MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Pseudoxanthomonas spadix BD-a59 chromosome

Total Repeats: 9700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_016147	GAA	2	6	2191239	2191244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_016147	CGC	2	6	2191257	2191262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_016147	GCA	3	9	2191268	2191276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_016147	GCACG	2	10	2191287	2191296	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6006	NC_016147	CAG	3	9	2191298	2191306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_016147	AGCA	2	8	2191315	2191322	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6008	NC_016147	AGC	2	6	2192101	2192106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_016147	GC	3	6	2192545	2192550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6010	NC_016147	T	6	6	2192608	2192613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_016147	CTG	2	6	2192685	2192690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_016147	CGC	2	6	2193341	2193346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_016147	GCC	2	6	2193352	2193357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6014	NC_016147	CAT	2	6	2193391	2193396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_016147	CG	3	6	2193405	2193410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6016	NC_016147	CGG	2	6	2193413	2193418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_016147	GCC	2	6	2193421	2193426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6018	NC_016147	CGCGG	2	10	2195203	2195212	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6019	NC_016147	GCG	2	6	2195241	2195246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_016147	CGCAG	2	10	2195265	2195274	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6021	NC_016147	ACCGC	2	10	2195277	2195286	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6022	NC_016147	GC	3	6	2195308	2195313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6023	NC_016147	GCC	2	6	2195356	2195361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6024	NC_016147	CGC	2	6	2195399	2195404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6031	NC_016147	GCG	2	6	2199439	2199444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_016147	GGAAT	2	10	2199507	2199516	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_016147	AGAAC	2	10	2200351	2200360	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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6043	NC_016147	GC	3	6	2201261	2201266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6044	NC_016147	A	6	6	2201372	2201377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6048	NC_016147	CG	3	6	2201445	2201450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_016147	CG	3	6	2201468	2201473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6050	NC_016147	GGC	2	6	2203343	2203348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_016147	CGGC	3	12	2203359	2203370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6053	NC_016147	GCGCG	2	10	2203445	2203454	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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6061	NC_016147	GC	3	6	2209008	2209013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6062	NC_016147	CCGG	2	8	2209411	2209418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6063	NC_016147	T	6	6	2209461	2209466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6081	NC_016147	G	7	7	2219398	2219404	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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6100	NC_016147	CG	3	6	2220831	2220836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6106	NC_016147	A	6	6	2221832	2221837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_016147	T	6	6	2221856	2221861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6128	NC_016147	GCA	2	6	2228736	2228741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6130	NC_016147	GGCA	2	8	2228837	2228844	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6131	NC_016147	CT	3	6	2228856	2228861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6132	NC_016147	CTG	2	6	2228887	2228892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6133	NC_016147	CGG	2	6	2228912	2228917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6134	NC_016147	CGC	2	6	2229309	2229314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6135	NC_016147	AGGT	2	8	2229337	2229344	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6136	NC_016147	CCGGGC	2	12	2229365	2229376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6137	NC_016147	CAG	2	6	2229387	2229392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6138	NC_016147	TGC	2	6	2229669	2229674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6139	NC_016147	CGC	2	6	2229678	2229683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6140	NC_016147	GCA	2	6	2229694	2229699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6141	NC_016147	ACC	2	6	2229708	2229713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6142	NC_016147	CGC	2	6	2229714	2229719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6143	NC_016147	CCT	2	6	2229796	2229801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6144	NC_016147	GCG	2	6	2230934	2230939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6145	NC_016147	CTG	2	6	2232367	2232372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6146	NC_016147	GAA	2	6	2232374	2232379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6147	NC_016147	GCG	2	6	2232513	2232518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6148	NC_016147	CAGG	2	8	2232530	2232537	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6149	NC_016147	GGCA	2	8	2232546	2232553	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6150	NC_016147	TGC	2	6	2232596	2232601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6151	NC_016147	CCG	2	6	2232606	2232611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6152	NC_016147	GTG	2	6	2233014	2233019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6153	NC_016147	CGGCG	2	10	2233062	2233071	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6154	NC_016147	CG	3	6	2233070	2233075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6155	NC_016147	TGT	2	6	2234483	2234488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6156	NC_016147	TTGA	2	8	2234495	2234502	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6157	NC_016147	GC	4	8	2234507	2234514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6158	NC_016147	GC	3	6	2234520	2234525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6159	NC_016147	GCGA	2	8	2235131	2235138	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6160	NC_016147	CCA	2	6	2235220	2235225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6161	NC_016147	C	6	6	2235234	2235239	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6162	NC_016147	TCT	2	6	2235258	2235263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6163	NC_016147	CAAG	2	8	2235330	2235337	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6164	NC_016147	GGGCCC	2	12	2235435	2235446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6165	NC_016147	CG	4	8	2236945	2236952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6166	NC_016147	GGCCGG	2	12	2240886	2240897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6167	NC_016147	GC	8	16	2243328	2243343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6168	NC_016147	CGCGA	2	10	2244153	2244162	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6169	NC_016147	GC	3	6	2244180	2244185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6170	NC_016147	GCG	2	6	2244298	2244303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6171	NC_016147	AC	3	6	2244351	2244356	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6172	NC_016147	GA	4	8	2244385	