MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Parachlamydia acanthamoebae UV-7 chromosome

Total Repeats: 6873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015702	TTAAT	2	10	1	10	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015702	TGT	2	6	14	19	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015702	A	7	7	37	43	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015702	CTT	2	6	56	61	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015702	AGA	2	6	95	100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015702	T	7	7	1638	1644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015702	TTTG	2	8	1701	1708	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015702	AGT	2	6	1744	1749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015702	AAC	2	6	1765	1770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015702	TC	3	6	1788	1793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015702	GAA	3	9	1834	1842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015702	AT	3	6	1850	1855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015702	TA	3	6	1857	1862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015702	TCT	2	6	1863	1868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015702	T	6	6	1912	1917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015702	TGT	2	6	1955	1960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015702	T	6	6	1973	1978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015702	TAAT	2	8	2010	2017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015702	GCC	2	6	2030	2035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_015702	T	6	6	2036	2041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015702	A	6	6	2057	2062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015702	TAAA	2	8	2082	2089	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015702	AGA	2	6	2130	2135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015702	TA	3	6	2151	2156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015702	AT	3	6	2159	2164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015702	AAAG	2	8	2170	2177	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015702	AAT	2	6	2225	2230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015702	T	7	7	4040	4046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015702	TGA	2	6	6080	6085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015702	CAG	2	6	6097	6102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015702	A	7	7	6135	6141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015702	AAG	2	6	6171	6176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015702	A	6	6	6198	6203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015702	ATTA	2	8	6258	6265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015702	TC	3	6	6378	6383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015702	TAAA	2	8	6392	6399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015702	AAT	3	9	6405	6413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015702	TTAA	2	8	8826	8833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015702	GTC	2	6	8910	8915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015702	ATGA	2	8	8962	8969	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015702	GGCA	2	8	8990	8997	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015702	TCAT	2	8	9010	9017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015702	ATT	2	6	9024	9029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015702	ATC	2	6	9038	9043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015702	TCTTT	2	10	9114	9123	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_015702	AAG	2	6	9126	9131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015702	GTCTTA	2	12	9165	9176	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015702	T	7	7	9190	9196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015702	CAA	2	6	9219	9224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015702	TGAT	2	8	9237	9244	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015702	GAGT	2	8	9250	9257	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015702	GGA	2	6	12144	12149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015702	AGA	2	6	13212	13217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015702	CT	3	6	13223	13228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015702	TCC	2	6	13284	13289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_015702	TC	3	6	13309	13314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015702	TGA	2	6	13351	13356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015702	T	6	6	13365	13370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015702	TGGT	2	8	13495	13502	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015702	AT	3	6	13545	13550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015702	CGTG	2	8	13620	13627	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015702	AG	3	6	13663	13668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015702	A	6	6	13690	13695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015702	GATT	2	8	13719	13726	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015702	TCA	2	6	13728	13733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015702	A	7	7	13799	13805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015702	GA	3	6	13837	13842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015702	AGA	2	6	13845	13850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015702	AGTTA	2	10	13883	13892	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015702	TCAA	2	8	13916	13923	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015702	A	6	6	13945	13950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015702	ATA	2	6	14041	14046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015702	GAAA	2	8	14097	14104	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015702	ATT	2	6	14108	14113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015702	A	8	8	14123	14130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015702	AGG	2	6	14157	14162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015702	T	7	7	14538	14544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015702	TTTC	2	8	19786	19793	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015702	ATGA	2	8	19860	19867	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015702	AG	3	6	19880	19885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015702	ATC	2	6	19906	19911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015702	T	6	6	19917	19922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015702	ACAA	2	8	19926	19933	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015702	ATA	2	6	19934	19939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015702	TAAA	2	8	21537	21544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015702	TAT	2	6	21572	21577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015702	AATTA	2	10	21597	21606	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015702	CTT	2	6	21616	21621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015702	ATT	2	6	21632	21637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015702	TAT	2	6	21646	21651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015702	ATGA	2	8	21704	21711	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015702	GCGA	2	8	21737	21744	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015702	GATT	2	8	21823	21830	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015702	TTTC	2	8	21866	21873	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015702	GGA	2	6	21879	21884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015702	GT	3	6	21920	21925	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015702	CCT	2	6	21958	21963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_015702	T	7	7	21970	21976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015702	T	6	6	21999	22004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015702	TTTA	2	8	22104	22111	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015702	T	7	7	24517	24523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015702	T	6	6	24537	24542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015702	GTTA	2	8	24559	24566	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015702	TAAA	2	8	24587	24594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015702	GCAA	2	8	24683	24690	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015702	TTGA	2	8	24710	24717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015702	A	6	6	24723	24728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015702	CAA	2	6	24753	24758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015702	A	6	6	28983	28988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015702	ATAAA	2	10	28992	29001	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015702	ATT	2	6	29006	29011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015702	TGA	2	6	30128	30133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015702	ATTTT	2	10	30197	30206	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015702	TGTT	2	8	31011	31018	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015702	ATTA	2	8	31066	31073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015702	GAAAAA	2	12	35133	35144	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015702	A	9	9	35140	35148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015702	TC	3	6	35206	35211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015702	TTTTAA	2	12	35290	35301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015702	T	6	6	35332	35337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015702	CAAG	2	8	35354	35361	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015702	AG	3	6	35360	35365	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015702	AG	3	6	35379	35384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015702	AGT	2	6	35388	35393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015702	TAAT	2	8	35417	35424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015702	TA	3	6	35470	35475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015702	AGG	2	6	35482	35487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015702	TAT	2	6	35498	35503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015702	ACATA	2	10	35524	35533	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015702	GAA	2	6	35947	35952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015702	CTT	2	6	35981	35986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015702	CAAA	2	8	35994	36001	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015702	AGAA	2	8	36992	36999	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015702	AAT	2	6	37027	37032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015702	T	6	6	37036	37041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015702	TGT	2	6	37056	37061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015702	A	7	7	40807	40813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015702	GAA	2	6	40841	40846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015702	AAAGT	2	10	40877	40886	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015702	AAGA	2	8	40893	40900	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015702	A	7	7	40900	40906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015702	CTTAA	2	10	41105	41114	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_015702	GTT	2	6	42475	42480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015702	AGTG	2	8	42504	42511	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015702	T	6	6	42603	42608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015702	AGGA	2	8	42686	42693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015702	TGCCT	2	10	42739	42748	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
148	NC_015702	T	7	7	42765	42771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015702	T	6	6	43553	43558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015702	TTG	2	6	44766	44771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015702	A	6	6	44778	44783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015702	AATC	2	8	44802	44809	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_015702	AGG	2	6	44815	44820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_015702	ATTT	2	8	49191	49198	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_015702	A	6	6	49340	49345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_015702	AATT	2	8	49402	49409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_015702	TAT	2	6	52560	52565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_015702	TAT	2	6	109454	109459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_015702	TTG	2	6	111720	111725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_015702	ATA	2	6	111799	111804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_015702	GTGAT	2	10	181938	181947	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
435	NC_015702	A	6	6	181986	181991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_015702	AAC	2	6	188478	188483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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462	NC_015702	CAT	2	6	194405	194410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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473	NC_015702	TCAA	2	8	195958	195965	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
474	NC_015702	TAA	2	6	205090	205095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_015702	A	7	7	211435	211441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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