MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 15562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015733	CGTC	2	8	687287	687294	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_015733	AAC	2	6	687306	687311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_015733	AGG	2	6	687380	687385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_015733	AGC	2	6	687396	687401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_015733	AAAG	2	8	687410	687417	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_015733	AGTCG	2	10	687432	687441	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1507	NC_015733	TGA	2	6	687501	687506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_015733	GTTG	2	8	687776	687783	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_015733	GGT	2	6	687795	687800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_015733	TGA	2	6	687844	687849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_015733	CGA	2	6	687865	687870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_015733	GGT	2	6	687945	687950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_015733	GA	3	6	687975	687980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_015733	TTA	2	6	688101	688106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_015733	CGG	2	6	688225	688230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_015733	GGC	2	6	688306	688311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_015733	TGAAAT	2	12	688334	688345	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_015733	ACC	2	6	688496	688501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_015733	TGG	2	6	688556	688561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_015733	TCC	2	6	688582	688587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1521	NC_015733	GGA	2	6	688599	688604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_015733	GC	3	6	688660	688665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1523	NC_015733	GGT	2	6	688719	688724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_015733	CGG	2	6	688806	688811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_015733	TCA	2	6	688834	688839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_015733	CGT	2	6	688914	688919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_015733	GCT	2	6	688968	688973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_015733	ACG	2	6	689149	689154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_015733	GT	3	6	689167	689172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_015733	GGT	2	6	689261	689266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_015733	AAC	2	6	689275	689280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_015733	GAC	2	6	689362	689367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_015733	ACC	2	6	689382	689387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_015733	ATCCC	2	10	689390	689399	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1535	NC_015733	CAG	2	6	689405	689410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_015733	CGC	2	6	689549	689554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_015733	CGG	2	6	689623	689628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_015733	TCG	2	6	689667	689672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_015733	AATG	2	8	690412	690419	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_015733	TGA	2	6	693370	693375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_015733	CAA	2	6	693417	693422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_015733	A	6	6	693421	693426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_015733	CTC	2	6	693749	693754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_015733	CAAA	2	8	693775	693782	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1545	NC_015733	CCG	2	6	693839	693844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_015733	CAA	2	6	693855	693860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_015733	CTG	2	6	693878	693883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_015733	CGGG	2	8	695536	695543	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1549	NC_015733	CGC	2	6	695569	695574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_015733	GCT	2	6	695583	695588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_015733	CACC	2	8	701333	701340	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1552	NC_015733	TG	3	6	701368	701373	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_015733	TCC	2	6	701911	701916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_015733	CGG	2	6	701954	701959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_015733	AGG	2	6	702000	702005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_015733	ATG	2	6	703696	703701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_015733	GAA	2	6	704909	704914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_015733	GAA	2	6	705183	705188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_015733	A	6	6	705214	705219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_015733	GGC	2	6	706278	706283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_015733	GGGC	2	8	708202	708209	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1562	NC_015733	CAGG	2	8	708308	708315	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1563	NC_015733	TTC	2	6	708317	708322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_015733	AAGG	2	8	708362	708369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_015733	T	7	7	710975	710981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_015733	CCT	2	6	711117	711122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_015733	TTGC	2	8	711151	711158	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1568	NC_015733	CGC	2	6	711185	711190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1569	NC_015733	AAC	2	6	711236	711241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_015733	TGAA	2	8	711258	711265	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_015733	A	7	7	711264	711270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_015733	GAA	2	6	711289	711294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_015733	CAG	2	6	711312	711317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_015733	AGTTC	2	10	711389	711398	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1575	NC_015733	GC	3	6	711499	711504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1576	NC_015733	CCA	2	6	711630	711635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1577	NC_015733	GC	3	6	711705	711710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1578	NC_015733	A	7	7	711843	711849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_015733	T	7	7	711872	711878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_015733	CA	3	6	711916	711921	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1581	NC_015733	TG	3	6	711926	711931	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_015733	GCA	2	6	711956	711961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_015733	GCCG	2	8	713354	713361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_015733	GAGGG	2	10	713372	713381	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_015733	AGC	2	6	713391	713396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_015733	GCT	2	6	714347	714352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1588	NC_015733	AGT	2	6	718733	718738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_015733	GAC	2	6	718747	718752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_015733	AGC	2	6	719367	719372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_015733	TGT	2	6	719488	719493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_015733	TCTG	2	8	719495	719502	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_015733	CCA	2	6	720948	720953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1594	NC_015733	TGG	2	6	720990	720995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_015733	ACT	2	6	721084	721089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_015733	GTC	2	6	721097	721102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_015733	ATC	2	6	721121	721126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_015733	CGG	2	6	723066	723071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_015733	TTC	2	6	723093	723098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_015733	CCA	2	6	723117	723122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1601	NC_015733	GCTC	2	8	723161	723168	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1602	NC_015733	GACC	2	8	723203	723210	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1603	NC_015733	GGT	2	6	724258	724263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_015733	CT	3	6	724311	724316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1605	NC_015733	GGC	2	6	724369	724374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_015733	CTC	2	6	724407	724412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_015733	CTG	2	6	724502	724507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_015733	CAAG	2	8	724556	724563	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1609	NC_015733	TCGAT	2	10	724639	724648	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1610	NC_015733	AAC	2	6	724665	724670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_015733	AAG	2	6	724676	724681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_015733	GTG	2	6	724699	724704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_015733	GC	3	6	724713	724718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_015733	ACCC	2	8	724786	724793	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1615	NC_015733	GCT	2	6	724817	724822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_015733	CGT	2	6	724870	724875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1618	NC_015733	TGC	2	6	725737	725742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_015733	GGTT	2	8	725794	725801	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_015733	GTG	2	6	725812	725817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_015733	CGG	2	6	725932	725937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1624	NC_015733	ACG	2	6	726153	726158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_015733	CTG	2	6	726180	726185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_015733	TCGGCA	2	12	726295	726306	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_015733	AG	3	6	726382	726387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_015733	GCG	2	6	726464	726469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_015733	CGA	2	6	726493	726498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_015733	TGT	2	6	726628	726633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_015733	GGC	2	6	726665	726670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_015733	CAG	2	6	726797	726802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1634	NC_015733	ACGA	2	8	726899	726906	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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