2244392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6173	NC_016147	GCC	2	6	2247477	2247482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6174	NC_016147	GGC	2	6	2247487	2247492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6175	NC_016147	CTTT	2	8	2247494	2247501	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6176	NC_016147	CGG	2	6	2247527	2247532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6178	NC_016147	GCCA	2	8	2250724	2250731	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6181	NC_016147	CTGCC	2	10	2252322	2252331	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6182	NC_016147	AGATG	2	10	2252384	2252393	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6183	NC_016147	GTG	2	6	2252478	2252483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6184	NC_016147	GTG	2	6	2252550	2252555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6185	NC_016147	GTG	2	6	2252622	2252627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6186	NC_016147	GTG	2	6	2252694	2252699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6187	NC_016147	GTT	11	33	2252768	2252800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6190	NC_016147	GCCT	2	8	2254537	2254544	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6191	NC_016147	GGC	2	6	2257222	2257227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6194	NC_016147	G	6	6	2257979	2257984	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6195	NC_016147	CCG	3	9	2258012	2258020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6200	NC_016147	CGG	2	6	2258989	2258994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6213	NC_016147	C	7	7	2265069	2265075	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6214	NC_016147	CTGC	2	8	2265102	2265109	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6216	NC_016147	GTTG	2	8	2265199	2265206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6219	NC_016147	CCA	2	6	2269713	2269718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6220	NC_016147	CAAAG	2	10	2270473	2270482	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6221	NC_016147	GGCTG	2	10	2270483	2270492	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6222	NC_016147	A	6	6	2270542	2270547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6223	NC_016147	CCT	2	6	2270564	2270569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6225	NC_016147	GCT	2	6	2271095	2271100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6234	NC_016147	TTC	2	6	2271555	2271560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6238	NC_016147	A	6	6	2271632	2271637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6239	NC_016147	ATA	2	6	2271645	2271650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6240	NC_016147	GTTC	2	8	2271670	2271677	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6241	NC_016147	A	7	7	2271702	2271708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6242	NC_016147	TCC	2	6	2271739	2271744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6243	NC_016147	TGT	2	6	2271844	2271849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6244	NC_016147	CATC	2	8	2271878	2271885	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6245	NC_016147	GGC	2	6	2271912	2271917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6246	NC_016147	GCG	2	6	2271962	2271967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6247	NC_016147	CCA	2	6	2271976	2271981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6248	NC_016147	CAT	2	6	2272070	2272075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6249	NC_016147	CAG	2	6	2272109	2272114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6250	NC_016147	GTC	2	6	2272133	2272138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6251	NC_016147	CAG	2	6	2272172	2272177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6252	NC_016147	ATT	2	6	2272196	2272201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6253	NC_016147	GC	3	6	2272347	2272352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6254	NC_016147	CAA	2	6	2272432	2272437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6255	NC_016147	CTG	2	6	2272450	2272455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6256	NC_016147	CGT	2	6	2272458	2272463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6257	NC_016147	CAG	2	6	2272468	2272473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6258	NC_016147	GTAT	2	8	2272479	2272486	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6259	NC_016147	CGG	3	9	2272498	2272506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6260	NC_016147	CGCC	2	8	2272507	2272514	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6261	NC_016147	CCG	2	6	2272527	2272532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6262	NC_016147	GTC	2	6	2272544	2272549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6263	NC_016147	CAC	2	6	2272584	2272589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6264	NC_016147	CAC	2	6	2272603	2272608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6265	NC_016147	AAAT	2	8	2272726	2272733	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6266	NC_016147	A	7	7	2272738	2272744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6267	NC_016147	TAAT	2	8	2272754	2272761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6390	NC_016147	CTT	2	6	2309762	2309767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6391	NC_016147	TG	4	8	2309776	2309783	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6392	NC_016147	GCA	2	6	2309787	2309792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6393	NC_016147	A	7	7	2309792	2309798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6396	NC_016147	AGC	2	6	2312745	2312750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6397	NC_016147	CGG	2	6	2312770	2312775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6398	NC_016147	GCA	2	6	2312804	2312809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6399	NC_016147	GGC	2	6	2314684	2314689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6400	NC_016147	GCG	2	6	2314696	2314701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6401	NC_016147	CGT	2	6	2314711	2314716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6402	NC_016147	GCT	2	6	2314741	2314746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6428	NC_016147	GCC	2	6	2328670	2328675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6430	NC_016147	GGCC	2	8	2328761	2328768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6434	NC_016147	CAGGC	2	10	2329928	2329937	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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6437	NC_016147	GC	3	6	2329970	2329975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6438	NC_016147	CCG	2	6	2330206	2330211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6445	NC_016147	AGCTT	2	10	2338276	2338285	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6446	NC_016147	CG	3	6	2338287	2338292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6459	NC_016147	TCGA	2	8	2341657	2341664	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6466	NC_016147	ACG	2	6	2342186	2342191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6470	NC_016147	CACCG	2	10	2342265	2342274	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6471	NC_016147	TCGA	2	8	2342325	2342332	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6472	NC_016147	CGA	2	6	2342353	2342358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6475	NC_016147	CGG	2	6	2342451	2342456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6493	NC_016147	TCG	2	6	2345090	2345095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6497	NC_016147	T	7	7	2355156	2355162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6498	NC_016147	CTATCC	2	12	2355202	2355213	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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