MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 15562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015733	GGA	2	6	449750	449755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_015733	ACC	2	6	449771	449776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_015733	ACA	2	6	449810	449815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_015733	T	6	6	449882	449887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_015733	TGG	2	6	450917	450922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_015733	ACCA	2	8	450985	450992	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_015733	TCC	2	6	450996	451001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_015733	TAC	2	6	453114	453119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_015733	ACA	2	6	453172	453177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_015733	TCCA	2	8	453274	453281	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_015733	ACCT	3	12	453368	453379	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_015733	CCT	2	6	453382	453387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_015733	CT	3	6	453386	453391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_015733	AGG	2	6	453412	453417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_015733	CCGGT	2	10	453455	453464	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1016	NC_015733	CAC	2	6	453507	453512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_015733	GTT	2	6	453516	453521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015733	GCT	2	6	457459	457464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_015733	TCG	2	6	457475	457480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_015733	GAAAA	2	10	457515	457524	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_015733	A	6	6	459434	459439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_015733	TG	3	6	461537	461542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015733	TCG	2	6	461544	461549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_015733	ACA	2	6	461594	461599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_015733	AGG	2	6	461600	461605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_015733	CAGG	2	8	461622	461629	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_015733	AGCT	2	8	461671	461678	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_015733	CGG	2	6	461710	461715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_015733	GGGCA	2	10	461722	461731	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1030	NC_015733	GA	3	6	463838	463843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_015733	TGAGT	2	10	464828	464837	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015733	GCTC	2	8	464851	464858	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_015733	GCT	2	6	468955	468960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_015733	GCA	2	6	468971	468976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_015733	AGC	2	6	468978	468983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_015733	GCC	3	9	468985	468993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_015733	TGGCA	2	10	469000	469009	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1038	NC_015733	GC	3	6	469016	469021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_015733	CTCG	2	8	470971	470978	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_015733	GAC	2	6	470988	470993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_015733	TCAG	2	8	471000	471007	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_015733	C	6	6	471048	471053	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1043	NC_015733	A	6	6	471240	471245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_015733	AAT	2	6	472862	472867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_015733	TG	3	6	472921	472926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_015733	TTA	2	6	478931	478936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_015733	ATA	2	6	479010	479015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_015733	CGT	2	6	482631	482636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_015733	TGC	2	6	482714	482719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_015733	GCT	2	6	482780	482785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_015733	GA	3	6	485919	485924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_015733	ACA	2	6	485962	485967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_015733	GAT	2	6	485981	485986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_015733	TC	3	6	485992	485997	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_015733	GTCTA	2	10	486029	486038	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1056	NC_015733	CAA	2	6	486055	486060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_015733	GA	3	6	487226	487231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_015733	ATA	2	6	487232	487237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_015733	GCA	2	6	488391	488396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_015733	GC	3	6	490678	490683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_015733	CCGT	2	8	492226	492233	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_015733	TGC	2	6	492247	492252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_015733	TGC	2	6	493812	493817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_015733	CTC	2	6	494815	494820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_015733	TCG	2	6	494877	494882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_015733	TGG	2	6	494914	494919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_015733	CTG	2	6	494952	494957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_015733	CAC	2	6	494986	494991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_015733	TCCC	2	8	497001	497008	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1070	NC_015733	CGC	2	6	497049	497054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_015733	CGTTGG	2	12	497147	497158	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1072	NC_015733	GCCC	2	8	497192	497199	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1073	NC_015733	T	6	6	499814	499819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_015733	GAT	2	6	499864	499869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_015733	A	8	8	499930	499937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_015733	ACC	2	6	501979	501984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_015733	GTC	2	6	506459	506464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_015733	TAG	2	6	506468	506473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_015733	GTT	2	6	506504	506509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_015733	TAT	2	6	506528	506533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_015733	GCC	2	6	507610	507615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_015733	CGT	2	6	507634	507639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_015733	CGC	2	6	508125	508130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_015733	GCG	2	6	508139	508144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_015733	ATGA	2	8	510720	510727	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_015733	ATG	2	6	510729	510734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_015733	CGC	2	6	510793	510798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_015733	GT	3	6	510803	510808	