MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 15562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015733	GC	3	6	1314809	1314814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_015733	T	6	6	1314818	1314823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_015733	CTT	2	6	1315655	1315660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_015733	TC	4	8	1315692	1315699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3005	NC_015733	GAA	2	6	1315738	1315743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_015733	GTG	2	6	1317403	1317408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_015733	GCTC	2	8	1317461	1317468	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3008	NC_015733	TAGGG	2	10	1318543	1318552	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_015733	TG	3	6	1318903	1318908	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_015733	TC	3	6	1318934	1318939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3011	NC_015733	GT	3	6	1319018	1319023	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_015733	GCC	2	6	1319036	1319041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3013	NC_015733	CG	3	6	1319042	1319047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3014	NC_015733	AC	3	6	1319062	1319067	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_015733	GCAT	2	8	1319081	1319088	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3016	NC_015733	CTG	2	6	1319089	1319094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_015733	ATC	2	6	1319136	1319141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_015733	CCG	2	6	1319198	1319203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_015733	TGT	2	6	1319237	1319242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_015733	CT	3	6	1325833	1325838	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3021	NC_015733	AGCAG	2	10	1325883	1325892	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3022	NC_015733	TCGG	2	8	1325901	1325908	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3023	NC_015733	GGC	2	6	1325915	1325920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_015733	TGC	2	6	1325923	1325928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_015733	TGC	2	6	1325964	1325969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_015733	GACG	2	8	1325980	1325987	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3027	NC_015733	GAC	2	6	1326047	1326052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_015733	CA	3	6	1326070	1326075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3029	NC_015733	CTG	2	6	1326977	1326982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_015733	CAT	2	6	1326998	1327003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_015733	CG	3	6	1328000	1328005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3032	NC_015733	CGC	2	6	1328047	1328052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3033	NC_015733	CGC	2	6	1328121	1328126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_015733	GA	3	6	1328129	1328134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_015733	T	6	6	1329447	1329452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_015733	ATG	2	6	1332246	1332251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_015733	CAT	2	6	1332265	1332270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_015733	CGG	2	6	1333671	1333676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_015733	CTC	2	6	1337714	1337719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_015733	TTA	2	6	1337767	1337772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_015733	C	7	7	1337780	1337786	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3042	NC_015733	TGC	2	6	1340771	1340776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_015733	TTC	2	6	1340853	1340858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_015733	GCG	2	6	1340859	1340864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_015733	GC	3	6	1340905	1340910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3046	NC_015733	CCGG	2	8	1344601	1344608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3047	NC_015733	CCCT	2	8	1347028	1347035	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3048	NC_015733	T	6	6	1347094	1347099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_015733	CGAG	2	8	1347122	1347129	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3050	NC_015733	CCTT	2	8	1347217	1347224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3051	NC_015733	CGG	2	6	1347234	1347239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_015733	GCC	2	6	1347245	1347250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3053	NC_015733	CTAAG	2	10	1349865	1349874	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3054	NC_015733	ACA	2	6	1349901	1349906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_015733	CAG	2	6	1351216	1351221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_015733	CGA	2	6	1351277	1351282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_015733	AGC	2	6	1352464	1352469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_015733	AAT	2	6	1353397	1353402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_015733	ATT	2	6	1353420	1353425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_015733	TCTG	2	8	1353468	1353475	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3061	NC_015733	TGCT	2	8	1355475	1355482	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3062	NC_015733	AGC	2	6	1355576	1355581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_015733	CTG	2	6	1358581	1358586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_015733	CG	3	6	1358595	1358600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3065	NC_015733	TGC	2	6	1358627	1358632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_015733	GCA	2	6	1358690	1358695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_015733	GCGG	2	8	1358718	1358725	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3068	NC_015733	AAT	2	6	1358742	1358747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_015733	TGT	2	6	1358756	1358761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_015733	GGGT	2	8	1358793	1358800	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_015733	CA	3	6	1358801	1358806	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3072	NC_015733	CGGGT	2	10	1358827	1358836	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3073	NC_015733	GAT	2	6	1360795	1360800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3075	NC_015733	AGC	2	6	1360963	1360968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_015733	GAG	2	6	1361124	1361129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_015733	AGG	2	6	1361226	1361231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_015733	TCA	2	6	1361260	1361265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_015733	GAT	2	6	1361267	1361272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_015733	A	6	6	1361297	1361302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_015733	T	7	7	1361325	1361331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_015733	A	6	6	1361345	1361350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_015733	TC	3	6	1361716	1361721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3084	NC_015733	CGG	3	9	1361731	1361739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_015733	CG	3	6	1361756	1361761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3086	NC_015733	CAGGC	2	10	1361781	1361790	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3087	NC_015733	TAA	2	6	1361791	1361796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_015733	GCA	2	6	1361800	1361805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_015733	CGG	2	6	1361817	1361822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_015733	CTT	2	6	1365433	1365438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_015733	GTC	2	6	1365453	1365458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_015733	CGC	2	6	1365670	1365675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3093	NC_015733	GGC	2	6	1365680	1365685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_015733	TGG	2	6	1365690	1365695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_015733	CGG	2	6	1366084	1366089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_015733	TGA	2	6	1366151	1366156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3098	NC_015733	CGG	2	6	1366193	1366198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_015733	CAG	2	6	1366256	1366261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_015733	GCC	2	6	1368011	1368016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3101	NC_015733	TGGTT	2	10	1368042	1368051	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_015733	GGT	2	6	1368071	1368076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_015733	AGG	2	6	1368169	1368174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_015733	CAC	2	6	1368228	1368233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3105	NC_015733	ACG	2	6	1368241	1368246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_015733	TCCCG	2	10	1368369	1368378	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3107	NC_015733	CGC	2	6	1368423	1368428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3108	NC_015733	GCC	2	6	1368550	1368555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3109	NC_015733	CGA	2	6	1368572	1368577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_015733	CTT	2	6	1368587	1368592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_015733	CTG	2	6	1368593	1368598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_015733	GAT	2	6	1368606	1368611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_015733	CCAG	2	8	1368683	1368690	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3114	NC_015733	GCT	2	6	1369621	1369626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_015733	ATGG	2	8	1369649	1369656	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_015733	AG	3	6	1369786	1369791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_015733	GAT	2	6	1369795	1369800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_015733	CGA	2	6	1369899	1369904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3120	NC_015733	GCC	2	6	1371048	1371053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3121	NC_015733	G	7	7	1371060	1371066	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_015733	TGA	2	6	1371137	1371142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_015733	T	6	6	1371148	1371153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_015733	GCAA	2	8	1371230	1371237	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3125	NC_015733	CGC	2	6	1371239	1371244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3126	NC_015733	GGGC	2	8	1371310	1371317	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3127	NC_015733	AGC	2	6	1371342	1371347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_015733	CTG	2	6	1371354	1371359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_015733	CTG	3	9	1371374	1371382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3131	NC_015733	CCTA	2	8	1371580	1371587	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3139	NC_015733	TGG	2	6	1374115	1374120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3265	NC_015733	CTG	2	6	1419924	1419929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3267	NC_015733	TCTT	2	8	1421342	1421349	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3388	NC_015733	T	6	6	1470288	1470293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3389	NC_015733	GTGA	2	8	1470850	1470857	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3395	NC_015733	CAGG	2	8	1470995	1471002	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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