MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Parachlamydia acanthamoebae UV-7 chromosome

Total Repeats: 6873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015702	TGAT	2	8	215483	215490	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
502	NC_015702	CAA	2	6	215505	215510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_015702	G	6	6	215603	215608	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
504	NC_015702	AAT	2	6	216235	216240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_015702	ATTA	2	8	216284	216291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015702	TTGA	2	8	216312	216319	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015702	TAA	2	6	216336	216341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015702	CAT	2	6	216709	216714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_015702	AT	3	6	218889	218894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_015702	ATTC	2	8	218926	218933	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
511	NC_015702	TGT	2	6	222102	222107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015702	AT	3	6	225135	225140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_015702	TGC	2	6	225160	225165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_015702	TAAA	2	8	225183	225190	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_015702	AG	3	6	225199	225204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
516	NC_015702	ATT	2	6	225325	225330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_015702	ATG	2	6	225357	225362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015702	ATT	2	6	225428	225433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_015702	GA	3	6	225551	225556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_015702	AAC	2	6	225644	225649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_015702	ATTA	2	8	225660	225667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_015702	CATT	2	8	225670	225677	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
523	NC_015702	A	6	6	225703	225708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_015702	TTTTTA	2	12	225713	225724	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015702	AAGG	2	8	225805	225812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
526	NC_015702	AG	4	8	225832	225839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015702	A	6	6	226535	226540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015702	T	8	8	228179	228186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015702	TTTC	2	8	228222	228229	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
530	NC_015702	A	6	6	228246	228251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_015702	T	6	6	228262	228267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015702	T	7	7	228291	228297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_015702	ACCA	2	8	228325	228332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
534	NC_015702	TTA	2	6	228335	228340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015702	TGC	2	6	228376	228381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_015702	GAG	2	6	228409	228414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_015702	CCA	2	6	228890	228895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_015702	ATT	2	6	228923	228928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_015702	A	6	6	231500	231505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_015702	AG	3	6	231518	231523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
541	NC_015702	ATG	2	6	231536	231541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_015702	TTC	2	6	231565	231570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_015702	T	6	6	231654	231659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015702	TTA	2	6	231663	231668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_015702	T	7	7	232716	232722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015702	T	6	6	235713	235718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_015702	TCT	2	6	235758	235763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_015702	TCG	2	6	237059	237064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_015702	CCAAG	2	10	237169	237178	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
550	NC_015702	TGT	2	6	237211	237216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015702	CTTT	2	8	237351	237358	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
552	NC_015702	ATA	2	6	237545	237550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_015702	GAAG	2	8	237555	237562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015702	T	7	7	237571	237577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015702	A	6	6	239032	239037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015702	G	8	8	239090	239097	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
557	NC_015702	T	6	6	239141	239146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015702	AAT	2	6	239329	239334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_015702	CAA	2	6	240214	240219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_015702	CCA	2	6	240220	240225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_015702	TAT	3	9	248817	248825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015702	T	7	7	248869	248875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_015702	A	6	6	248900	248905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015702	TCC	2	6	248917	248922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_015702	TTA	2	6	248944	248949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_015702	T	7	7	248994	249000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015702	T	6	6	256313	256318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_015702	TTA	2	6	256324	256329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015702	CAA	2	6	259608	259613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_015702	A	8	8	259693	259700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_015702	ATTT	2	8	263705	263712	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_015702	AAT	2	6	264128	264133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_015702	TTTTG	2	10	268652	268661	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
574	NC_015702	TTC	2	6	268663	268668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_015702	TTTG	2	8	268681	268688	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
576	NC_015702	GA	3	6	268718	268723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
577	NC_015702	GATT	2	8	268729	268736	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
578	NC_015702	AAG	2	6	268778	268783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_015702	T	7	7	268835	268841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_015702	CTT	2	6	268852	268857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_015702	TAT	2	6	268914	268919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015702	GATG	2	8	268924	268931	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
583	NC_015702	T	6	6	268934	268939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015702	ATT	2	6	270985	270990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_015702	TAA	2	6	270998	271003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_015702	GGA	2	6	271014	271019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_015702	TG	3	6	271026	271031	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
588	NC_015702	T	7	7	271052	271058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_015702	ATA	2	6	272797	272802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_015702	A	6	6	272986	272991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_015702	TA	3	6	273046	273051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_015702	T	6	6	273405	273410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_015702	A	6	6	273427	273432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_015702	GAAA	2	8	273457	273464	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
595	NC_015702	A	6	6	273462	273467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_015702	TAC	2	6	273482	273487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_015702	G	10	10	273711	273720	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
598	NC_015702	A	6	6	277153	277158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_015702	ATT	2	6	277171	277176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_015702	TTA	2	6	277197	277202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_015702	TTC	2	6	277227	277232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_015702	TGCAAT	2	12	278568	278579	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
603	NC_015702	CTTA	2	8	278645	278652	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
604	NC_015702	ATA	2	6	278678	278683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_015702	CT	3	6	282449	282454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
606	NC_015702	CTT	2	6	282512	282517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_015702	TAA	2	6	282519	282524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_015702	TGAT	2	8	282568	282575	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
609	NC_015702	GCGAT	2	10	282601	282610	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
610	NC_015702	GTT	2	6	282659	282664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015702	A	7	7	282670	282676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_015702	GTC	2	6	282688	282693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_015702	A	6	6	282702	282707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_015702	AGA	2	6	282720	282725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_015702	A	7	7	282824	282830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_015702	ATCTA	2	10	282878	282887	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
617	NC_015702	T	6	6	282917	282922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_015702	A	7	7	282994	283000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_015702	ATTTT	2	10	284036	284045	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_015702	AT	3	6	284063	284068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_015702	AT	3	6	284102	284107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_015702	GAT	2	6	284117	284122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_015702	ATT	2	6	284145	284150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015702	ATT	2	6	287171	287176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_015702	GCA	2	6	287183	287188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_015702	TAG	2	6	287226	287231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_015702	CAA	2	6	287253	287258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_015702	A	6	6	287278	287283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015702	ATCGT	2	10	287299	287308	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
630	NC_015702	ACG	2	6	287340	287345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_015702	TTGG	2	8	287382	287389	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_015702	TTA	2	6	287497	287502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_015702	TCTT	2	8	287504	287511	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
634	NC_015702	ATTC	2	8	287515	287522	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
635	NC_015702	CAA	2	6	287567	287572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_015702	TTC	2	6	287605	287610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_015702	T	6	6	287679	287684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_015702	T	7	7	291214	291220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_015702	A	6	6	291234	291239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_015702	TTA	2	6	292957	292962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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