MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 15562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_015733	TAC	2	6	3214147	3214152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8502	NC_015733	TA	4	8	3214155	3214162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_015733	TAC	2	6	3214191	3214196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8504	NC_015733	GCT	2	6	3214223	3214228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8505	NC_015733	ACA	2	6	3214859	3214864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8506	NC_015733	TCAGT	2	10	3215177	3215186	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8507	NC_015733	TGC	2	6	3215206	3215211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8508	NC_015733	GA	3	6	3215223	3215228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_015733	GC	3	6	3215259	3215264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8510	NC_015733	TGC	2	6	3215280	3215285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8511	NC_015733	CCCGT	2	10	3215317	3215326	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8512	NC_015733	A	6	6	3215385	3215390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_015733	CATG	2	8	3215457	3215464	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8514	NC_015733	TCA	2	6	3215486	3215491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8515	NC_015733	ATTTA	2	10	3215575	3215584	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8516	NC_015733	TCG	2	6	3215623	3215628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8517	NC_015733	TACA	2	8	3215668	3215675	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8518	NC_015733	A	6	6	3215707	3215712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8519	NC_015733	CAG	2	6	3215729	3215734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8520	NC_015733	ACC	2	6	3215748	3215753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8521	NC_015733	GCC	2	6	3215818	3215823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8522	NC_015733	ACA	2	6	3215890	3215895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8523	NC_015733	CGA	2	6	3215897	3215902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8524	NC_015733	CAG	2	6	3215922	3215927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8525	NC_015733	CAC	2	6	3216015	3216020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8526	NC_015733	ACG	2	6	3216028	3216033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8527	NC_015733	CCG	2	6	3216058	3216063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8528	NC_015733	CGC	3	9	3216101	3216109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8529	NC_015733	GTACGG	2	12	3216220	3216231	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8530	NC_015733	GCT	2	6	3216274	3216279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8531	NC_015733	CGC	2	6	3216310	3216315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8532	NC_015733	GCAG	2	8	3216358	3216365	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8533	NC_015733	GCC	2	6	3216398	3216403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8534	NC_015733	GC	3	6	3216416	3216421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8535	NC_015733	ATG	2	6	3216503	3216508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_015733	TGC	2	6	3216580	3216585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8537	NC_015733	GCA	2	6	3216601	3216606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8538	NC_015733	CAGC	2	8	3216625	3216632	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8539	NC_015733	GAT	2	6	3216655	3216660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8540	NC_015733	CAG	2	6	3216668	3216673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8541	NC_015733	GCC	2	6	3216698	3216703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8542	NC_015733	CAA	2	6	3216731	3216736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8543	NC_015733	CCG	2	6	3216753	3216758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8544	NC_015733	GCTG	2	8	3216790	3216797	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8545	NC_015733	TGT	2	6	3216817	3216822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_015733	CAA	2	6	3216875	3216880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8547	NC_015733	GGT	2	6	3216917	3216922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_015733	CAA	2	6	3216985	3216990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8549	NC_015733	ACC	2	6	3217076	3217081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8550	NC_015733	GCC	2	6	3217094	3217099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8551	NC_015733	GGT	2	6	3217229	3217234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_015733	CAG	2	6	3217253	3217258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8553	NC_015733	ACG	2	6	3217317	3217322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8554	NC_015733	GCG	2	6	3217332	3217337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8555	NC_015733	TGA	2	6	3217382	3217387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_015733	CGC	2	6	3221001	3221006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8557	NC_015733	CGG	2	6	3221014	3221019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8558	NC_015733	GGT	2	6	3221044	3221049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_015733	CGC	2	6	3221207	3221212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8560	NC_015733	GCA	2	6	3221264	3221269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8561	NC_015733	CAA	2	6	3221329	3221334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8562	NC_015733	AGC	2	6	3221338	3221343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8563	NC_015733	CGC	2	6	3221353	3221358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8564	NC_015733	GAA	2	6	3221467	