MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 15562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015733	GCTGC	2	10	1519316	1519325	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3502	NC_015733	TAG	2	6	1521339	1521344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_015733	GGC	2	6	1521382	1521387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_015733	TTG	2	6	1521464	1521469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_015733	GAT	2	6	1521476	1521481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_015733	TGC	2	6	1522396	1522401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_015733	GTC	2	6	1522538	1522543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_015733	TGC	2	6	1522599	1522604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_015733	A	6	6	1524605	1524610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_015733	T	7	7	1524627	1524633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_015733	CTG	2	6	1524838	1524843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_015733	GGT	2	6	1524864	1524869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_015733	TGA	2	6	1524961	1524966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_015733	CA	3	6	1525009	1525014	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3515	NC_015733	TGA	2	6	1525039	1525044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_015733	CTGC	2	8	1525048	1525055	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3517	NC_015733	GCCA	2	8	1525101	1525108	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3518	NC_015733	AGGC	2	8	1526001	1526008	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3519	NC_015733	GGA	2	6	1526028	1526033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_015733	AGGCC	2	10	1526332	1526341	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3521	NC_015733	TGG	2	6	1526592	1526597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_015733	GCA	2	6	1527916	1527921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_015733	CAG	2	6	1527958	1527963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_015733	GATC	2	8	1531592	1531599	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3525	NC_015733	GCT	2	6	1531611	1531616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_015733	GCTG	2	8	1533688	1533695	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3527	NC_015733	GCA	2	6	1535406	1535411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_015733	AGA	2	6	1535432	1535437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_015733	TGA	2	6	1535444	1535449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_015733	CACC	2	8	1535463	1535470	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3531	NC_015733	ACC	2	6	1535503	1535508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3532	NC_015733	CAC	2	6	1535511	1535516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3533	NC_015733	TCGA	2	8	1535521	1535528	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3534	NC_015733	ACTC	2	8	1538022	1538029	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3535	NC_015733	TCG	2	6	1538085	1538090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_015733	CCA	2	6	1538109	1538114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3537	NC_015733	CCTC	2	8	1538146	1538153	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3538	NC_015733	TCT	2	6	1538154	1538159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_015733	CGC	2	6	1538700	1538705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3540	NC_015733	TTG	3	9	1539008	1539016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_015733	GCT	2	6	1542728	1542733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_015733	A	6	6	1542812	1542817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_015733	CCG	2	6	1542823	1542828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3544	NC_015733	TTCG	2	8	1545400	1545407	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3545	NC_015733	TGC	2	6	1547173	1547178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_015733	ACG	2	6	1548661	1548666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_015733	TGG	2	6	1549825	1549830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_015733	A	6	6	1549879	1549884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_015733	CAC	2	6	1549973	1549978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3550	NC_015733	GGC	2	6	1549979	1549984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_015733	GTC	2	6	1550029	1550034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_015733	GCG	3	9	1550050	1550058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_015733	TTCG	2	8	1550062	1550069	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3554	NC_015733	GCT	2	6	1553034	1553039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_015733	GT	3	6	1553081	1553086	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_015733	CAA	2	6	1553093	1553098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_015733	GCT	2	6	1555327	1555332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_015733	GCAG	2	8	1558411	1558418	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3559	NC_015733	AAAC	2	8	1558457	1558464	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3560	NC_015733	A	6	6	1560217	1560222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_015733	T	7	7	1560242	1560248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_015733	GGCC	2	8	1560533	1560540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3563	NC_015733	T	7	7	1560590	1560596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_015733	ACC	2	6	1560609	1560614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3565	NC_015733	GCT	2	6	1560664	1560669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_015733	CGT	2	6	1561322	1561327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_015733	GGT	2	6	1561400	1561405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_015733	CCA	2	6	1561452	1561457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3569	NC_015733	ACC	2	6	1562832	1562837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_015733	CG	3	6	1562915	1562920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3571	NC_015733	A	6	6	1562951	1562956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_015733	ATGG	2	8	1562997	1563004	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_015733	CGC	2	6	1563038	1563043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3574	NC_015733	ATC	2	6	1564648	1564653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_015733	GCG	2	6	1564679	1564684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_015733	GCG	2	6	1572939	1572944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_015733	TCAG	2	8	1572992	1572999	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3578	NC_015733	ACCG	2	8	1573013	1573020	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3579	NC_015733	TGA	2	6	1573072	1573077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_015733	TGA	2	6	1573091	1573096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_015733	GCA	2	6	1573110	1573115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_015733	CAC	2	6	1573142	1573147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3583	NC_015733	CGC	2	6	1573206	1573211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3584	NC_015733	AGC	2	6	1576738	1576743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_015733	ACC	2	6	1576763	1576768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3586	NC_015733	CTG	2	6	1576787	1576792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_015733	CTCG	2	8	1576822	1576829	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3588	NC_015733	GCG	2	6	1576848	1576853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_015733	CAA	2	6	1576907	1576912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_015733	GGA	2	6	1576939	1576944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_015733	CGG	2	6	1577006	1577011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_015733	GCAGT	2	10	1577012	1577021	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3593	NC_015733	T	6	6	1577073	1577078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_015733	CAA	2	6	1577144	1577149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_015733	ATA	2	6	1577155	1577160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_015733	GTT	2	6	1580709	1580714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_015733	TAG	2	6	1580771	1580776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_015733	G	8	8	1580841	1580848	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_015733	GAA	2	6	1580908	1580913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_015733	T	6	6	1580918	1580923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_015733	TTG	2	6	1580945	1580950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_015733	CTC	2	6	1580999	1581004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3603	NC_015733	TAA	2	6	1581048	1581053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_015733	T	6	6	1581095	1581100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_015733	ATT	2	6	1581104	1581109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_015733	CT	3	6	1581114	1581119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3607	NC_015733	TGG	2	6	1581295	1581300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_015733	AGT	2	6	1581352	1581357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_015733	GC	3	6	1581409	1581414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3610	NC_015733	CGT	2	6	1581434	1581439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_015733	GTCT	2	8	1581533	1581540	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3612	NC_015733	TGG	2	6	1581599	1581604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_015733	GTG	2	6	1581644	1581649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_015733	GTA	2	6	1581665	1581670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_015733	CTG	2	6	1581671	1581676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_015733	CGT	2	6	1581727	1581732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_015733	ATTG	2	8	1581818	1581825	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_015733	GAT	2	6	1581842	1581847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_015733	CCCTG	2	10	1581913	1581922	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3620	NC_015733	AAT	2	6	1581989	1581994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_015733	ATT	2	6	1582016	1582021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_015733	T	7	7	1582060	1582066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_015733	GA	3	6	1582115	1582120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_015733	TAT	2	6	1582153	1582158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_015733	TAA	2	6	1582198	1582203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_015733	AAG	2	6	1582226	1582231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_015733	T	6	6	1582235	1582240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_015733	ATC	2	6	1582392	1582397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_015733	ACCC	2	8	1582446	1582453	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3630	NC_015733	GCT	2	6	1582477	1582482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3631	NC_015733	CGT	2	6	1582530	1582535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_015733	GTC	2	6	1582587	1582592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3881	NC_015733	GCAG	2	8	1680823	1680830	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3889	NC_015733	GTG	2	6	1681532	1681537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3892	NC_015733	GCG	2	6	1684027	1684032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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