MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 15562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015733	CGA	2	6	2067226	2067231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_015733	GAT	2	6	2067251	2067256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_015733	GCA	2	6	2067300	2067305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_015733	GT	3	6	2067353	2067358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_015733	GAA	2	6	2067359	2067364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_015733	GGA	2	6	2067395	2067400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_015733	CAG	2	6	2067468	2067473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_015733	GC	3	6	2067524	2067529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5009	NC_015733	GGT	2	6	2067533	2067538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_015733	GTG	2	6	2067617	2067622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_015733	AGGA	2	8	2067657	2067664	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_015733	ACC	2	6	2067683	2067688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_015733	GAA	2	6	2067922	2067927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_015733	TGC	2	6	2067998	2068003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_015733	GTC	2	6	2068010	2068015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_015733	TCGTG	2	10	2068019	2068028	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5017	NC_015733	TGG	2	6	2068088	2068093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_015733	GGA	2	6	2068124	2068129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_015733	TCA	2	6	2068149	2068154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_015733	AC	3	6	2068175	2068180	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5021	NC_015733	AC	3	6	2068344	2068349	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_015733	GGA	2	6	2068404	2068409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_015733	CCT	2	6	2068485	2068490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_015733	CGA	2	6	2068495	2068500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_015733	CTG	2	6	2068508	2068513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_015733	TGT	2	6	2068578	2068583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_015733	GATA	2	8	2068670	2068677	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_015733	CTG	2	6	2068698	2068703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_015733	GTC	2	6	2068771	2068776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_015733	GAA	2	6	2068818	2068823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_015733	TAG	2	6	2069049	2069054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_015733	GCGA	2	8	2069057	2069064	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5033	NC_015733	G	6	6	2069206	2069211	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_015733	TCC	2	6	2069216	2069221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5035	NC_015733	TAC	2	6	2069231	2069236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_015733	TGAC	2	8	2069237	2069244	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5037	NC_015733	ACTG	2	8	2069518	2069525	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5038	NC_015733	ACCGA	2	10	2069530	2069539	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5039	NC_015733	AC	3	6	2069744	2069749	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_015733	CGTC	2	8	2069762	2069769	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5041	NC_015733	AAC	2	6	2069781	2069786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_015733	AGG	2	6	2069855	2069860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_015733	AGC	2	6	2069871	2069876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_015733	AAAG	2	8	2069885	2069892	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_015733	AGTCG	2	10	2069907	2069916	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5046	NC_015733	TGA	2	6	2069976	2069981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_015733	GTTG	2	8	2070251	2070258	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_015733	GGT	2	6	2070270	2070275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_015733	TGA	2	6	2070319	2070324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_015733	CGA	2	6	2070340	2070345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_015733	GGT	2	6	2070420	2070425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_015733	GA	3	6	2070450	2070455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_015733	TTA	2	6	2070576	2070581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_015733	CGG	2	6	2070700	2070705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_015733	GGC	2	6	2070781	2070786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_015733	TGAAAT	2	12	2070809	2070820	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_015733	ACC	2	6	2070971	2070976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5058	NC_015733	TGG	2	6	2071031	2071036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_015733	TCC	2	6	2071057	2071062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5060	NC_015733	GGA	2	6	2071074	2071079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_015733	GC	3	6	2071135	2071140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5062	NC_015733	GGT	2	6	2071194	2071199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_015733	CGG	2	6	2071281	2071286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_015733	TCA	2	6	2071309	2071314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_015733	CGT	2	6	2071389	2071394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_015733	GCT	2	6	2071443	2071448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_015733	ACG	2	6	2071624	2071629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_015733	GT	3	6	2071642	2071647	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_015733	GGT	2	6	2071736	2071741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_015733	AAC	2	6	2071750	2071755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_015733	GAC	2	6	2071837	2071842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_015733	ACC	2	6	2071857	2071862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5073	NC_015733	ATCCC	2	10	2071865	2071874	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5074	NC_015733	CAG	2	6	2071880	2071885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_015733	A	6	6	2072007	2072012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_015733	CGC	2	6	2072024	2072029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5077	NC_015733	CCA	2	6	2072078	2072083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5078	NC_015733	CGG	2	6	2072098	