MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 3605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015680	CT	3	6	4	9	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015680	AACC	2	8	10	17	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015680	AATA	2	8	994	1001	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015680	T	7	7	4868	4874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015680	CCCT	2	8	6209	6216	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_015680	CTT	2	6	7526	7531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015680	GA	3	6	7785	7790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015680	CTA	2	6	7797	7802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015680	GCTC	2	8	7827	7834	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015680	GAAC	2	8	7849	7856	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015680	C	6	6	10288	10293	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_015680	TAA	2	6	10316	10321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015680	CAC	2	6	11557	11562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_015680	TAA	2	6	11589	11594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015680	GCAC	2	8	11617	11624	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015680	GGAT	2	8	14972	14979	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015680	TCA	2	6	16956	16961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015680	A	6	6	16995	17000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015680	ACC	2	6	17329	17334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_015680	GAT	2	6	17396	17401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015680	CCGGGA	2	12	17429	17440	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015680	GAT	2	6	18213	18218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015680	GGGA	2	8	18220	18227	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015680	GGT	2	6	18239	18244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015680	CTC	2	6	21431	21436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_015680	GGT	2	6	21621	21626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015680	TC	3	6	24122	24127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015680	TGT	2	6	24128	24133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015680	TATT	2	8	24153	24160	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015680	GGT	2	6	24190	24195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015680	CTC	2	6	24841	24846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_015680	TAAA	2	8	24867	24874	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015680	CTA	3	9	24883	24891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015680	TCAC	2	8	26653	26660	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015680	ATG	2	6	26670	26675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015680	ATTG	2	8	28317	28324	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015680	T	8	8	31957	31964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015680	ATC	2	6	31982	31987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015680	CCGC	2	8	32121	32128	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_015680	ATT	2	6	32277	32282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015680	TTTTCA	2	12	32308	32319	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_015680	CCCAT	2	10	32610	32619	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
43	NC_015680	GAG	2	6	32665	32670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015680	TAC	2	6	32742	32747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015680	GGT	2	6	32749	32754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015680	TCA	2	6	32789	32794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015680	CAC	2	6	32998	33003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_015680	ATA	2	6	33012	33017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015680	GCT	2	6	33059	33064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015680	CAA	2	6	33130	33135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015680	AC	3	6	33699	33704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015680	TCC	2	6	33738	33743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_015680	GAT	2	6	33835	33840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015680	GAA	2	6	33948	33953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015680	TC	3	6	34040	34045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015680	TG	3	6	34123	34128	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015680	CT	3	6	34450	34455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015680	TGGA	2	8	34460	34467	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015680	GTC	2	6	34485	34490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015680	GT	3	6	34794	34799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015680	GA	3	6	34833	34838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015680	CCT	2	6	34867	34872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_015680	T	6	6	36166	36171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015680	AGG	2	6	36549	36554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015680	TTG	2	6	36591	36596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015680	TCG	2	6	36605	36610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015680	GGT	2	6	37740	37745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015680	T	6	6	39363	39368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015680	A	6	6	39414	39419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015680	C	6	6	41114	41119	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
71	NC_015680	ATC	2	6	41138	41143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015680	ACAT	2	8	41190	41197	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015680	AT	3	6	41196	41201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015680	CAA	3	9	41255	41263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015680	TCG	2	6	41275	41280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015680	GAGCTC	2	12	41341	41352	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015680	GGA	2	6	41407	41412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015680	TAGT	2	8	41463	41470	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015680	GAA	2	6	41480	41485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015680	GAA	3	9	41957	41965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015680	CCGG	2	8	42065	42072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015680	TCAGC	2	10	42086	42095	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_015680	C	6	6	42149	42154	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
84	NC_015680	T	6	6	42158	42163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015680	T	6	6	42215	42220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015680	TCT	2	6	42229	42234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015680	GAG	2	6	42321	42326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015680	A	6	6	42352	42357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015680	A	6	6	42454	42459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015680	TAG	2	6	42468	42473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015680	CCT	2	6	42495	42500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_015680	A	7	7	42520	42526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015680	ACA	2	6	42553	42558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015680	A	6	6	42576	42581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015680	C	6	6	42600	42605	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
96	NC_015680	CCA	2	6	42611	42616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_015680	CAAA	2	8	42623	42630	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015680	A	6	6	42679	42684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015680	ATG	2	6	42695	42700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015680	GTA	2	6	53110	53115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015680	CCA	2	6	53192	53197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_015680	CCA	2	6	53237	53242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_015680	CTT	2	6	53345	53350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015680	CAA	2	6	53370	53375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015680	CAGG	2	8	53382	53389	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015680	TCCC	2	8	58880	58887	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
107	NC_015680	CGC	2	6	58957	58962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_015680	ACG	2	6	59017	59022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015680	TTA	2	6	61278	61283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015680	C	6	6	61856	61861	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