3221472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_015733	GAC	2	6	3221635	3221640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8566	NC_015733	CCCA	2	8	3221668	3221675	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8567	NC_015733	GC	3	6	3221702	3221707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8568	NC_015733	CGTGAG	2	12	3221746	3221757	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8569	NC_015733	GCA	2	6	3221802	3221807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8570	NC_015733	GCA	2	6	3221823	3221828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8571	NC_015733	CAG	2	6	3221923	3221928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8572	NC_015733	CAA	2	6	3221941	3221946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8573	NC_015733	CAG	2	6	3221956	3221961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8574	NC_015733	CAG	2	6	3221968	3221973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8575	NC_015733	GCA	2	6	3221976	3221981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8576	NC_015733	CACC	2	8	3221999	3222006	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8577	NC_015733	GC	3	6	3222030	3222035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8578	NC_015733	GGC	2	6	3222043	3222048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8579	NC_015733	ACG	2	6	3222056	3222061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8580	NC_015733	GAT	2	6	3222132	3222137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8581	NC_015733	CAG	2	6	3222175	3222180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8582	NC_015733	CGTCC	2	10	3222243	3222252	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8583	NC_015733	CAG	2	6	3222271	3222276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8584	NC_015733	CAC	2	6	3222284	3222289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8585	NC_015733	GCT	2	6	3222313	3222318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8586	NC_015733	GGT	2	6	3222440	3222445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8587	NC_015733	TGCG	2	8	3222543	3222550	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8588	NC_015733	GC	3	6	3222557	3222562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8589	NC_015733	GCC	2	6	3222618	3222623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8590	NC_015733	CCA	2	6	3222691	3222696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8591	NC_015733	ATC	2	6	3222711	3222716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8592	NC_015733	GGA	2	6	3222755	3222760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8593	NC_015733	TGA	2	6	3222849	3222854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8594	NC_015733	CTT	2	6	3222893	3222898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8595	NC_015733	GAT	2	6	3223785	3223790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8596	NC_015733	GCG	2	6	3223795	3223800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8597	NC_015733	GCC	2	6	3223839	3223844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8598	NC_015733	CGG	2	6	3224398	3224403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8599	NC_015733	AGT	2	6	3224418	3224423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8600	NC_015733	CGG	2	6	3224439	3224444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8601	NC_015733	TCG	2	6	3224453	3224458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8602	NC_015733	TCG	2	6	3224501	3224506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8603	NC_015733	CGG	2	6	3224514	3224519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8604	NC_015733	ACC	2	6	3224549	3224554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8605	NC_015733	GGC	2	6	3224557	3224562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8606	NC_015733	GCTG	2	8	3224691	3224698	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8607	NC_015733	CAA	2	6	3224724	3224729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8608	NC_015733	GCC	2	6	3224797	3224802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8609	NC_015733	CACG	2	8	3224833	3224840	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8610	NC_015733	TTTTC	2	10	3226668	3226677	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8611	NC_015733	GGCT	2	8	3226679	3226686	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8612	NC_015733	GGC	2	6	3226700	3226705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8613	NC_015733	GCG	2	6	3226807	3226812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8614	NC_015733	GTG	2	6	3226845	3226850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8615	NC_015733	CTT	2	6	3226879	3226884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8616	NC_015733	TCA	2	6	3226933	3226938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8617	NC_015733	AG	3	6	3227006	3227011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8618	NC_015733	GCT	2	6	3227012	3227017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8619	NC_015733	ATT	2	6	3227134	3227139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8620	NC_015733	GAC	2	6	3228178	3228183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8621	NC_015733	TGT	2	6	3228215	3228220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8622	NC_015733	TAC	2	6	3228226	3228231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8623	NC_015733	AGC	2	6	3228298	3228303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8624	NC_015733	CG	3	6	3228307	3228312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8625	NC_015733	CGC	2	6	3228315	3228320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8626	NC_015733	TCG	2	6	3228374	3228379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8628	NC_015733	TGA	2	6	3228416	3228421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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