MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 3605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015680	TA	3	6	218914	218919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_015680	A	6	6	218968	218973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_015680	AGG	2	6	219003	219008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_015680	AG	3	6	219014	219019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
505	NC_015680	ATT	2	6	219033	219038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015680	T	6	6	219109	219114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015680	TTA	2	6	219153	219158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015680	TGCC	2	8	219229	219236	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
509	NC_015680	TAT	2	6	219237	219242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_015680	AGG	2	6	219267	219272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_015680	AGAA	2	8	219443	219450	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015680	C	6	6	222362	222367	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
513	NC_015680	ATT	2	6	222405	222410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_015680	C	6	6	222450	222455	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
515	NC_015680	GAC	2	6	222525	222530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_015680	TTAA	2	8	223565	223572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_015680	AAG	2	6	223780	223785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015680	GGA	2	6	223865	223870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_015680	CTT	2	6	224002	224007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_015680	CCT	2	6	224122	224127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_015680	TCA	2	6	224137	224142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_015680	CAGG	2	8	224143	224150	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
523	NC_015680	AGG	2	6	224242	224247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_015680	GAA	2	6	224266	224271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015680	TCG	2	6	224343	224348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_015680	GGA	2	6	224449	224454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015680	GGAT	2	8	224478	224485	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015680	G	6	6	224500	224505	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015680	TTC	2	6	225913	225918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_015680	CCA	2	6	225927	225932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_015680	GGGCAG	2	12	225984	225995	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
532	NC_015680	AGCCA	2	10	226043	226052	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
533	NC_015680	TCT	2	6	228032	228037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_015680	CGT	2	6	228062	228067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_015680	GAT	2	6	228104	228109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_015680	GCC	2	6	228152	228157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_015680	CCA	2	6	228197	228202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_015680	GGGC	2	8	228213	228220	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
539	NC_015680	CCA	2	6	228289	228294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_015680	AG	3	6	228310	228315	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
541	NC_015680	G	6	6	229739	229744	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
542	NC_015680	CAG	2	6	231311	231316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_015680	CTT	2	6	231367	231372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_015680	TGTAA	2	10	231378	231387	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
545	NC_015680	A	7	7	231386	231392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015680	AGAGA	2	10	235266	235275	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
547	NC_015680	C	6	6	237941	237946	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
548	NC_015680	T	6	6	238487	238492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015680	T	6	6	238517	238522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_015680	GAG	2	6	238822	238827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015680	CCT	2	6	240061	240066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_015680	ATT	2	6	240079	240084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_015680	ACC	2	6	241618	241623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_015680	ATAA	2	8	243394	243401	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015680	GCCC	2	8	243407	243414	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
556	NC_015680	GAAA	2	8	243451	243458	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
557	NC_015680	G	6	6	243466	243471	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015680	TCTT	2	8	244566	244573	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
559	NC_015680	ACC	2	6	246575	246580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_015680	TCA	2	6	246632	246637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_015680	AAGG	2	8	246644	246651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015680	GCCCC	2	10	248621	248630	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
563	NC_015680	TA	3	6	253589	253594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015680	CCG	2	6	253628	253633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_015680	AAC	2	6	255958	255963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_015680	CT	3	6	256005	256010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
567	NC_015680	TCA	2	6	256011	256016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_015680	TAA	2	6	256040	256045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015680	GAAAA	2	10	256053	256062	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
570	NC_015680	AGAAA	2	10	260260	260269	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
571	NC_015680	TAA	2	6	262442	262447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_015680	GA	3	6	262483	262488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_015680	TCAT	2	8	262497	262504	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
574	NC_015680	ACC	2	6	263329	263334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_015680	AAG	2	6	263346	263351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_015680	ATT	2	6	263355	263360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_015680	CGGGG	2	10	263378	263387	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
578	NC_015680	GGCTA	2	10	263442	263451	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
579	NC_015680	CCT	2	6	263787	263792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_015680	GAA	2	6	263804	263809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015680	CGG	2	6	265178	265183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_015680	CCG	2	6	265189	265194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_015680	A	6	6	265242	265247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015680	CGG	2	6	265260	265265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_015680	TCA	2	6	265275	265280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_015680	GGATTA	2	12	265331	265342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_015680	TCA	2	6	267009	267014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_015680	TCA	2	6	267035	267040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_015680	TTC	2	6	267046	267051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_015680	TCA	2	6	267100	267105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_015680	CAT	2	6	267117	267122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_015680	TCA	2	6	267123	267128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_015680	ATCG	2	8	267155	267162	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
594	NC_015680	CGG	2	6	267236	267241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_015680	GGC	2	6	267294	267299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_015680	CT	3	6	267311	267316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
597	NC_015680	TCC	2	6	267344	267349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_015680	CT	3	6	267411	267416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
599	NC_015680	TCC	2	6	267507	267512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_015680	AGTC	2	8	267540	267547	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
601	NC_015680	CTT	2	6	267556	267561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_015680	TTCC	2	8	267578	267585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_015680	GAG	2	6	267592	267597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_015680	CCT	2	6	267630	267635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_015680	CAA	2	6	267688	267693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_015680	TAA	2	6	267738	267743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_015680	TCC	2	6	267759	267764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_015680	TAA	2	6	268429	268434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_015680	CTC	2	6	268483	268488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_015680	CCCA	2	8	268490	268497	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
611	NC_015680	GCC	2	6	268511	268516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_015680	TAGCT	2	10	268518	268527	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
613	NC_015680	CGG	2	6	268551	268556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_015680	GCG	3	9	268575	268583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_015680	GC	3	6	268616	268621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
616	NC_015680	TTC	2	6	269544	269549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_015680	CAA	2	6	269557	269562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_015680	AAG	2	6	269618	269623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_015680	AAAGGG	2	12	270074	270085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
620	NC_015680	CCT	2	6	270473	270478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_015680	TTA	2	6	272755	272760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_015680	TCA	2	6	272775	272780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_015680	GAGG	2	8	274181	274188	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015680	CTTT	2	8	274228	274235	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
625	NC_015680	G	6	6	274241	274246	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015680	AT	3	6	274292	274297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_015680	GGT	2	6	274311	274316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
628	NC_015680	T	7	7	276539	276545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015680	TTTTG	2	10	276549	276558	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
630	NC_015680	AAT	2	6	276564	276569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_015680	GGC	2	6	276581	276586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_015680	ACC	2	6	279761	279766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_015680	TAGGG	2	10	281546	281555	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
634	NC_015680	GAG	2	6	281600	281605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
635	NC_015680	TGA	2	6	281625	281630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_015680	TGGC	2	8	281636	281643	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
637	NC_015680	CAC	2	6	286132	286137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_015680	CAC	2	6	287995	288000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
639	NC_015680	TCA	2	6	291490	291495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_015680	GAT	2	6	291499	291504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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