MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 15562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015733	CGG	2	6	1739609	1739614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_015733	TCG	2	6	1739678	1739683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_015733	TGA	2	6	1739689	1739694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_015733	GCATG	2	10	1739736	1739745	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4005	NC_015733	AGG	2	6	1739747	1739752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_015733	CCA	2	6	1739777	1739782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4007	NC_015733	CGG	2	6	1739863	1739868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_015733	ATT	2	6	1739940	1739945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_015733	CGAC	2	8	1739985	1739992	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4010	NC_015733	GGC	2	6	1739995	1740000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_015733	A	6	6	1740018	1740023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_015733	TAT	2	6	1740024	1740029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_015733	AAT	2	6	1740033	1740038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_015733	ATC	2	6	1740045	1740050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_015733	GC	3	6	1741528	1741533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4016	NC_015733	CCG	2	6	1742123	1742128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4017	NC_015733	TG	3	6	1743165	1743170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_015733	T	7	7	1743217	1743223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_015733	GCC	2	6	1743246	1743251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4020	NC_015733	AGGC	2	8	1743252	1743259	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4021	NC_015733	T	6	6	1744603	1744608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_015733	C	6	6	1744614	1744619	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4023	NC_015733	ACTT	2	8	1744683	1744690	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4024	NC_015733	GAC	2	6	1748602	1748607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_015733	TGA	2	6	1749604	1749609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_015733	TCG	2	6	1751079	1751084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_015733	GCA	2	6	1751817	1751822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_015733	TC	3	6	1753747	1753752	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4029	NC_015733	GGC	2	6	1753778	1753783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_015733	T	7	7	1754966	1754972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_015733	ATCC	2	8	1754980	1754987	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4032	NC_015733	CGGC	2	8	1754988	1754995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_015733	GCTTTC	2	12	1755009	1755020	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_015733	GC	3	6	1755035	1755040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4035	NC_015733	GCC	2	6	1755053	1755058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4036	NC_015733	GAAT	2	8	1755064	1755071	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_015733	A	6	6	1755231	1755236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_015733	CAT	2	6	1755248	1755253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_015733	CCAT	2	8	1755323	1755330	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4040	NC_015733	CCTC	2	8	1755367	1755374	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4041	NC_015733	CCT	2	6	1755393	1755398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4042	NC_015733	AAGATC	2	12	1755408	1755419	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4043	NC_015733	CAAGAG	3	18	1755431	1755448	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4044	NC_015733	GCGCA	3	15	1755451	1755465	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4045	NC_015733	GCC	2	6	1755515	1755520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4046	NC_015733	C	6	6	1755519	1755524	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4047	NC_015733	AC	3	6	1755555	1755560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4048	NC_015733	GGCC	2	8	1759364	1759371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4049	NC_015733	CA	3	6	1759405	1759410	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4050	NC_015733	GGCT	2	8	1761106	1761113	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4051	NC_015733	GC	3	6	1761114	1761119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4052	NC_015733	GCC	2	6	1761153	1761158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4053	NC_015733	GGC	2	6	1761168	1761173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_015733	AACAC	2	10	1761174	1761183	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4055	NC_015733	GGTGG	2	10	1761190	1761199	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_015733	CGG	2	6	1761214	1761219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_015733	CAT	2	6	1761226	1761231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_015733	GAAA	2	8	1761304	1761311	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_015733	G	7	7	1764170	1764176	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_015733	GCG	2	6	1764218	1764223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_015733	CGC	2	6	1764405	1764410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4062	NC_015733	GCC	2	6	1764424	1764429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4063	NC_015733	GCAG	2	8	1764440	1764447	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4064	NC_015733	GCC	2	6	1768668	1768673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4065	NC_015733	ACCGC	2	10	1768681	1768690	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4066	NC_015733	A	7	7	1768706	1768712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_015733	CAA	2	6	1768778	1768783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_015733	CGG	2	6	1768843	1768848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_015733	TCA	2	6	1768859	1768864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_015733	CAC	2	6	1768867	1768872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4071	NC_015733	AG	3	6	1768921	1768926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_015733	T	6	6	1769015	1769020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_015733	T	7	7	1769254	1769260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_015733	CTTCG	2	10	1769410	1769419	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4075	NC_015733	T	6	6	1769468	1769473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_015733	GCC	2	6	1769494	1769499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4077	NC_015733	TGCC	2	8	1769553	1769560	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4078	NC_015733	CTT	2	6	1769583	1769588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_015733	TCC	2	6	1770529	1770534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4080	NC_015733	CTGTG	2	10	1770553	1770562	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4081	NC_015733	GC	3	6	1770602	1770607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4082	NC_015733	T	6	6	1770637	1770642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_015733	CGCAC	2	10	1773103	1773112	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4084	NC_015733	CAGC	2	8	1773122	1773129	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4085	NC_015733	TCA	2	6	1773244	1773249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_015733	TCCT	2	8	1773258	1773265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4087	NC_015733	AAG	2	6	1773333	1773338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_015733	GAC	2	6	1773386	