2072103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_015733	CGCC	2	8	2072119	2072126	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5080	NC_015733	GCAA	2	8	2075348	2075355	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5081	NC_015733	CCA	2	6	2075481	2075486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5082	NC_015733	TTG	2	6	2077874	2077879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_015733	GCA	2	6	2077894	2077899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_015733	A	6	6	2077931	2077936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_015733	CAGC	2	8	2079307	2079314	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5086	NC_015733	T	7	7	2079322	2079328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_015733	TTA	2	6	2079350	2079355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_015733	TGC	2	6	2079369	2079374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_015733	GGCA	2	8	2079470	2079477	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5090	NC_015733	GCG	2	6	2080096	2080101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_015733	AT	3	6	2080148	2080153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_015733	AT	3	6	2080164	2080169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_015733	AAC	2	6	2081742	2081747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_015733	GCG	2	6	2081908	2081913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_015733	GACT	2	8	2081914	2081921	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5096	NC_015733	ACA	2	6	2081940	2081945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_015733	GCT	2	6	2083032	2083037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_015733	C	6	6	2083128	2083133	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5099	NC_015733	GAGGG	2	10	2085049	2085058	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_015733	GC	3	6	2085063	2085068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5101	NC_015733	GACG	2	8	2085158	2085165	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5102	NC_015733	CCT	2	6	2086054	2086059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5103	NC_015733	AGA	2	6	2086063	2086068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_015733	GCT	2	6	2086076	2086081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_015733	GCA	2	6	2086601	2086606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_015733	GCT	2	6	2086611	2086616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_015733	AGC	2	6	2086662	2086667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_015733	TGC	2	6	2086672	2086677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_015733	GGT	2	6	2087789	2087794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_015733	CGG	2	6	2087840	2087845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_015733	GAC	2	6	2089319	2089324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_015733	GGGA	2	8	2090698	2090705	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_015733	ATT	2	6	2090763	2090768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_015733	ATCAG	2	10	2090967	2090976	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5115	NC_015733	TGAA	2	8	2091182	2091189	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_015733	CTT	2	6	2094963	2094968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_015733	AGA	2	6	2094971	2094976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_015733	GCCT	2	8	2096324	2096331	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5119	NC_015733	GGC	2	6	2096332	2096337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_015733	A	7	7	2096361	2096367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_015733	G	6	6	2096421	2096426	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_015733	GA	3	6	2096496	2096501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_015733	TGG	2	6	2096519	2096524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_015733	CTGG	2	8	2096629	2096636	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5125	NC_015733	CCTGT	2	10	2098777	2098786	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5126	NC_015733	TTG	2	6	2098791	2098796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_015733	GTT	2	6	2098831	2098836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_015733	GTT	2	6	2098861	2098866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_015733	GCG	2	6	2098936	2098941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_015733	CTT	2	6	2104950	2104955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_015733	TCT	2	6	2104990	2104995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_015733	GC	3	6	2105002	2105007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5133	NC_015733	A	8	8	2105069	2105076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5250	NC_015733	CACCC	2	10	2159176	2159185	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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5260	NC_015733	GGCAG	2	10	2164595	2164604	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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5263	NC_015733	TCC	2	6	2165406	2165411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5264	NC_015733	GGA	2	6	2165445	2165450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5265	NC_015733	GCGG	2	8	2165472	2165479	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5266	NC_015733	TCGCC	2	10	2165494	2165503	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5267	NC_015733	T	6	6	2165529	2165534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5268	NC_015733	T	7	7	2165540	2165546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5269	NC_015733	TGT	2	6	2165574	2165579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5285	NC_015733	GACGC	2	10	2171767	2171776	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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5295	NC_015733	ACC	2	6	2176922	2176927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5378	NC_015733	TCG	2	6	2221117	2221122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5384	NC_015733	TC	3	6	2224529	2224534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5385	NC_015733	TG	3	6	2225176	2225181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5386	NC_015733	GT	3	6	2225189	2225194	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5387	NC_015733	GGGGT	2	10	2225196	2225205	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
5388	NC_015733	GT	3	6	2225213	2225218	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5389	NC_015733	CGG	2	6	2225219	2225224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5392	NC_015733	GCT	2	6	2225353	2225358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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