111	NC_015680	CTC	2	6	62411	62416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_015680	TGCA	2	8	62418	62425	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015680	GTA	2	6	62459	62464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015680	GCC	2	6	62528	62533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_015680	TCG	2	6	62550	62555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015680	GAAA	2	8	62592	62599	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015680	ATG	2	6	63551	63556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015680	ACC	2	6	64970	64975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_015680	AAT	2	6	64983	64988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015680	TTTGC	2	10	65126	65135	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_015680	TGA	2	6	65143	65148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015680	GAA	2	6	65231	65236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015680	TA	3	6	65239	65244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015680	TGGT	2	8	67974	67981	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015680	TTCCC	2	10	68783	68792	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
126	NC_015680	T	6	6	68825	68830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015680	GGT	2	6	68831	68836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015680	AAG	2	6	71946	71951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015680	TAA	2	6	71960	71965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015680	CTTTT	2	10	72530	72539	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_015680	ACG	2	6	75035	75040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015680	AGG	2	6	75063	75068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015680	AGA	2	6	75993	75998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015680	GCCC	2	8	76017	76024	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
135	NC_015680	CTT	2	6	76054	76059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015680	GGGC	2	8	76061	76068	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015680	TGG	2	6	76233	76238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015680	TAT	2	6	76262	76267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015680	TTAA	2	8	76328	76335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015680	TAG	2	6	76412	76417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015680	GAAAA	2	10	76456	76465	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015680	A	7	7	76462	76468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015680	GTA	2	6	76498	76503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015680	AG	3	6	76599	76604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015680	CGC	2	6	76644	76649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_015680	TGC	2	6	76956	76961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_015680	TCGT	2	8	76971	76978	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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288	NC_015680	TC	3	6	142538	142543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
289	NC_015680	T	6	6	147029	147034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_015680	AAG	2	6	147039	147044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_015680	ACC	2	6	147657	147662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
292	NC_015680	TTA	2	6	147665	147670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_015680	TTAA	2	8	147684	147691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_015680	TA	3	6	147866	147871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_015680	CGG	2	6	147929	147934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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301	NC_015680	TCA	2	6	152814	152819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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303	NC_015680	TCA	2	6	153556	153561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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312	NC_015680	TGA	2	6	155624	155629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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323	NC_015680	AGA	2	6	156135	156140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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426	NC_015680	CGG	2	6	181220	181225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
427	NC_015680	CGC	2	6	181250	181255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
428	NC_015680	CCA	2	6	181296	181301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
429	NC_015680	GGT	2	6	181350	181355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
430	NC_015680	TCC	3	9	182645	182653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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432	NC_015680	TTG	2	6	182669	182674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
433	NC_015680	T	7	7	183978	183984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_015680	ATT	2	6	186138	186143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NC_015680	AAT	2	6	186157	186162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
437	NC_015680	GAA	2	6	186202	186207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
438	NC_015680	ACC	2	6	188757	188762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
439	NC_015680	ACTTTT	2	12	191660	191671	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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441	NC_015680	AAG	2	6	191779	191784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
442	NC_015680	TCA	2	6	191847	191852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_015680	CAA	2	6	191881	191886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
444	NC_015680	CCA	2	6	196892	196897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
445	NC_015680	AT	3	6	198306	198311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_015680	TAT	2	6	200826	200831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_015680	GAA	2	6	200859	200864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
451	NC_015680	ATCCG	2	10	200876	200885	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
452	NC_015680	GAA	2	6	200888	200893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
453	NC_015680	T	6	6	200943	200948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_015680	ATT	2	6	200971	200976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_015680	CAA	2	6	200982	200987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
456	NC_015680	CCT	2	6	200988	200993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
457	NC_015680	TAC	2	6	201001	201006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
458	NC_015680	CT	3	6	201042	201047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
459	NC_015680	TGGA	2	8	201057	201064	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
460	NC_015680	CTT	2	6	201104	201109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
461	NC_015680	TGGC	2	8	201244	201251	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
462	NC_015680	TGT	2	6	201252	201257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
463	NC_015680	CCG	2	6	201982	201987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
464	NC_015680	GT	3	6	202027	202032	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
465	NC_015680	GGT	2	6	202484	202489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
466	NC_015680	GTCCC	2	10	204308	204317	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
467	NC_015680	CCCCGC	2	12	204340	204351	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
468	NC_015680	TCG	2	6	204379	204384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
469	NC_015680	GGT	2	6	205221	205226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
470	NC_015680	TCC	2	6	205932	205937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
471	NC_015680	CGG	2	6	205972	205977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
472	NC_015680	A	6	6	205985	205990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_015680	GGT	2	6	205997	206002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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476	NC_015680	GGT	2	6	207887	207892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_015680	CGA	2	6	214262	214267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
482	NC_015680	GA	3	6	214270	214275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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487	NC_015680	TC	3	6	217228	217233	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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