MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudoxanthomonas spadix BD-a59 chromosome

Total Repeats: 9700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016147	CCG	2	6	1056829	1056834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3002	NC_016147	GCC	2	6	1056887	1056892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_016147	GC	3	6	1056935	1056940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3004	NC_016147	CCGC	2	8	1056996	1057003	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3005	NC_016147	T	6	6	1062496	1062501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_016147	GCT	2	6	1062508	1062513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_016147	CTTT	2	8	1062570	1062577	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3008	NC_016147	AAAG	2	8	1062586	1062593	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_016147	AAG	2	6	1062601	1062606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_016147	CTGG	2	8	1062624	1062631	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3011	NC_016147	AC	3	6	1062635	1062640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3012	NC_016147	GGC	2	6	1062645	1062650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_016147	ACG	2	6	1062718	1062723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_016147	AGCCAA	2	12	1062809	1062820	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_016147	AGC	2	6	1062821	1062826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_016147	GGT	2	6	1062840	1062845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_016147	CAA	2	6	1062869	1062874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_016147	AGC	2	6	1062876	1062881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_016147	CGC	2	6	1062885	1062890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3020	NC_016147	GCTTT	2	10	1062905	1062914	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3021	NC_016147	TCTG	2	8	1062919	1062926	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3022	NC_016147	CGAT	2	8	1062948	1062955	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3023	NC_016147	CCGGA	2	10	1063896	1063905	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3024	NC_016147	GC	3	6	1063936	1063941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3025	NC_016147	AGC	2	6	1063945	1063950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_016147	GCG	2	6	1064022	1064027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_016147	CGC	2	6	1064053	1064058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3028	NC_016147	CCCA	2	8	1064069	1064076	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3029	NC_016147	CAT	2	6	1064894	1064899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_016147	CA	3	6	1068037	1068042	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3031	NC_016147	GCAT	2	8	1068044	1068051	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3032	NC_016147	CGG	2	6	1068123	1068128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_016147	GGC	2	6	1070114	1070119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_016147	CG	4	8	1070138	1070145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3035	NC_016147	CGC	2	6	1070271	1070276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3036	NC_016147	GCG	2	6	1070281	1070286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_016147	CGGCC	2	10	1070364	1070373	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3038	NC_016147	AGC	2	6	1070507	1070512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_016147	TGG	2	6	1070524	1070529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_016147	GTG	2	6	1070586	1070591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_016147	AAG	2	6	1070601	1070606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_016147	CGG	2	6	1070607	1070612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_016147	TCCTGG	2	12	1070678	1070689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_016147	GGGC	2	8	1072774	1072781	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3045	NC_016147	GC	3	6	1072786	1072791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3046	NC_016147	TCC	2	6	1073193	1073198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3047	NC_016147	CGC	2	6	1073199	1073204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3048	NC_016147	GCG	2	6	1073225	1073230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_016147	GCTC	2	8	1073246	1073253	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3050	NC_016147	GTC	2	6	1073255	1073260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_016147	GCG	2	6	1073331	1073336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_016147	CTC	2	6	1076177	1076182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3053	NC_016147	TCG	2	6	1078129	1078134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_016147	CTT	2	6	1078202	1078207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_016147	TGC	2	6	1078311	1078316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_016147	GC	4	8	1078359	1078366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3057	NC_016147	GCG	2	6	1078529	1078534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_016147	CG	4	8	1078539	1078546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3059	NC_016147	CCG	2	6	1078550	1078555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3060	NC_016147	CGG	2	6	1078566	1078571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_016147	CCGC	2	8	1078572	1078579	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3062	NC_016147	TCG	2	6	1078610	1078615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_016147	GC	3	6	1078631	1078636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3064	NC_016147	GGT	2	6	1078664	1078669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_016147	CCGGC	2	10	1078723	1078732	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3066	NC_016147	TCC	2	6	1078752	1078757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3067	NC_016147	CGC	2	6	1078758	1078763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3068	NC_016147	CATCG	2	10	1078768	1078777	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3069	NC_016147	GCGG	2	8	1078780	1078787	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3070	NC_016147	TCT	2	6	1079567	1079572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_016147	GCG	2	6	1079950	1079955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_016147	AC	6	12	1080112	1080123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_016147	CGG	2	6	1082176	1082181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_016147	CGCC	2	8	1082215	1082222	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3075	NC_016147	A	6	6	1082281	1082286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_016147	GCG	2	6	1082287	1082292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_016147	CGC	2	6	1082307	1082312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3078	NC_016147	CGA	2	6	1084481	1084486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_016147	CGC	2	6	1084567	1084572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3080	NC_016147	GC	3	6	1084571	1084576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3081	NC_016147	GC	3	6	1086254	1086259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3082	NC_016147	TGG	2	6	1086282	1086287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_016147	