MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudoxanthomonas spadix BD-a59 chromosome

Total Repeats: 9700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016147	CCGCC	2	10	1972332	1972341	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
5502	NC_016147	GCCA	2	8	1972354	1972361	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5503	NC_016147	CACC	2	8	1973891	1973898	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5504	NC_016147	CCT	2	6	1974262	1974267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5505	NC_016147	CCG	2	6	1974336	1974341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5506	NC_016147	AGT	2	6	1974424	1974429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_016147	TCT	2	6	1974447	1974452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_016147	GTC	2	6	1974485	1974490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_016147	TGA	2	6	1974589	1974594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_016147	GCA	2	6	1974597	1974602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_016147	TGC	2	6	1974606	1974611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_016147	CGG	2	6	1977305	1977310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_016147	TGA	2	6	1977366	1977371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_016147	GAA	2	6	1977390	1977395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_016147	CTT	2	6	1977463	1977468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_016147	TGCGC	2	10	1977469	1977478	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5517	NC_016147	GCTG	2	8	1977538	1977545	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5518	NC_016147	ATTG	2	8	1977572	1977579	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_016147	CG	3	6	1977640	1977645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5520	NC_016147	GGC	2	6	1977668	1977673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_016147	GCGG	2	8	1977718	1977725	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5522	NC_016147	AGC	2	6	1977748	1977753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_016147	TCG	2	6	1977765	1977770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_016147	AG	3	6	1977775	1977780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_016147	GC	3	6	1977783	1977788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5526	NC_016147	GC	3	6	1977927	1977932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5527	NC_016147	TGG	2	6	1977940	1977945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5529	NC_016147	CGC	2	6	1978312	1978317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5531	NC_016147	TGC	2	6	1978489	1978494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_016147	CCT	2	6	1978543	1978548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5533	NC_016147	GC	3	6	1978582	1978587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5534	NC_016147	AGC	2	6	1978612	1978617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_016147	CGC	2	6	1978624	1978629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5536	NC_016147	GCC	2	6	1978653	1978658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5537	NC_016147	AAG	2	6	1979656	1979661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_016147	GC	3	6	1979670	1979675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5539	NC_016147	TGC	2	6	1979681	1979686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_016147	CCCTG	2	10	1979698	1979707	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5541	NC_016147	CGCTC	2	10	1979750	1979759	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5542	NC_016147	GC	3	6	1979797	1979802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5543	NC_016147	TGCG	2	8	1979809	1979816	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5544	NC_016147	TCA	2	6	1979865	1979870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_016147	GC	3	6	1979911	1979916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5546	NC_016147	CCT	2	6	1979966	1979971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5547	NC_016147	TTC	2	6	1980050	1980055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_016147	TTC	2	6	1980115	1980120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_016147	GGCAGG	2	12	1980983	1980994	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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5551	NC_016147	TC	3	6	1981012	1981017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5552	NC_016147	GCT	2	6	1981018	1981023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_016147	CAG	2	6	1983390	1983395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_016147	GCC	3	9	1983408	1983416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5555	NC_016147	G	6	6	1983422	1983427	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_016147	CGG	2	6	1983431	1983436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_016147	GC	3	6	1983467	1983472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5558	NC_016147	TTG	2	6	1983579	1983584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5560	NC_016147	AC	3	6	1983736	1983741	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5561	NC_016147	CCA	2	6	1983866	1983871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5562	NC_016147	GAA	2	6	1983923	1983928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_016147	CG	3	6	1983971	1983976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5564	NC_016147	GCC	2	6	1984015	1984020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5565	NC_016147	GCG	2	6	1984096	1984101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_016147	GC	3	6	1984104	1984109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5567	NC_016147	CGC	2	6	1984148	1984153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5568	NC_016147	CGGCC	2	10	1984200	1984209	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5569	NC_016147	CGC	2	6	1984217	1984222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5573	NC_016147	CCCG	2	8	1984340	1984347	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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5575	NC_016147	CGGG	2	8	1984470	1984477	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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5578	NC_016147	CAGC	2	8	1984687	1984694	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5579	NC_016147	GCCG	2	8	1984704	1984711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5582	NC_016147	CCCG	2	8	1985094	1985101	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5583	NC_016147	TCAT	2	8	1985470	1985477	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5584	NC_016147	T	6	6	1985491	1985496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5598	NC_016147	ACGGC	2	10	1988616	1988625	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5599	NC_016147	GGCA	2	8	1988642	1988649	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5600	NC_016147	TCG	2	6	1990770	1990775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_016147	GCC	2	6	1990804	1990809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5602	NC_016147	GTC	2	6	1990812	1990817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_016147	CGG	2	6	1990843	1990848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_016147	GCTG	2	8	1990849	1990856	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5605	NC_016147	AGC	2	6	1990859	1990864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_016147	GCCGC	2	10	1990865	1990874	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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5608	NC_016147	GCC	2	6	1990945	1990950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5609	NC_016147	CGC	2	6	1990997	1991002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5615	NC_016147	ATC	3	9	1994211	1994219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5617	NC_016147	CGC	2	6	1994334	1994339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5619	NC_016147	ACGC	2	8	1994410	1994417	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5620	NC_016147	TGTCCA	2	12	1994479	1994490	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5623	NC_016147	TC	3	6	1996652	1996657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5631	NC_016147	TTC	2	6	1998639	1998644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5633	NC_016147	TGC	2	6	1998729	1998734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5892	NC_016147	C	10	10	2131340	2131349	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5897	NC_016147	CG	3	6	2133228	2133233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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