MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 15562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015733	TGG	2	6	2257076	2257081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_015733	AGC	2	6	2257165	2257170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_015733	TG	3	6	2257822	2257827	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_015733	AGC	2	6	2257871	2257876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_015733	CTG	2	6	2257887	2257892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_015733	GCT	2	6	2257911	2257916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_015733	CG	3	6	2257987	2257992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5508	NC_015733	GAA	2	6	2258031	2258036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_015733	GTAA	2	8	2258781	2258788	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_015733	GGC	2	6	2258850	2258855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_015733	TC	4	8	2259960	2259967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5512	NC_015733	GTT	2	6	2259982	2259987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_015733	GC	3	6	2260025	2260030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5514	NC_015733	GC	3	6	2260068	2260073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5515	NC_015733	CAA	2	6	2260094	2260099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_015733	CA	3	6	2260100	2260105	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5517	NC_015733	GCC	2	6	2260114	2260119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5518	NC_015733	GCC	2	6	2260143	2260148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5519	NC_015733	A	6	6	2260215	2260220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_015733	A	6	6	2260328	2260333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_015733	TCG	2	6	2266228	2266233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_015733	CTT	2	6	2267655	2267660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_015733	CAA	2	6	2267793	2267798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_015733	AGG	2	6	2267843	2267848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_015733	A	7	7	2268301	2268307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_015733	GCA	2	6	2268342	2268347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_015733	A	7	7	2268353	2268359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_015733	T	7	7	2268377	2268383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_015733	T	6	6	2268633	2268638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_015733	GTG	2	6	2268641	2268646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_015733	CAT	2	6	2268678	2268683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_015733	TCA	2	6	2269104	2269109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_015733	GCG	2	6	2269165	2269170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_015733	T	6	6	2269256	2269261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_015733	AGGC	2	8	2269316	2269323	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5536	NC_015733	CAC	2	6	2269394	2269399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5537	NC_015733	AGGAG	2	10	2269401	2269410	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_015733	TGA	2	6	2271910	2271915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_015733	TAGA	2	8	2272154	2272161	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_015733	CGG	2	6	2272548	2272553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_015733	C	6	6	2276386	2276391	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5542	NC_015733	AGTG	2	8	2276424	2276431	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_015733	TGC	2	6	2276456	2276461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_015733	GCG	2	6	2276502	2276507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_015733	CGG	2	6	2276515	2276520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_015733	TAT	2	6	2276521	2276526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_015733	T	6	6	2276737	2276742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_015733	AGG	2	6	2276764	2276769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_015733	TTC	2	6	2276780	2276785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_015733	T	7	7	2276943	2276949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_015733	TTG	2	6	2276963	2276968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_015733	CGGT	2	8	2277044	2277051	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5553	NC_015733	CTG	2	6	2277080	2277085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_015733	G	6	6	2277169	2277174	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_015733	TGA	2	6	2277194	2277199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_015733	GAG	2	6	2277265	2277270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_015733	GCT	2	6	2277288	2277293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_015733	TTG	2	6	2277324	2277329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_015733	GAA	2	6	2277391	2277396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_015733	GCT	2	6	2277513	2277518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_015733	CTT	2	6	2277672	2277677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_015733	ACCC	2	8	2277710	2277717	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5563	NC_015733	GCT	2	6	2277741	2277746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_015733	CGT	2	6	2277794	2277799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_015733	TCAG	2	8	2280200	2280207	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5566	NC_015733	CAA	2	6	2280245	2280250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_015733	AG	3	6	2280307	2280312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_015733	TCC	2	6	2281348	2281353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5569	NC_015733	TTGG	2	8	2281359	2281366	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_015733	TTTC	2	8	2281471	2281478	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5571	NC_015733	CGT	2	6	2281512	2281517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_015733	CGG	2	6	2282452	2282457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_015733	GGGGC	2	10	2283215	2283224	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5574	NC_015733	CGGG	2	8	2283233	2283240	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5575	NC_015733	GCA	2	6	2283242	2283247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5576	NC_015733	GC	3	6	2283365	2283370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5577	NC_015733	GGA	2	6	2283389	2283394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_015733	GCA	2	6	2283505	2283510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_015733	TTG	2	6	2285334	2285339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_015733	GT	3	6	2287785	2287790	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_015733	CTG	2	6	2287900	2287905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_015733	TCT	2	6	2287951	2287956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_015733	CGGG	2	8	2289601	2289608	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5584	NC_015733	GC	3	6	2290319	2290324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5585	NC_015733	CAG	2	6	2290329	2290334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_015733	ATCCT	2	10	2290994	2291003	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5587	NC_015733	TTAGT	2	10	2291023	2291032	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_015733	GCC	2	6	2291043	2291048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5589	NC_015733	TAGA	2	8	2291054	2291061	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_015733	GAA	2	6	2291615	2291620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_015733	CG	3	6	2291648	2291653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5592	NC_015733	TGC	2	6	2291756	2291761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_015733	CAT	2	6	2291783	2291788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_015733	GC	3	6	2291881	2291886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5595	NC_015733	ATC	2	6	2291901	2291906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_015733	AGC	2	6	2291975	2291980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_015733	AG	3	6	2292020	2292025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_015733	GGA	2	6	2292578	2292583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_015733	ATT	2	6	2292587	2292592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_015733	TTA	2	6	2292600	2292605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_015733	GGA	2	6	2292711	2292716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_015733	CAT	2	6	2292747	2292752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_015733	AGT	2	6	2292756	2292761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_015733	GC	3	6	2292845	2292850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5605	NC_015733	CAC	2	6	2292945	2292950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5606	NC_015733	ACTG	2	8	2293019	2293026	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5607	NC_015733	AAT	2	6	2293064	2293069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_015733	GA	3	6	2293126	2293131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_015733	TCG	2	6	2293252	2293257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_015733	ATT	2	6	2293294	2293299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_015733	GCA	2	6	2293390	2293395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_015733	AATG	2	8	2293439	2293446	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_015733	AGC	2	6	2293472	2293477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_015733	AGC	2	6	2293542	2293547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_015733	A	7	7	2293634	2293640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_015733	GTA	2	6	2293659	2293664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_015733	CAT	2	6	2293670	2293675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_015733	GCG	2	6	2293684	2293689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_015733	ATTG	2	8	2293704	2293711	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_015733	C	7	7	2293772	2293778	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5621	NC_015733	CTG	2	6	2293965	2293970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_015733	CAG	2	6	2293992	2293997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_015733	GCC	2	6	2294056	2294061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5624	NC_015733	TGC	2	6	2294062	2294067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_015733	AAT	2	6	2294089	2294094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_015733	GC	3	6	2294097	2294102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5627	NC_015733	CCA	2	6	2294138	2294143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5628	NC_015733	GCT	2	6	2294160	2294165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5629	NC_015733	CCT	2	6	2294189	2294194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5631	NC_015733	ATC	2	6	2294251	2294256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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