MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 3605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015680	CG	3	6	1231206	1231211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2502	NC_015680	TTAA	2	8	1231213	1231220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_015680	CGGGCT	2	12	1231244	1231255	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_015680	ATT	2	6	1231314	1231319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_015680	AGTGC	2	10	1231375	1231384	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2506	NC_015680	CTA	2	6	1231427	1231432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_015680	GAA	2	6	1231436	1231441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_015680	AGTC	2	8	1231488	1231495	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2509	NC_015680	AGA	2	6	1231556	1231561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_015680	ATA	2	6	1231626	1231631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_015680	CTC	2	6	1231701	1231706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2512	NC_015680	GCTGA	2	10	1231771	1231780	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2513	NC_015680	CTGAG	2	10	1231783	1231792	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2514	NC_015680	CCA	2	6	1232724	1232729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2515	NC_015680	TCT	2	6	1232858	1232863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_015680	CCCG	2	8	1232942	1232949	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2517	NC_015680	TC	3	6	1232997	1233002	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2518	NC_015680	ATG	2	6	1233152	1233157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_015680	AGA	2	6	1233158	1233163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_015680	AAG	2	6	1233174	1233179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_015680	ATC	2	6	1233727	1233732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_015680	TAA	2	6	1233780	1233785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_015680	CGTC	2	8	1233788	1233795	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2524	NC_015680	CTT	2	6	1235712	1235717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_015680	TCT	2	6	1235724	1235729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_015680	TATC	2	8	1235752	1235759	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2527	NC_015680	T	6	6	1235776	1235781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_015680	C	6	6	1235796	1235801	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2529	NC_015680	GAC	2	6	1235822	1235827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2531	NC_015680	GAA	2	6	1237053	1237058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_015680	T	6	6	1239516	1239521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_015680	TCTA	2	8	1239530	1239537	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2534	NC_015680	CT	3	6	1239584	1239589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2535	NC_015680	TTTA	2	8	1240173	1240180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_015680	TTG	2	6	1240186	1240191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_015680	G	6	6	1240234	1240239	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_015680	TTAT	2	8	1240247	1240254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_015680	ATA	3	9	1240310	1240318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_015680	CGT	2	6	1240343	1240348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2543	NC_015680	AAG	2	6	1247610	1247615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_015680	T	6	6	1248866	1248871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_015680	GAAA	2	8	1248893	1248900	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_015680	AGG	2	6	1248902	1248907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_015680	GGT	2	6	1250340	1250345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_015680	CAT	2	6	1251437	1251442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2549	NC_015680	CAC	2	6	1251461	1251466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2550	NC_015680	AAAGA	2	10	1251471	1251480	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_015680	CCAA	2	8	1251516	1251523	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2552	NC_015680	AT	3	6	1251531	1251536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_015680	CAA	2	6	1251554	1251559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_015680	TAA	2	6	1251572	1251577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_015680	TTTG	2	8	1251629	1251636	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2557	NC_015680	AAC	2	6	1251661	1251666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_015680	TCT	2	6	1251724	1251729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2559	NC_015680	TCA	2	6	1251735	1251740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2560	NC_015680	ATA	2	6	1251825	1251830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2562	NC_015680	A	6	6	1251895	1251900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_015680	TAC	2	6	1251913	1251918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_015680	TTC	2	6	1251966	1251971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2567	NC_015680	GAG	2	6	1252119	1252124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2570	NC_015680	T	6	6	1252234	1252239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2573	NC_015680	ATTA	2	8	1252333	1252340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2576	NC_015680	TACT	2	8	1252846	1252853	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2577	NC_015680	TTTA	2	8	1252866	1252873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_015680	T	6	6	1252934	1252939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_015680	TAC	2	6	1252994	1252999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2581	NC_015680	AATA	2	8	1253045	1253052	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2589	NC_015680	TTA	2	6	1255019	1255024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2599	NC_015680	GCA	2	6	1255733	1255738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2602	NC_015680	GTG	2	6	1255870	1255875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_015680	G	7	7	1255880	1255886	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_015680	GGT	2	6	1256743	1256748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2607	NC_015680	ATC	2	6	1260428	1260433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2609	NC_015680	GAAGA	2	10	1261088	1261097	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_015680	ACCG	2	8	1261113	1261120	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2611	NC_015680	TGC	2	6	1261128	1261133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2612	NC_015680	GATT	2	8	1261158	1261165	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_015680	TTTC	2	8	1261248	1261255	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2614	NC_015680	TAA	2	6	1261265	1261270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_015680	AGTGC	2	10	1272513	1272522	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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2619	NC_015680	ATC	2	6	1272729	1272734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2623	NC_015680	TTC	2	6	1272909	1272914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2627	NC_015680	TGG	2	6	1281097	1281102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_015680	C	6	6	1282544	1282549	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2629	NC_015680	CTT	2	6	1282566	1282571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2630	NC_015680	CTT	2	6	1284005	1284010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2632	NC_015680	ACC	3	9	1284699	1284707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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