MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 15562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015733	GCCA	2	8	223974	223981	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
502	NC_015733	GGC	2	6	224067	224072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_015733	CGC	2	6	224079	224084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_015733	GCCG	2	8	224121	224128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
505	NC_015733	GGT	2	6	224142	224147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015733	GCTC	2	8	224214	224221	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
507	NC_015733	CGC	2	6	224409	224414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_015733	CGGC	2	8	224421	224428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
509	NC_015733	GCG	2	6	224434	224439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_015733	CAG	2	6	224449	224454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_015733	CG	3	6	224508	224513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
512	NC_015733	ACGCC	2	10	224616	224625	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
513	NC_015733	CG	3	6	224626	224631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
514	NC_015733	CGT	2	6	224634	224639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_015733	GGTG	2	8	224712	224719	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
516	NC_015733	GC	3	6	224761	224766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_015733	GTT	2	6	224770	224775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015733	TCA	2	6	224783	224788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_015733	G	6	6	224797	224802	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
520	NC_015733	CAG	2	6	224842	224847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_015733	TTC	2	6	224884	224889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_015733	GGCTCG	2	12	224924	224935	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_015733	CAG	2	6	224962	224967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_015733	GTT	2	6	224986	224991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015733	TGAAT	2	10	225051	225060	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
526	NC_015733	TTC	2	6	225088	225093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_015733	TCT	2	6	225117	225122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_015733	AGC	2	6	226530	226535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_015733	GTA	2	6	226595	226600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015733	ACCT	2	8	226621	226628	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
531	NC_015733	ATT	2	6	226658	226663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015733	T	6	6	226702	226707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_015733	CGG	2	6	226795	226800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_015733	CGCA	2	8	226867	226874	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
535	NC_015733	T	6	6	226921	226926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_015733	ACC	2	6	229767	229772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_015733	ACC	2	6	230124	230129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_015733	CCT	2	6	230136	230141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_015733	CAC	2	6	230160	230165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_015733	GAC	2	6	230183	230188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_015733	TGCA	2	8	234610	234617	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
542	NC_015733	CGA	2	6	234631	234636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_015733	GGT	2	6	234658	234663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015733	CAC	2	6	234692	234697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_015733	TCC	2	6	234845	234850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_015733	TTTC	2	8	234858	234865	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
547	NC_015733	CACAG	2	10	234989	234998	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
548	NC_015733	T	7	7	235038	235044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015733	CAG	2	6	235069	235074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_015733	TGG	2	6	236679	236684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015733	T	8	8	238111	238118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_015733	TGC	2	6	242810	242815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_015733	CTC	2	6	242894	242899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_015733	CAC	2	6	242935	242940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_015733	TGT	2	6	242953	242958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015733	GCG	2	6	242985	242990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_015733	CACC	2	8	243152	243159	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
558	NC_015733	TCG	2	6	243171	243176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_015733	GGCC	2	8	244523	244530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
560	NC_015733	GGC	2	6	244563	244568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_015733	GGC	2	6	245670	245675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_015733	CGG	2	6	245705	245710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_015733	GAG	2	6	246921	246926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015733	AAAT	2	8	246950	246957	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_015733	GAA	2	6	249024	249029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_015733	AGC	2	6	254272	254277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_015733	GTGATC	2	12	255583	255594	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
568	NC_015733	TG	3	6	255651	255656	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015733	GGT	2	6	255664	255669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_015733	TA	3	6	255676	255681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_015733	AACT	2	8	255708	255715	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
572	NC_015733	AT	4	8	255723	255730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_015733	AGG	2	6	255734	255739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_015733	TCG	2	6	256867	256872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_015733	GAG	2	6	256917	256922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_015733	CTC	3	9	256978	256986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_015733	TTG	2	6	259276	259281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_015733	AGT	2	6	259286	259291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_015733	GCT	2	6	259312	259317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_015733	A	6	6	259334	259339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015733	GCTG	2	8	259374	259381	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
582	NC_015733	GTT	2	6	259455	259460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_015733	T	6	6	259459	259464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015733	GGAT	2	8	259470	259477	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
585	NC_015733	GGCCT	2	10	259601	259610	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
586	NC_015733	CAGG	2	8	259635	259642	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
587	NC_015733	A	6	6	260768	260773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_015733	AGG	2	6	260799	260804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_015733	CGA	2	6	260846	260851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_015733	CTG	2	6	262977	262982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_015733	CGGT	2	8	265510	265517	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
592	NC_015733	GTG	2	6	266526	266531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_015733	ATAA	2	8	266568	266575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_015733	T	6	6	266577	266582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_015733	ATG	2	6	266645	266650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_015733	TGC	2	6	266662	266667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_015733	T	6	6	266673	266678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_015733	ATG	2	6	266739	266744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_015733	GCT	2	6	266750	266755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_015733	GCA	2	6	266953	266958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_015733	CCA	2	6	266966	266971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_015733	AAG	2	6	268356	268361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_015733	T	6	6	268380	268385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_015733	TATT	2	8	268428	268435	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_015733	TTTTTA	2	12	268437	268448	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_015733	T	6	6	269208	269213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_015733	CTG	2	6	269218	269223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_015733	CTT	2	6	269236	269241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_015733	AATA	2	8	269351	269358	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_015733	A	6	6	269363	269368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015733	AT	3	6	269381	269386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_015733	GTC	2	6	269441	269446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_015733	GGT	2	6	269453	269458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_015733	CAC	2	6	270045	270050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_015733	TCT	2	6	270123	270128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_015733	GCG	2	6	270155	270160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_015733	GCC	2	6	271100	271105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_015733	C	6	6	271115	271120	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
619	NC_015733	GAG	2	6	271123	271128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_015733	GCT	2	6	274177	274182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_015733	GAA	2	6	276531	276536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_015733	CAG	2	6	276571	276576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_015733	CTG	2	6	276587	276592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_015733	ACC	2	6	279332	279337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_015733	CGG	2	6	279379	279384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_015733	GCA	2	6	279497	279502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_015733	GCG	2	6	279521	279526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_015733	GCA	2	6	281710	281715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_015733	GGT	2	6	283132	283137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_015733	CGG	2	6	283150	283155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_015733	T	6	6	283159	283164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_015733	GTA	2	6	283181	283186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_015733	AGC	2	6	284482	284487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_015733	ACC	2	6	284513	284518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_015733	TCA	2	6	284641	284646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_015733	AGG	2	6	285623	285628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_015733	T	7	7	285636	285642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_015733	T	6	6	285669	285674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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