MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 15562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_015733	CCA	2	6	5964872	5964877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15502	NC_015733	ATC	2	6	5965206	5965211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15503	NC_015733	TCC	2	6	5965232	5965237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15504	NC_015733	GAG	2	6	5965254	5965259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15505	NC_015733	TGA	2	6	5965291	5965296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15506	NC_015733	TTTCA	2	10	5965298	5965307	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15507	NC_015733	ACT	2	6	5965446	5965451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15508	NC_015733	CTG	2	6	5965648	5965653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15509	NC_015733	A	8	8	5965787	5965794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15510	NC_015733	TCA	2	6	5965835	5965840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15511	NC_015733	CCT	2	6	5965926	5965931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15512	NC_015733	TCT	2	6	5966044	5966049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15513	NC_015733	CAT	2	6	5966082	5966087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15514	NC_015733	AT	3	6	5966120	5966125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_015733	TA	3	6	5966190	5966195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15516	NC_015733	TAA	2	6	5966225	5966230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15517	NC_015733	GGC	2	6	5966257	5966262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15518	NC_015733	GCT	2	6	5966288	5966293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15519	NC_015733	GCA	2	6	5966584	5966589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15520	NC_015733	A	6	6	5966758	5966763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15521	NC_015733	GAA	2	6	5966793	5966798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15522	NC_015733	CTAT	2	8	5966854	5966861	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15523	NC_015733	ATT	2	6	5966890	5966895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15524	NC_015733	ATA	2	6	5966908	5966913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15525	NC_015733	TGC	2	6	5966929	5966934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15526	NC_015733	GAA	2	6	5966939	5966944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15527	NC_015733	TTA	2	6	5972178	5972183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15528	NC_015733	AT	3	6	5972252	5972257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15529	NC_015733	CCT	2	6	5972322	5972327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15530	NC_015733	TTC	2	6	5972354	5972359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15531	NC_015733	C	6	6	5972463	5972468	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15532	NC_015733	TTC	2	6	5972485	5972490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15533	NC_015733	AGC	2	6	5972569	5972574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15534	NC_015733	AAG	2	6	5972600	5972605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15535	NC_015733	CGT	2	6	5972620	5972625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15536	NC_015733	CAG	2	6	5972710	5972715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15537	NC_015733	GAT	2	6	5972737	5972742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15538	NC_015733	CAG	2	6	5972791	5972796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15539	NC_015733	GTG	2	6	5972797	5972802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15540	NC_015733	TG	3	6	5972801	5972806	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15541	NC_015733	GA	3	6	5972835	5972840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15542	NC_015733	TTTGA	2	10	5972846	5972855	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15543	NC_015733	TCA	2	6	5972943	5972948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15544	NC_015733	AG	3	6	5973068	5973073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15545	NC_015733	ACA	2	6	5973088	5973093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15546	NC_015733	GCCT	2	8	5973164	5973171	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15547	NC_015733	TTA	2	6	5973183	5973188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15548	NC_015733	TAT	2	6	5973224	5973229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15549	NC_015733	TTCGA	2	10	5975890	5975899	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15550	NC_015733	ATG	2	6	5975906	5975911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15551	NC_015733	GTC	2	6	5975944	5975949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15552	NC_015733	A	6	6	5976129	5976134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15553	NC_015733	TCGA	2	8	5976161	5976168	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15554	NC_015733	GGT	2	6	5977571	5977576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15555	NC_015733	G	7	7	5977590	5977596	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15556	NC_015733	AGAAA	2	10	5977604	5977613	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15557	NC_015733	CTG	2	6	5981999	5982004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15558	NC_015733	CTCG	2	8	5983044	5983051	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15559	NC_015733	GTG	2	6	5983078	5983083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15560	NC_015733	TCC	2	6	5983353	5983358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15561	NC_015733	CGT	2	6	5983368	5983373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15562	NC_015733	C	6	6	5983450	5983455	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.