MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Parachlamydia acanthamoebae UV-7 chromosome

Total Repeats: 6873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015702	ATGC	2	8	2608280	2608287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6002	NC_015702	CA	3	6	2608342	2608347	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6003	NC_015702	TTTA	2	8	2608363	2608370	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_015702	A	6	6	2608667	2608672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_015702	AAG	2	6	2608692	2608697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_015702	TTG	2	6	2608710	2608715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_015702	TTG	2	6	2608729	2608734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_015702	ATG	2	6	2608743	2608748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_015702	TCGAG	2	10	2610541	2610550	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6010	NC_015702	CCA	2	6	2610627	2610632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_015702	GATT	2	8	2610643	2610650	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_015702	ACA	2	6	2610659	2610664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_015702	T	7	7	2612069	2612075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_015702	AAC	2	6	2612121	2612126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_015702	AGA	2	6	2612136	2612141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_015702	A	6	6	2612147	2612152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_015702	CGA	2	6	2612154	2612159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_015702	AAG	2	6	2612174	2612179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_015702	A	8	8	2612195	2612202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_015702	AGAA	2	8	2612210	2612217	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_015702	AGA	2	6	2612238	2612243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_015702	CAA	2	6	2612281	2612286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_015702	CTG	2	6	2612288	2612293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_015702	TTTGGA	2	12	2612299	2612310	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_015702	ATT	2	6	2612357	2612362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_015702	GAAA	2	8	2612369	2612376	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_015702	TTTG	2	8	2612406	2612413	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_015702	GAAT	2	8	2612421	2612428	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_015702	TCTA	2	8	2612431	2612438	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6030	NC_015702	GA	3	6	2612466	2612471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_015702	A	6	6	2613543	2613548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_015702	TGT	2	6	2613557	2613562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_015702	AGC	2	6	2613579	2613584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_015702	CGT	2	6	2614604	2614609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_015702	GAG	2	6	2614619	2614624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_015702	GCAA	2	8	2614630	2614637	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6037	NC_015702	CAA	3	9	2614922	2614930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_015702	CTT	2	6	2615203	2615208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_015702	AAG	2	6	2615235	2615240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_015702	CCAT	2	8	2616095	2616102	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6041	NC_015702	C	7	7	2616107	2616113	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6042	NC_015702	AAC	2	6	2616134	2616139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_015702	CCA	2	6	2618141	2618146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6044	NC_015702	AATG	2	8	2618152	2618159	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_015702	ACA	2	6	2618184	2618189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_015702	CAA	2	6	2618206	2618211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_015702	TTG	2	6	2618974	2618979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_015702	A	7	7	2618988	2618994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_015702	AAT	2	6	2619000	2619005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_015702	AGC	2	6	2620178	2620183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_015702	CAA	2	6	2621336	2621341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_015702	GAA	2	6	2621446	2621451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_015702	TC	3	6	2621475	2621480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6054	NC_015702	GCCT	2	8	2621551	2621558	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6055	NC_015702	A	6	6	2621585	2621590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_015702	GC	3	6	2621605	2621610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6057	NC_015702	TCT	2	6	2621657	2621662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_015702	AAG	2	6	2621696	2621701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_015702	AGT	2	6	2621738	2621743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_015702	CGTA	2	8	2622947	2622954	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6061	NC_015702	GCC	2	6	2622956	2622961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6062	NC_015702	AAT	2	6	2622973	2622978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_015702	CTT	2	6	2622997	2623002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_015702	CAG	2	6	2623009	2623014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_015702	TCAA	2	8	2623026	2623033	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6066	NC_015702	GAC	2	6	2623836	2623841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_015702	A	7	7	2623847	2623853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_015702	AG	3	6	2623861	2623866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_015702	AGA	2	6	2623871	2623876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_015702	A	6	6	2623900	2623905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_015702	TA	3	6	2623952	2623957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_015702	TGT	2	6	2623979	2623984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_015702	ATT	2	6	2624070	2624075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_015702	ATAC	2	8	2624081	2624088	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6075	NC_015702	GAT	2	6	2624120	2624125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_015702	TAAT	2	8	2624131	2624138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_015702	TGATCA	2	12	2624163	2624174	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6078	NC_015702	CAA	2	6	2624328	2624333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_015702	TCG	2	6	2624372	2624377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_015702	AAT	2	6	2624399	2624404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_015702	A	6	6	2624420	2624425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_015702	TAT	2	6	2624442	2624447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_015702	CTT	2	6	2624452	2624457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_015702	CAA	2	6	2624478	2624483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_015702	GA	3	6	2624548	2624553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_015702	CATA	2	8	2624577	2624584	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6087	NC_015702	TGAT	2	8	2624613	2624620	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_015702	ACAA	2	8	2624688	2624695	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6089	NC_015702	GTT	2	6	2624700	2624705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_015702	CAG	2	6	2625082	2625087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_015702	TCC	2	6	2625123	2625128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6092	NC_015702	GGC	2	6	2625134	2625139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_015702	AACT	2	8	2625945	2625952	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6094	NC_015702	AAG	2	6	2627499	2627504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_015702	GAA	2	6	2630537	2630542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_015702	AGA	2	6	2631576	2631581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_015702	CT	3	6	2631599	2631604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6098	NC_015702	GC	3	6	2631624	2631629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6099	NC_015702	AAGT	2	8	2631638	2631645	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_015702	CTG	2	6	2634714	2634719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_015702	AAC	2	6	2634739	2634744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_015702	GAA	2	6	2634755	2634760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_015702	A	6	6	2634810	2634815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_015702	TAT	2	6	2637699	2637704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_015702	AAG	2	6	2637728	2637733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_015702	AGA	2	6	2637759	2637764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_015702	CCT	2	6	2637766	2637771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6108	NC_015702	TTC	3	9	2637784	2637792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_015702	CAA	2	6	2637794	2637799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_015702	GAG	2	6	2639801	2639806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_015702	TAA	2	6	2639838	2639843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_015702	CAAT	2	8	2639918	2639925	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6113	NC_015702	CGAT	2	8	2640029	2640036	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6114	NC_015702	TTG	2	6	2640048	2640053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_015702	AAT	2	6	2640069	2640074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_015702	TTC	2	6	2643166	2643171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_015702	TTA	2	6	2643254	2643259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_015702	CAT	2	6	2643264	2643269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_015702	A	6	6	2643278	2643283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_015702	TTGG	2	8	2643307	2643314	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_015702	T	6	6	2643321	2643326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_015702	GAA	2	6	2644222	2644227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_015702	TGA	2	6	2644279	2644284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_015702	ATC	2	6	2644314	2644319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_015702	ATT	2	6	2647657	2647662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_015702	AGA	4	12	2647676	2647687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_015702	A	7	7	2647693	2647699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_015702	TCCA	2	8	2647713	2647720	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6129	NC_015702	ATT	2	6	2647733	2647738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_015702	TGA	2	6	2647747	2647752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_015702	TCT	2	6	2650372	2650377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_015702	TCT	2	6	2650428	2650433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6133	NC_015702	CTTT	2	8	2650492	2650499	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6134	NC_015702	T	6	6	2650593	2650598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6135	NC_015702	T	7	7	2650625	2650631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6136	NC_015702	A	6	6	2650936	2650941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6138	NC_015702	A	7	7	2650947	2650953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6139	NC_015702	ATTT	2	8	2650973	2650980	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6152	NC_015702	TGT	2	6	2657484	2657489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6167	NC_015702	GCT	2	6	2663205	2663210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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