MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 15562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_015733	ATTT	2	8	5511672	5511679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14502	NC_015733	ATTA	2	8	5511748	5511755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_015733	GC	3	6	5511790	5511795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14504	NC_015733	TAC	2	6	5511796	5511801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14505	NC_015733	A	6	6	5511837	5511842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14506	NC_015733	ACA	2	6	5511881	5511886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14507	NC_015733	A	6	6	5511896	5511901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14508	NC_015733	ATGG	2	8	5512000	5512007	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14509	NC_015733	AGC	2	6	5512024	5512029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14510	NC_015733	CCAA	2	8	5512070	5512077	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14511	NC_015733	CG	3	6	5512163	5512168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14512	NC_015733	GAAT	2	8	5512188	5512195	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14513	NC_015733	AGAAA	2	10	5512233	5512242	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14514	NC_015733	A	6	6	5512272	5512277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14515	NC_015733	CCT	2	6	5512311	5512316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14516	NC_015733	ACA	2	6	5512326	5512331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14517	NC_015733	TTG	2	6	5515006	5515011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14518	NC_015733	CGT	2	6	5515019	5515024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14519	NC_015733	GGC	2	6	5515062	5515067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14520	NC_015733	G	7	7	5515084	5515090	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14521	NC_015733	GC	3	6	5519669	5519674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14522	NC_015733	CAG	2	6	5519682	5519687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14523	NC_015733	AAC	2	6	5519713	5519718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14524	NC_015733	T	6	6	5519761	5519766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14525	NC_015733	ATT	2	6	5521195	5521200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14526	NC_015733	CAT	2	6	5521212	5521217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14527	NC_015733	GCC	2	6	5521255	5521260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14528	NC_015733	AT	3	6	5521276	5521281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14529	NC_015733	CAG	2	6	5521289	5521294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14530	NC_015733	CAAG	2	8	5521330	5521337	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14531	NC_015733	CCA	2	6	5521387	5521392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14532	NC_015733	CCTG	2	8	5521470	5521477	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14533	NC_015733	CAA	2	6	5521497	5521502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14534	NC_015733	GCAC	2	8	5521532	5521539	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14535	NC_015733	CAGGTG	2	12	5521554	5521565	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14536	NC_015733	CCA	2	6	5521606	5521611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14537	NC_015733	AGC	2	6	5521633	5521638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14538	NC_015733	ACCT	2	8	5521668	5521675	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14539	NC_015733	GCC	2	6	5521717	5521722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14540	NC_015733	CGCT	2	8	5521743	5521750	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14541	NC_015733	CATGG	2	10	5521797	5521806	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14542	NC_015733	CGCC	2	8	5521810	5521817	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14543	NC_015733	GGTC	2	8	5521831	5521838	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14544	NC_015733	CAA	2	6	5521877	5521882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14545	NC_015733	CGC	2	6	5521895	5521900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14546	NC_015733	CGG	2	6	5521937	5521942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14547	NC_015733	CTA	2	6	5521970	5521975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14548	NC_015733	CGC	2	6	5521987	5521992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14549	NC_015733	CGCC	2	8	5522078	5522085	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14550	NC_015733	CCG	2	6	5522116	5522121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14551	NC_015733	GCCAC	2	10	5522127	5522136	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14552	NC_015733	TCA	2	6	5522218	5522223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14553	NC_015733	CAC	2	6	5522276	5522281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14554	NC_015733	GCCA	2	8	5522298	5522305	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14555	NC_015733	ACC	2	6	5522397	5522402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14556	NC_015733	CCTGG	2	10	5522426	5522435	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14557	NC_015733	TGA	2	6	5522524	5522529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14558	NC_015733	AGA	2	6	5522536	5522541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14559	NC_015733	CCACG	2	10	5522570	5522579	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14560	NC_015733	TCG	2	6	5522590	5522595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14561	NC_015733	GCCG	2	8	5522631	5522638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14562	NC_015733	CTT	2	6	5522666	5522671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14563	NC_015733	TGCT	2	8	5522695	5522702	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14564	NC_015733	ACG	2	6	5522758	5522763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14565	NC_015733	CAT	2	6	5522813	5522818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14566	