MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 15562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_015733	GCC	2	6	3857745	3857750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10502	NC_015733	CTGC	2	8	3857761	3857768	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10503	NC_015733	TCC	2	6	3858604	3858609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10504	NC_015733	CGT	2	6	3858612	3858617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10505	NC_015733	GGC	2	6	3860369	3860374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10506	NC_015733	CTCG	2	8	3862865	3862872	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10507	NC_015733	CCGT	2	8	3862893	3862900	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10508	NC_015733	AGG	2	6	3862905	3862910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_015733	CGA	2	6	3863482	3863487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10510	NC_015733	TAC	2	6	3863519	3863524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10511	NC_015733	CGC	2	6	3863553	3863558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10512	NC_015733	TGG	2	6	3863598	3863603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10513	NC_015733	CTG	2	6	3863612	3863617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10514	NC_015733	CGC	2	6	3864632	3864637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10515	NC_015733	GAA	2	6	3866045	3866050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_015733	CT	3	6	3867559	3867564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10517	NC_015733	TCT	2	6	3867573	3867578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10518	NC_015733	GTT	2	6	3867580	3867585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_015733	AAGT	2	8	3867663	3867670	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10520	NC_015733	CAGC	2	8	3867691	3867698	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10521	NC_015733	AAT	2	6	3867702	3867707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10522	NC_015733	GCCC	2	8	3867830	3867837	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10523	NC_015733	GAA	2	6	3867843	3867848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10524	NC_015733	GCT	2	6	3869345	3869350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10525	NC_015733	TGC	2	6	3869391	3869396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10526	NC_015733	ACA	2	6	3869458	3869463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10527	NC_015733	AG	3	6	3869534	3869539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_015733	TCT	2	6	3872197	3872202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10529	NC_015733	GCT	2	6	3872305	3872310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10530	NC_015733	GCA	2	6	3872357	3872362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10531	NC_015733	GCT	2	6	3873492	3873497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10532	NC_015733	AAAT	2	8	3878000	3878007	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10533	NC_015733	ACA	2	6	3878009	3878014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10534	NC_015733	CGA	2	6	3878061	3878066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10535	NC_015733	CGG	2	6	3878068	3878073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10536	NC_015733	A	6	6	3878087	3878092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_015733	GT	3	6	3878175	3878180	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_015733	CAGC	2	8	3881986	3881993	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10539	NC_015733	GCC	2	6	3881998	3882003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10540	NC_015733	CCAG	2	8	3882027	3882034	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10541	NC_015733	CAG	2	6	3882036	3882041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10542	NC_015733	GAC	2	6	3884505	3884510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10543	NC_015733	CCGCC	2	10	3884552	3884561	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
10544	NC_015733	ATA	2	6	3884684	3884689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_015733	TCC	2	6	3884730	3884735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10546	NC_015733	CTGG	2	8	3884809	3884816	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10547	NC_015733	GCA	2	6	3884904	3884909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10548	NC_015733	TC	3	6	3884947	3884952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10549	NC_015733	A	7	7	3884999	3885005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_015733	CCA	2	6	3885087	3885092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10551	NC_015733	GC	3	6	3885134	3885139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10552	NC_015733	AG	3	6	3885182	3885187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_015733	GA	3	6	3885241	3885246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10554	NC_015733	CTCC	2	8	3893787	3893794	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10555	NC_015733	ACC	2	6	3893795	3893800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10556	NC_015733	GAG	2	6	3896141	3896146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10557	NC_015733	GCA	2	6	3896964	3896969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10558	NC_015733	CAA	2	6	3897017	3897022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10559	NC_015733	GCG	2	6	3897075	3897080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10560	NC_015733	GC	3	6	3897148	3897153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10561	NC_015733	ACA	2	6	3897212	3897217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10562	NC_015733	GC	3	6	3904089	3904094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10563	NC_015733	ACC	2	6	3904117	3904122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10564	