MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pyrolobus fumarii 1A chromosome

Total Repeats: 5115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015931	GTG	2	6	38	43	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015931	CCGG	2	8	46	53	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015931	GCC	2	6	152	157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_015931	AGC	2	6	5017	5022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015931	G	6	6	6150	6155	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015931	TCG	2	6	6204	6209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015931	CCG	2	6	8334	8339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_015931	C	6	6	8352	8357	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_015931	TTG	2	6	9376	9381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015931	CTA	2	6	10134	10139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015931	ACA	2	6	12618	12623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015931	GAG	2	6	12636	12641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015931	ACC	2	6	12953	12958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_015931	ACC	2	6	14148	14153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_015931	AG	3	6	14178	14183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015931	GCC	2	6	15513	15518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_015931	TAC	2	6	15539	15544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015931	ACGG	2	8	15589	15596	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015931	ATACA	2	10	15597	15606	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015931	TAG	2	6	17489	17494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015931	CCG	2	6	17497	17502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_015931	AGA	2	6	17924	17929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015931	TGTTT	2	10	18315	18324	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015931	G	6	6	19371	19376	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015931	CAC	2	6	19741	19746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_015931	CGC	2	6	19788	19793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_015931	TAC	2	6	19807	19812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015931	CCG	2	6	19825	19830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_015931	C	6	6	19854	19859	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_015931	AGT	2	6	19870	19875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015931	TCA	2	6	24552	24557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015931	GCG	2	6	24574	24579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015931	TTGC	2	8	25983	25990	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015931	CTAGG	2	10	28122	28131	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_015931	CCG	2	6	32210	32215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_015931	ACA	2	6	32570	32575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015931	TCA	2	6	32591	32596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015931	CT	3	6	33808	33813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015931	GCC	2	6	34913	34918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_015931	AT	3	6	34932	34937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015931	CGC	2	6	36102	36107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_015931	CGC	2	6	36674	36679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_015931	AGT	2	6	36711	36716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015931	CG	3	6	40648	40653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015931	GTG	2	6	40706	40711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015931	GT	3	6	40745	40750	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015931	CCT	2	6	42228	42233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_015931	CCT	2	6	42252	42257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_015931	TCG	2	6	42317	42322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015931	ATT	2	6	42344	42349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015931	CCT	2	6	42364	42369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_015931	CT	3	6	42401	42406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015931	TGA	2	6	42471	42476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015931	AGT	2	6	42486	42491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015931	CGGG	2	8	43719	43726	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015931	CCATTT	2	12	45971	45982	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015931	CTG	2	6	46068	46073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015931	GCG	2	6	46119	46124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015931	CGGC	2	8	46158	46165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015931	CCT	3	9	46175	46183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_015931	ACA	2	6	48626	48631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015931	AAG	2	6	48638	48643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015931	CAG	2	6	48648	48653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015931	CAC	2	6	48658	48663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_015931	GAA	2	6	48672	48677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015931	CAAAAA	2	12	48702	48713	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_015931	CT	3	6	48730	48735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015931	GGT	2	6	49767	49772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015931	TCCC	2	8	52059	52066	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_015931	CTACCT	2	12	53380	53391	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015931	CGCGG	2	10	53407	53416	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
72	NC_015931	A	6	6	55593	55598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015931	GAG	2	6	55631	55636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015931	TC	3	6	57281	57286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015931	GCC	2	6	57291	57296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_015931	GTA	2	6	57307	57312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015931	GGC	2	6	57345	57350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015931	GGCG	2	8	57363	57370	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015931	GAA	2	6	57387	57392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015931	C	6	6	57400	57405	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
81	NC_015931	GCC	2	6	57408	57413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_015931	GGC	2	6	58653	58658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015931	TA	3	6	59491	59496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015931	CAG	2	6	59498	59503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015931	AATA	2	8	59539	59546	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015931	TGC	2	6	59556	59561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015931	GT	3	6	60074	60079	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015931	CCG	2	6	60944	60949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_015931	ATC	2	6	60978	60983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015931	TCA	2	6	61011	61016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015931	CAC	2	6	61017	61022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_015931	GGCGG	2	10	61077	61086	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
