	GCTG	2	8	1458588	1458595	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4132	NC_016147	TCG	2	6	1458616	1458621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_016147	CAGCG	2	10	1459931	1459940	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4134	NC_016147	G	7	7	1460000	1460006	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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4252	NC_016147	ATGG	2	8	1501466	1501473	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_016147	ATGG	2	8	1501509	1501516	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4259	NC_016147	ATGG	2	8	1501737	1501744	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4261	NC_016147	GCCT	2	8	1505180	1505187	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4262	NC_016147	TTGG	2	8	1505263	1505270	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4267	NC_016147	GC	3	6	1507991	1507996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4268	NC_016147	CGA	2	6	1508043	1508048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4269	NC_016147	CA	3	6	1508080	1508085	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4270	NC_016147	CGC	2	6	1509180	1509185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4271	NC_016147	GC	3	6	1509184	1509189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4272	NC_016147	GAT	2	6	1509274	1509279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4275	NC_016147	GCCGC	2	10	1509350	1509359	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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4281	NC_016147	GCC	2	6	1510662	1510667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4282	NC_016147	TCGA	2	8	1510696	1510703	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4289	NC_016147	CTC	2	6	1514325	1514330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4291	NC_016147	GCCA	2	8	1514390	1514397	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4292	NC_016147	CTG	2	6	1515173	1515178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4295	NC_016147	TGCCGT	4	24	1517807	1517830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4298	NC_016147	GC	3	6	1517892	1517897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4299	NC_016147	CGC	2	6	1517915	1517920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4301	NC_016147	GAG	2	6	1519623	1519628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4302	NC_016147	CAT	2	6	1520194	1520199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4304	NC_016147	CG	3	6	1521308	1521313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4305	NC_016147	GCGG	2	8	1521319	1521326	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4306	NC_016147	TGG	2	6	1521339	1521344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4316	NC_016147	CCG	2	6	1533311	1533316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4341	NC_016147	AGGC	2	8	1547790	1547797	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4342	NC_016147	CCGA	2	8	1547859	1547866	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4345	NC_016147	TCG	2	6	1550285	1550290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4355	NC_016147	GGCC	2	8	1550634	1550641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4376	NC_016147	GTA	2	6	1556695	1556700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4380	NC_016147	GGCCT	2	10	1556825	1556834	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4381	NC_016147	CTGC	2	8	1556854	1556861	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4382	NC_016147	TC	3	6	1559496	1559501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4383	NC_016147	GTC	2	6	1559504	1559509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4384	NC_016147	CGT	2	6	1561035	1561040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4385	NC_016147	GTC	2	6	1561048	1561053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4386	NC_016147	GCT	2	6	1561055	1561060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4387	NC_016147	CCT	2	6	1561096	1561101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4388	NC_016147	TGCC	2	8	1561105	1561112	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4389	NC_016147	GCCG	2	8	1561126	1561133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4390	NC_016147	CAG	2	6	1561142	1561147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4391	NC_016147	ACG	2	6	1561148	1561153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4392	NC_016147	GTC	2	6	1561765	1561770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4393	NC_016147	CAGC	2	8	1561791	1561798	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4394	NC_016147	T	6	6	1561807	1561812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4395	NC_016147	CG	3	6	1561854	1561859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4396	NC_016147	GAT	2	6	1561877	1561882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4398	NC_016147	TCGCT	2	10	1562962	1562971	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4399	NC_016147	CAGC	2	8	1563008	1563015	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4401	NC_016147	TGCT	2	8	1564315	1564322	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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