NC_015733	TGG	2	6	3906163	3906168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10565	NC_015733	A	7	7	3906206	3906212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10566	NC_015733	GCA	2	6	3906247	3906252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10567	NC_015733	GCAG	2	8	3906463	3906470	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10568	NC_015733	GCA	2	6	3906570	3906575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10569	NC_015733	CTT	2	6	3908275	3908280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10570	NC_015733	GTT	2	6	3908284	3908289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10571	NC_015733	AAGC	2	8	3908303	3908310	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10572	NC_015733	TTTACG	2	12	3908330	3908341	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10573	NC_015733	TGA	2	6	3908348	3908353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10574	NC_015733	CAC	2	6	3908424	3908429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10575	NC_015733	ATC	2	6	3908464	3908469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10576	NC_015733	CTG	2	6	3908488	3908493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10577	NC_015733	CAAGAA	2	12	3908564	3908575	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10578	NC_015733	GCC	2	6	3914158	3914163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10579	NC_015733	GCA	2	6	3914266	3914271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10580	NC_015733	GCA	2	6	3914967	3914972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10581	NC_015733	TAT	2	6	3915696	3915701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10582	NC_015733	AAGA	2	8	3916094	3916101	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10583	NC_015733	GA	3	6	3916105	3916110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10584	NC_015733	T	7	7	3916172	3916178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10585	NC_015733	TAT	3	9	3916219	3916227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10586	NC_015733	CTG	2	6	3916250	3916255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10587	NC_015733	TCA	2	6	3916293	3916298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10588	NC_015733	T	8	8	3916337	3916344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10589	NC_015733	GC	3	6	3916374	3916379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10590	NC_015733	AATC	2	8	3916445	3916452	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10591	NC_015733	TCCC	2	8	3916496	3916503	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10592	NC_015733	CTT	2	6	3918301	3918306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10593	NC_015733	AGT	2	6	3918318	3918323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10594	NC_015733	TTG	2	6	3918431	3918436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10595	NC_015733	TTA	2	6	3918438	3918443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10596	NC_015733	CTG	2	6	3918472	3918477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10597	NC_015733	TGT	2	6	3918509	3918514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10598	NC_015733	T	7	7	3919525	3919531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10599	NC_015733	AGG	2	6	3919545	3919550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10600	NC_015733	CAA	3	9	3919617	3919625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10601	NC_015733	AAC	2	6	3920448	3920453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10602	NC_015733	GCG	2	6	3923661	3923666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10603	NC_015733	ATG	2	6	3923731	3923736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10605	NC_015733	CGA	2	6	3923778	3923783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10606	NC_015733	GAA	2	6	3926665	3926670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10607	NC_015733	C	6	6	3926794	3926799	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10608	NC_015733	ACA	2	6	3927638	3927643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10609	NC_015733	ATA	2	6	3928126	3928131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10610	NC_015733	ACA	2	6	3928155	3928160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10611	NC_015733	TTG	2	6	3928177	3928182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10612	NC_015733	T	8	8	3928192	3928199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10613	NC_015733	TCT	2	6	3928216	3928221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10614	NC_015733	GA	3	6	3930863	3930868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10615	NC_015733	AAG	2	6	3931002	3931007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10616	NC_015733	TGAA	2	8	3931086	3931093	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10617	NC_015733	GAA	3	9	3931091	3931099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10618	NC_015733	GA	3	6	3931272	3931277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10619	NC_015733	CTACA	2	10	3931283	3931292	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10620	NC_015733	CAC	2	6	3931330	3931335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10621	NC_015733	CCG	2	6	3931392	3931397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10622	NC_015733	GCC	2	6	3931422	3931427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10623	NC_015733	GAC	2	6	3931521	3931526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10624	NC_015733	AG	3	6	3931550	3931555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10625	NC_015733	GGA	2	6	3931577	3931582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10626	NC_015733	GACAT	2	10	3931610	3931619	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10627	NC_015733	ATA	2	6	3931817	3931822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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