1773391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_015733	GCAG	2	8	1775681	1775688	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4090	NC_015733	ACG	2	6	1775693	1775698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4092	NC_015733	TCA	2	6	1779387	1779392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_015733	TGT	2	6	1779479	1779484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_015733	GGGC	2	8	1779561	1779568	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4095	NC_015733	GGT	2	6	1780562	1780567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_015733	CGC	2	6	1780595	1780600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4097	NC_015733	ACA	2	6	1787258	1787263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_015733	CCCG	2	8	1787275	1787282	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4099	NC_015733	CCA	2	6	1787373	1787378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4100	NC_015733	ACA	2	6	1787388	1787393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_015733	AGC	2	6	1790909	1790914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_015733	ATCG	2	8	1792344	1792351	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4103	NC_015733	CGG	2	6	1792396	1792401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_015733	ACC	2	6	1792440	1792445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4105	NC_015733	GTCGA	2	10	1798294	1798303	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4106	NC_015733	GCTTG	2	10	1798314	1798323	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4107	NC_015733	CAA	2	6	1798494	1798499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_015733	GCT	2	6	1798525	1798530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_015733	TTCA	2	8	1798543	1798550	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4110	NC_015733	CGA	2	6	1798609	1798614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_015733	CA	3	6	1798620	1798625	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4112	NC_015733	GGC	2	6	1798637	1798642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_015733	CTG	2	6	1798646	1798651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_015733	TGG	2	6	1798674	1798679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_015733	GCC	2	6	1798859	1798864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4116	NC_015733	CCCGG	2	10	1798901	1798910	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4117	NC_015733	TCA	2	6	1798941	1798946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4119	NC_015733	GCG	2	6	1798986	1798991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_015733	AAC	2	6	1799012	1799017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_015733	CGG	2	6	1799026	1799031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_015733	CAC	2	6	1799083	1799088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4123	NC_015733	GCC	2	6	1799171	1799176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4124	NC_015733	CGGC	2	8	1799199	1799206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4125	NC_015733	GCC	2	6	1799225	1799230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4126	NC_015733	CAC	2	6	1799296	1799301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4127	NC_015733	TGC	2	6	1799421	1799426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_015733	CGG	2	6	1799447	1799452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_015733	TCAT	2	8	1799456	1799463	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4130	NC_015733	GGC	2	6	1799567	1799572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4132	NC_015733	CGG	2	6	1799731	1799736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4263	NC_015733	CAG	2	6	1808751	1808756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4265	NC_015733	GGC	2	6	1814012	1814017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4266	NC_015733	AGC	2	6	1814022	1814027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4268	NC_015733	G	7	7	1814061	1814067	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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4303	NC_015733	GGGCA	2	10	1830917	1830926	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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4371	NC_015733	CAGGT	2	10	1873088	1873097	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4372	NC_015733	GGAC	2	8	1873110	1873117	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4382	NC_015733	CTG	2	6	1877211	1877216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4388	NC_015733	GC	3	6	1881020	1881025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4389	NC_015733	TGCTCT	3	18	1882126	1882143	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4390	NC_015733	GC	3	6	1882165	1882170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4391	NC_015733	GCC	2	6	1882183	1882188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4392	NC_015733	AGG	2	6	1882201	1882206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4393	NC_015733	GCGA	2	8	1882207	1882214	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4394	NC_015733	CTGCTC	13	78	1882255	1882332	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4395	NC_015733	TGATTT	2	12	1882334	1882345	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4396	NC_015733	TGATCT	24	144	1882346	1882489	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4397	NC_015733	CCTC	2	8	1882508	1882515	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4398	NC_015733	CCT	2	6	1882534	1882539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4399	NC_015733	AAGATC	24	144	1882549	1882692	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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4401	NC_015733	AGGAGC	13	78	1882705	1882782	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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4403	NC_015733	C	6	6	1882853	1882858	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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4419	NC_015733	CAA	2	6	1890418	1890423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4422	NC_015733	T	7	7	1890559	1890565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4423	NC_015733	TTG	2	6	1890578	1890583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4426	NC_015733	CCATC	2	10	1890998	1891007	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4427	NC_015733	GCA	2	6	1894060	1894065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4428	NC_015733	T	6	6	1894191	1894196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4429	NC_015733	GC	3	6	1894259	1894264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4432	NC_015733	CGG	2	6	1896871	1896876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4433	NC_015733	GGCG	2	8	1896877	1896884	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4434	NC_015733	TG	3	6	1896944	1896949	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4435	NC_015733	C	6	6	1896967	1896972	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4436	NC_015733	CG	3	6	1897576	1897581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4437	NC_015733	TAGC	2	8	1897617	1897624	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4445	NC_015733	ACCGC	2	10	1903967	1903976	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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4461	NC_015733	GGGCA	2	10	1905588	1905597	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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4464	NC_015733	GTTTT	2	10	1909057	1909066	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4473	NC_015733	CAG	2	6	1914274	1914279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4500	NC_015733	GCTCGC	2	12	1923991	1924002	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

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