NC_015733	GCC	2	6	5522820	5522825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14567	NC_015733	GCA	2	6	5522832	5522837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14568	NC_015733	GAG	2	6	5522916	5522921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14569	NC_015733	TTCA	2	8	5522954	5522961	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14570	NC_015733	GAA	2	6	5522964	5522969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14571	NC_015733	GCTG	2	8	5523103	5523110	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14572	NC_015733	GCC	2	6	5523200	5523205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14573	NC_015733	CGA	2	6	5523311	5523316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14574	NC_015733	GCG	2	6	5523346	5523351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14575	NC_015733	GCGCC	2	10	5523368	5523377	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14576	NC_015733	CG	3	6	5523511	5523516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14577	NC_015733	CAG	2	6	5523568	5523573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14578	NC_015733	GC	3	6	5523588	5523593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14579	NC_015733	CAA	2	6	5523675	5523680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14580	NC_015733	GCT	2	6	5523803	5523808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14581	NC_015733	ACG	2	6	5523908	5523913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14582	NC_015733	GCG	2	6	5523928	5523933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14583	NC_015733	TGC	2	6	5524049	5524054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14584	NC_015733	TGC	2	6	5524073	5524078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14585	NC_015733	GCC	2	6	5524133	5524138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14586	NC_015733	GGC	3	9	5524156	5524164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14587	NC_015733	CAG	2	6	5524189	5524194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14588	NC_015733	CGG	2	6	5524244	5524249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14589	NC_015733	ACT	2	6	5524317	5524322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14590	NC_015733	AGC	2	6	5524325	5524330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14591	NC_015733	AGC	2	6	5524345	5524350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14592	NC_015733	AGC	2	6	5524392	5524397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14593	NC_015733	CAC	2	6	5524473	5524478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14594	NC_015733	T	6	6	5524533	5524538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14595	NC_015733	ACGC	2	8	5524541	5524548	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14596	NC_015733	AGCCTG	2	12	5524555	5524566	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14597	NC_015733	CTG	2	6	5524615	5524620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14598	NC_015733	CCGT	2	8	5524668	5524675	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14599	NC_015733	CGCCCT	2	12	5524691	5524702	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
14600	NC_015733	CCA	2	6	5524718	5524723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14601	NC_015733	TGCC	2	8	5524732	5524739	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14602	NC_015733	ACCA	2	8	5524762	5524769	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14603	NC_015733	CTG	2	6	5524801	5524806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14604	NC_015733	GC	3	6	5524960	5524965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14605	NC_015733	CAA	2	6	5524989	5524994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14606	NC_015733	ACC	2	6	5525041	5525046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14607	NC_015733	TTG	2	6	5525101	5525106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14608	NC_015733	CAC	2	6	5525136	5525141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14609	NC_015733	CCAG	2	8	5525145	5525152	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14610	NC_015733	AAC	2	6	5525165	5525170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14611	NC_015733	CGCA	2	8	5525172	5525179	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14612	NC_015733	GCGAT	2	10	5525204	5525213	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14613	NC_015733	CGAT	2	8	5525294	5525301	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14614	NC_015733	AAC	2	6	5525312	5525317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14615	NC_015733	GGC	2	6	5525381	5525386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14616	NC_015733	TTC	2	6	5525395	5525400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14617	NC_015733	CGA	2	6	5525457	5525462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14618	NC_015733	ACT	2	6	5525463	5525468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14619	NC_015733	GCC	2	6	5525515	5525520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14620	NC_015733	ACCT	2	8	5525563	5525570	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14621	NC_015733	ATG	2	6	5525608	5525613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14622	NC_015733	TGC	2	6	5525771	5525776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14623	NC_015733	AAC	2	6	5525803	5525808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14624	NC_015733	TCG	2	6	5525863	5525868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14625	NC_015733	CCT	2	6	5525893	5525898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14626	NC_015733	CAGC	2	8	5525931	5525938	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14627	NC_015733	CGA	2	6	5525967	5525972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14628	NC_015733	TTC	2	6	5525980	5525985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14629	NC_015733	TC	3	6	5526004	5526009	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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14757	NC_015733	AACA	2	8	5581364	5581371	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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