93	NC_015931	CCA	2	6	61632	61637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_015931	GAG	2	6	61665	61670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015931	CT	3	6	61703	61708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015931	TCA	2	6	61764	61769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015931	CG	3	6	65361	65366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015931	CGG	2	6	66188	66193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015931	CGA	2	6	66204	66209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015931	AGG	2	6	66212	66217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015931	AGCC	2	8	67669	67676	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015931	TCA	2	6	67682	67687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015931	CAG	2	6	67700	67705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015931	GGGC	2	8	67717	67724	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015931	GCC	2	6	67732	67737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_015931	GGAT	3	12	67749	67760	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015931	GCG	2	6	67814	67819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015931	AGG	2	6	67832	67837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015931	GAG	2	6	69873	69878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015931	ACACG	2	10	71349	71358	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_015931	CCT	2	6	72191	72196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_015931	GAG	2	6	73783	73788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015931	C	6	6	73812	73817	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
114	NC_015931	GTA	2	6	73867	73872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015931	CCA	2	6	75599	75604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_015931	ATT	2	6	76718	76723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015931	TAC	2	6	76921	76926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015931	CACC	2	8	77279	77286	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_015931	GTA	2	6	79647	79652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015931	CAC	2	6	79714	79719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_015931	CAC	2	6	79738	79743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_015931	CAC	2	6	79777	79782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_015931	CTTG	2	8	79789	79796	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015931	GCCT	2	8	79832	79839	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015931	ACC	2	6	80728	80733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_015931	ATAC	2	8	80739	80746	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015931	ACT	2	6	80755	80760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015931	ACCA	2	8	80791	80798	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015931	CA	3	6	80817	80822	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015931	CA	3	6	80855	80860	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015931	CAA	2	6	80875	80880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015931	A	12	12	80887	80898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015931	TAC	2	6	80954	80959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015931	AG	3	6	81006	81011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015931	AAACC	2	10	81053	81062	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_015931	GA	3	6	81121	81126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015931	ACG	2	6	81131	81136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015931	GAG	2	6	81147	81152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015931	GAA	2	6	81172	81177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015931	GAA	2	6	81185	81190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015931	TGG	2	6	81219	81224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015931	CGG	2	6	81271	81276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015931	GCCC	2	8	81301	81308	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
144	NC_015931	GCG	2	6	81347	81352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_015931	TCT	2	6	81414	81419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_015931	GGC	2	6	81453	81458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_015931	CTGCC	2	10	81531	81540	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
148	NC_015931	GGC	2	6	81606	81611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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153	NC_015931	CGA	2	6	81780	81785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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155	NC_015931	CCGG	2	8	81867	81874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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180	NC_015931	GCCC	2	8	83085	83092	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
181	NC_015931	CGG	2	6	83102	83107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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185	NC_015931	CGG	2	6	83332	83337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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189	NC_015931	CGG	2	6	83448	83453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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255	NC_015931	GGGC	2	8	86444	86451	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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270	NC_015931	GC	3	6	86845	86850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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275	NC_015931	C	6	6	86905	86910	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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279	NC_015931	G	7	7	86981	86987	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
280	NC_015931	GGT	2	6	87001	87006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
281	NC_015931	GCT	2	6	87054	87059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_015931	TCCTC	2	10	87097	87106	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
283	NC_015931	AGC	2	6	87129	87134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_015931	TGT	3	9	87151	87159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
285	NC_015931	TTC	2	6	87174	87179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_015931	TGT	2	6	87185	87190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_015931	GCTG	2	8	87227	87234	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
288	NC_015931	CCG	2	6	87241	87246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
289	NC_015931	CTC	2	6	87281	87286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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291	NC_015931	TGGGT	2	10	87369	87378	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
292	NC_015931	GGT	2	6	87388	87393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
293	NC_015931	CGC	2	6	87403	87408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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413	NC_015931	TAT	2	6	129495	129500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
414	NC_015931	GTGA	2	8	129537	129544	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
415	NC_015931	CCCGA	2	10	130691	130700	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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417	NC_015931	TGA	2	6	130740	130745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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419	NC_015931	TGAG	2	8	130766	130773	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
420	NC_015931	TCACA	2	10	131911	131920	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
421	NC_015931	CAC	2	6	132628	132633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
422	NC_015931	CG	3	6	132640	132645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
423	NC_015931	TA	3	6	132652	132657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_015931	CCGGC	2	10	133145	133154	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
425	NC_015931	CGG	2	6	133353	133358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
426	NC_015931	CGC	2	6	136692	136697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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428	NC_015931	ACCT	2	8	138316	138323	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
429	NC_015931	TAA	2	6	138324	138329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_015931	CGCC	2	8	138474	138481	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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