GC	3	6	1087972	1087977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3084	NC_016147	GGT	2	6	1087988	1087993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_016147	GCC	2	6	1088010	1088015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3086	NC_016147	AGGC	2	8	1089102	1089109	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3087	NC_016147	CCCTCG	2	12	1089133	1089144	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3088	NC_016147	CTCC	2	8	1089174	1089181	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3089	NC_016147	AGGGG	2	10	1089196	1089205	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_016147	GC	3	6	1091573	1091578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3091	NC_016147	GGT	2	6	1091587	1091592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_016147	CCGCGG	2	12	1091603	1091614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3093	NC_016147	CGA	2	6	1091631	1091636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_016147	TCT	2	6	1091640	1091645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_016147	CCA	2	6	1091874	1091879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3096	NC_016147	GCC	2	6	1091914	1091919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3097	NC_016147	CGC	2	6	1091944	1091949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3098	NC_016147	CCTGG	2	10	1091972	1091981	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3099	NC_016147	CAC	2	6	1091992	1091997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3100	NC_016147	ACC	3	9	1092005	1092013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3101	NC_016147	ACC	2	6	1092060	1092065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3102	NC_016147	GC	3	6	1092109	1092114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3103	NC_016147	GCA	3	9	1095600	1095608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_016147	CGC	2	6	1095619	1095624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3105	NC_016147	GGCCT	2	10	1095688	1095697	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3106	NC_016147	CGG	2	6	1097033	1097038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_016147	ATC	2	6	1097084	1097089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_016147	GCC	2	6	1097090	1097095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3109	NC_016147	GTC	2	6	1097116	1097121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_016147	CGC	2	6	1101184	1101189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3111	NC_016147	CGCGG	2	10	1101258	1101267	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3112	NC_016147	GCCG	2	8	1101268	1101275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3113	NC_016147	GCC	2	6	1101291	1101296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3114	NC_016147	GGC	2	6	1101954	1101959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_016147	TGC	2	6	1101964	1101969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_016147	GCA	2	6	1101973	1101978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_016147	TTCC	2	8	1102000	1102007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3118	NC_016147	GTG	2	6	1102050	1102055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_016147	ACCCG	2	10	1102075	1102084	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3120	NC_016147	ATG	2	6	1102118	1102123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_016147	CCG	2	6	1102139	1102144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3122	NC_016147	CTTC	2	8	1102159	1102166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3123	NC_016147	GAC	2	6	1102178	1102183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_016147	GGCC	2	8	1103389	1103396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3125	NC_016147	CCG	2	6	1103403	1103408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3126	NC_016147	GCA	2	6	1103451	1103456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_016147	CG	4	8	1103466	1103473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3128	NC_016147	CGC	2	6	1103500	1103505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3129	NC_016147	GCG	2	6	1103508	1103513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_016147	GC	3	6	1103519	1103524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3131	NC_016147	CG	3	6	1104373	1104378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3132	NC_016147	CTC	2	6	1104379	1104384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3133	NC_016147	CGG	2	6	1104417	1104422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_016147	GCGG	2	8	1104425	1104432	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3135	NC_016147	CTG	2	6	1104827	1104832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3140	NC_016147	TGG	2	6	1107520	1107525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3141	NC_016147	GCC	2	6	1107534	1107539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3142	NC_016147	GCTG	2	8	1108637	1108644	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3143	NC_016147	TGC	2	6	1110803	1110808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3147	NC_016147	GC	3	6	1112131	1112136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3151	NC_016147	GGC	2	6	1114715	1114720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3153	NC_016147	CG	3	6	1114782	1114787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3165	NC_016147	GCG	2	6	1118327	1118332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3171	NC_016147	CG	4	8	1119625	1119632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3172	NC_016147	GCTA	2	8	1120841	1120848	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3175	NC_016147	CGGCG	2	10	1122129	1122138	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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3212	NC_016147	TGCA	2	8	1131512	1131519	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3248	NC_016147	GAT	2	6	1146644	1146649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_016147	GCAT	2	8	1146664	1146671	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3250	NC_016147	GC	3	6	1146698	1146703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3251	NC_016147	G	6	6	1146765	1146770	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_016147	C	6	6	1146786	1146791	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3253	NC_016147	CGAT	2	8	1146816	1146823	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3254	NC_016147	ACGC	2	8	1146854	1146861	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3255	NC_016147	GTG	2	6	1146862	1146867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3256	NC_016147	CGC	2	6	1148145	1148150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3257	NC_016147	T	8	8	1148169	1148176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3258	NC_016147	TACG	2	8	1148184	1148191	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3259	NC_016147	GAG	2	6	1148212	1148217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3260	NC_016147	CGC	2	6	1149819	1149824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3261	NC_016147	CGG	2	6	1149854	1149859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3262	NC_016147	CCA	2	6	1149860	1149865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3263	NC_016147	CCCGGC	2	12	1149873	1149884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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