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_015733	TA	3	6	512114	512119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_015733	GCTTT	2	10	512147	512156	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1091	NC_015733	CTT	2	6	512250	512255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_015733	CAA	2	6	512262	512267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_015733	GTT	2	6	512273	512278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_015733	GAT	2	6	512324	512329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_015733	GA	3	6	512374	512379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_015733	GC	3	6	512469	512474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_015733	GGC	2	6	512704	512709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_015733	GCG	2	6	512762	512767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_015733	CGA	2	6	512937	512942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_015733	GAT	2	6	512962	512967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_015733	GCA	2	6	513011	513016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_015733	GT	3	6	513064	513069	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_015733	GAA	2	6	513070	513075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_015733	GGA	2	6	513106	513111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_015733	CAG	2	6	513179	513184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_015733	GC	3	6	513235	513240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_015733	GGT	2	6	513244	513249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_015733	GTG	2	6	513328	513333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_015733	AGGA	2	8	513368	513375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_015733	ACC	2	6	513394	513399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_015733	GAA	2	6	513633	513638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_015733	TGC	2	6	513709	513714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_015733	GTC	2	6	513721	513726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_015733	TCGTG	2	10	513730	513739	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1115	NC_015733	TGG	2	6	513799	513804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_015733	GGA	2	6	513835	513840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_015733	TCA	2	6	513860	513865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_015733	AC	3	6	513886	513891	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_015733	AC	3	6	514055	514060	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_015733	GGA	2	6	514115	514120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_015733	CCT	2	6	514196	514201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_015733	CGA	2	6	514206	514211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_015733	CTG	2	6	514219	514224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_015733	TGT	2	6	514289	514294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_015733	GATA	2	8	514381	514388	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_015733	CTG	2	6	514409	514414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_015733	GTC	2	6	514482	514487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_015733	GAA	2	6	514529	514534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_015733	TAG	2	6	514760	514765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_015733	GCGA	2	8	514768	514775	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1131	NC_015733	G	6	6	514917	514922	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_015733	TCC	2	6	514927	514932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_015733	TAC	2	6	514942	514947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_015733	TGAC	2	8	514948	514955	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1135	NC_015733	ACTG	2	8	515229	515236	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1143	NC_015733	AGTCG	2	10	515618	515627	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1407	NC_015733	GTCA	2	8	660823	660830	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1408	NC_015733	GGAT	2	8	660901	660908	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_015733	ATG	2	6	661619	661624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_015733	TCC	2	6	662280	662285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1411	NC_015733	CGG	2	6	662286	662291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1412	NC_015733	TGC	2	6	663363	663368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1421	NC_015733	ATC	2	6	673454	673459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1422	NC_015733	CG	5	10	673479	673488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1423	NC_015733	CGC	2	6	673836	673841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1424	NC_015733	TTG	2	6	673891	673896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1428	NC_015733	GCCTCG	2	12	675201	675212	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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1430	NC_015733	CTGA	2	8	675377	675384	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1431	NC_015733	T	6	6	675411	675416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_015733	T	6	6	675518	675523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_015733	TG	3	6	675551	675556	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_015733	GCT	2	6	675561	675566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1436	NC_015733	CAC	2	6	675649	675654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1437	NC_015733	GCG	2	6	675658	675663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1438	NC_015733	T	6	6	675678	675683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1439	NC_015733	CA	3	6	675754	675759	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1440	NC_015733	GCC	2	6	677506	677511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1443	NC_015733	TTG	2	6	678381	678386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_015733	TG	3	6	678422	678427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1448	NC_015733	GTT	2	6	678604	678609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1450	NC_015733	CAA	2	6	680960	680965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1451	NC_015733	CATC	2	8	680966	680973	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1452	NC_015733	CCG	2	6	680998	681003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1453	NC_015733	CTT	2	6	684062	684067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1454	NC_015733	CAA	2	6	684074	684079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1455	NC_015733	GTT	2	6	684085	684090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1456	NC_015733	GAT	2	6	684137	684142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1458	NC_015733	A	6	6	684234	684239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1467	NC_015733	GGA	2	6	684920	684925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1468	NC_015733	CAG	2	6	684993	684998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1470	NC_015733	GGT	2	6	685058	685063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1471	NC_015733	GTG	2	6	685142	685147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1500	NC_015733	AC	3	6	687269	687274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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