MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 3605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015680	ACC	2	6	1663215	1663220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3502	NC_015680	TCA	2	6	1670571	1670576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_015680	TCT	3	9	1670611	1670619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_015680	CCA	2	6	1673311	1673316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_015680	ATTA	2	8	1673336	1673343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_015680	ACA	2	6	1674159	1674164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_015680	GGT	2	6	1674841	1674846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_015680	GGC	2	6	1676193	1676198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_015680	ATT	2	6	1676206	1676211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_015680	GAAG	2	8	1676264	1676271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_015680	GGT	2	6	1676287	1676292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_015680	T	7	7	1677806	1677812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_015680	GAGG	2	8	1677862	1677869	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_015680	AGA	2	6	1677961	1677966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_015680	GA	3	6	1677965	1677970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_015680	CTT	2	6	1678500	1678505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_015680	TTCTC	2	10	1678543	1678552	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3518	NC_015680	ATA	2	6	1678636	1678641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_015680	ATG	2	6	1678679	1678684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_015680	TGCT	2	8	1678704	1678711	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3521	NC_015680	CAC	2	6	1679661	1679666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3522	NC_015680	AACCT	2	10	1680825	1680834	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3523	NC_015680	CAC	2	6	1683807	1683812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3524	NC_015680	CGG	2	6	1683844	1683849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_015680	AGTTC	2	10	1683873	1683882	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3526	NC_015680	G	6	6	1683945	1683950	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_015680	CAC	2	6	1686723	1686728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3528	NC_015680	ATA	2	6	1686749	1686754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_015680	AC	3	6	1688351	1688356	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3530	NC_015680	TTCC	2	8	1688393	1688400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3531	NC_015680	GGT	2	6	1688469	1688474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_015680	GA	5	10	1691298	1691307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_015680	ATG	2	6	1692151	1692156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_015680	GGT	2	6	1692272	1692277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_015680	GGGA	2	8	1693561	1693568	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_015680	GAG	2	6	1693587	1693592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_015680	GGA	2	6	1693593	1693598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_015680	GGT	2	6	1694621	1694626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_015680	GAA	2	6	1696290	1696295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_015680	AAAG	2	8	1696296	1696303	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_015680	CAC	2	6	1696546	1696551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3542	NC_015680	TCC	2	6	1697237	1697242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3543	NC_015680	ACC	2	6	1697545	1697550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3544	NC_015680	TCCC	2	8	1697712	1697719	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3545	NC_015680	CGG	2	6	1697818	1697823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_015680	GTG	2	6	1697850	1697855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_015680	TTCC	2	8	1698601	1698608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3548	NC_015680	TTA	2	6	1699530	1699535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_015680	CGTT	2	8	1699542	1699549	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3550	NC_015680	A	6	6	1699583	1699588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_015680	CCT	2	6	1700813	1700818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3552	NC_015680	TGT	2	6	1700828	1700833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_015680	GGT	2	6	1704875	1704880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_015680	CAA	2	6	1706543	1706548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_015680	TG	3	6	1706581	1706586	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_015680	CCT	2	6	1708080	1708085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3557	NC_015680	TCA	3	9	1708086	1708094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_015680	TCA	2	6	1708113	1708118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_015680	CCA	2	6	1708124	1708129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3560	NC_015680	TCA	2	6	1712928	1712933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_015680	TCCC	2	8	1712934	1712941	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3562	NC_015680	TCA	2	6	1713051	1713056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_015680	C	6	6	1713208	1713213	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3564	NC_015680	ACC	2	6	1713245	1713250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3565	NC_015680	GTT	2	6	1713266	1713271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_015680	CCTGA	2	10	1713370	1713379	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3567	NC_015680	CTT	2	6	1713433	1713438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_015680	CTCC	2	8	1713442	1713449	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3569	NC_015680	TCC	2	6	1713458	1713463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_015680	ATT	2	6	1713470	1713475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_015680	CGA	2	6	1713519	1713524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_015680	AGG	2	6	1713625	1713630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_015680	C	6	6	1713631	1713636	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3574	NC_015680	CT	3	6	1713661	1713666	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3575	NC_015680	CGG	2	6	1713768	1713773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_015680	CCT	2	6	1713792	1713797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3577	NC_015680	CTG	2	6	1713806	1713811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_015680	GAA	2	6	1715401	1715406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_015680	A	6	6	1715405	1715410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_015680	T	6	6	1715460	1715465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_015680	ATC	2	6	1715553	1715558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_015680	CAC	2	6	1715559	1715564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3583	NC_015680	TCA	2	6	1715578	1715583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_015680	TAT	2	6	1715640	1715645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_015680	TCC	3	9	1715693	1715701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3586	NC_015680	CTC	3	9	1715814	1715822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3587	NC_015680	TCCT	2	8	1715857	1715864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3588	NC_015680	GCGG	2	8	1715913	1715920	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3589	NC_015680	CCA	2	6	1715938	1715943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3590	NC_015680	CTC	2	6	1715959	1715964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3591	NC_015680	CTC	2	6	1716126	1716131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3592	NC_015680	CTC	2	6	1716138	1716143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3593	NC_015680	CTT	2	6	1716195	1716200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_015680	T	7	7	1716216	1716222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_015680	GCG	2	6	1716331	1716336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_015680	CAA	2	6	1716362	1716367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_015680	TTC	2	6	1716376	1716381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_015680	GAC	2	6	1716402	1716407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_015680	AC	4	8	1716508	1716515	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3600	NC_015680	CTC	2	6	1716528	1716533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3601	NC_015680	GTT	2	6	1716570	1716575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_015680	CTTC	2	8	1716596	1716603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3603	NC_015680	TAA	2	6	1716644	1716649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_015680	TC	3	6	1716720	1716725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3605	NC_015680	CTC	2	6	1716789	1716794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.