MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas mendocina NK-01 chromosome

Total Repeats: 11338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015410	CGC	2	6	1683272	1683277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3002	NC_015410	CAGA	2	8	1683303	1683310	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3003	NC_015410	TCG	2	6	1683336	1683341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_015410	AGT	2	6	1683346	1683351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_015410	TTC	2	6	1683372	1683377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_015410	TTC	2	6	1683389	1683394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_015410	T	8	8	1683500	1683507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_015410	TAGC	2	8	1683588	1683595	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3009	NC_015410	TAA	2	6	1683596	1683601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_015410	TTC	2	6	1683658	1683663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_015410	CAGGTG	2	12	1686862	1686873	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3012	NC_015410	GCA	2	6	1690713	1690718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_015410	GTG	2	6	1690819	1690824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_015410	GGC	2	6	1692301	1692306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_015410	TTC	2	6	1692347	1692352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_015410	CGGCT	2	10	1692430	1692439	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3017	NC_015410	GCT	2	6	1692444	1692449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_015410	TTG	2	6	1694248	1694253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_015410	CGG	2	6	1694367	1694372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_015410	TTG	2	6	1694390	1694395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_015410	T	6	6	1694399	1694404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_015410	TGG	2	6	1694441	1694446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_015410	GCT	2	6	1694459	1694464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_015410	GC	3	6	1694472	1694477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3025	NC_015410	AC	3	6	1694512	1694517	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3026	NC_015410	AACA	2	8	1694518	1694525	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3027	NC_015410	GC	3	6	1694533	1694538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3028	NC_015410	CTG	2	6	1696270	1696275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_015410	GAA	2	6	1696280	1696285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_015410	GC	3	6	1696331	1696336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3031	NC_015410	ACC	2	6	1696337	1696342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3032	NC_015410	CGG	2	6	1696365	1696370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_015410	CTG	2	6	1700025	1700030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_015410	CCA	2	6	1702523	1702528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_015410	GGC	2	6	1702562	1702567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_015410	GCC	2	6	1702576	1702581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3037	NC_015410	CAG	2	6	1702748	1702753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_015410	AGCG	2	8	1704496	1704503	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3039	NC_015410	CCT	2	6	1706585	1706590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_015410	CGG	2	6	1707569	1707574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_015410	GCA	2	6	1707664	1707669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_015410	ATG	2	6	1707679	1707684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_015410	ATAG	2	8	1707724	1707731	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_015410	TGG	3	9	1707793	1707801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_015410	TCT	2	6	1707898	1707903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_015410	GGCA	2	8	1710510	1710517	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3047	NC_015410	GCCTG	2	10	1710576	1710585	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3048	NC_015410	CCG	2	6	1711565	1711570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3049	NC_015410	GAG	2	6	1711605	1711610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_015410	GC	3	6	1713138	1713143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3051	NC_015410	GATG	2	8	1713177	1713184	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_015410	GGC	2	6	1713191	1713196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_015410	GTTC	2	8	1713199	1713206	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3054	NC_015410	GGT	2	6	1713208	1713213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_015410	GCT	2	6	1713432	1713437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_015410	GCG	2	6	1713515	1713520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_015410	GTTC	2	8	1713525	1713532	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3058	NC_015410	GT	3	6	1713555	1713560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_015410	GCC	2	6	1713569	1713574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3060	NC_015410	CAG	2	6	1713588	1713593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_015410	CTT	2	6	1713632	1713637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_015410	GCA	2	6	1713640	1713645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_015410	ACCG	2	8	1713653	1713660	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3064	NC_015410	TGC	3	9	1713680	1713688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_015410	TCA	2	6	1713692	1713697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_015410	TGA	2	6	1713755	1713760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_015410	AAC	2	6	1713826	1713831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_015410	AAT	2	6	1713866	1713871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_015410	TAA	2	6	1713905	1713910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_015410	A	7	7	1713962	1713968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_015410	TCA	2	6	1714069	1714074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_015410	AAT	2	6	1714075	1714080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_015410	T	6	6	1714082	1714087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_015410	CAA	2	6	1714106	1714111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_015410	GCC	2	6	1714885	1714890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3076	NC_015410	GC	3	6	1714954	1714959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3077	NC_015410	TGGT	2	8	1714991	1714998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_015410	GCA	2	6	1715034	1715039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_015410	A	8	8	1715086	1715093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_015410	TTC	2	6	1715122	1715127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_015410	GA	3	6	1715256	1715261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_015410	TCCC	2	8	1715338	1715345	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3083	NC_015410	ATC	2	6	1715378	1715383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_015410	GTT	2	6	1715458	1715463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_015410	ATT	2	6	1715647	1715652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_015410	CGG	2	6	1715697	1715702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_015410	CGT	2	6	1715779	1715784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_015410	TACG	2	8	1715803	1715810	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3089	NC_015410	GCT	2	6	1715934	1715939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_015410	CGG	2	6	1720041	1720046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_015410	TGA	2	6	1720064	1720069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_015410	GCCG	2	8	1720952	1720959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3093	NC_015410	AT	3	6	1720973	1720978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_015410	CAG	2	6	1721064	1721069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_015410	CTGTGC	2	12	1721144	1721155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_015410	AT	3	6	1721272	1721277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_015410	GTT	2	6	1721291	1721296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_015410	CCA	2	6	1721333	1721338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3099	NC_015410	ACA	2	6	1721426	1721431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_015410	CT	3	6	1721460	1721465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3101	NC_015410	GCT	2	6	1721535	1721540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_015410	CTT	2	6	1721632	1721637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_015410	CGAG	2	8	1721695	1721702	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3104	NC_015410	GCT	2	6	1721727	1721732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_015410	CGCTT	2	10	1721788	1721797	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3106	NC_015410	CTCA	2	8	1721878	1721885	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3107	NC_015410	CGC	2	6	1726767	1726772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3108	NC_015410	CAC	2	6	1726815	1726820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3109	NC_015410	CTTT	2	8	1726898	1726905	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3110	NC_015410	GCA	2	6	1726922	1726927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_015410	TGT	2	6	1726936	1726941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_015410	GCTC	2	8	1727005	1727012	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3113	NC_015410	GTT	2	6	1727103	1727108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_015410	TTG	2	6	1727116	1727121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_015410	GTT	2	6	1727127	1727132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_015410	AG	3	6	1727208	1727213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_015410	TGG	2	6	1727282	1727287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_015410	GGA	2	6	1727350	1727355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_015410	GT	3	6	1728663	1728668	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_015410	TGA	2	6	1729144	1729149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_015410	TGG	3	9	1730867	1730875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_015410	GGC	2	6	1730881	1730886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_015410	GCA	2	6	1734147	1734152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_015410	AGGT	2	8	1734215	1734222	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_015410	GGCC	2	8	1734223	1734230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3126	NC_015410	GGCC	2	8	1734235	1734242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3127	NC_015410	TGGG	2	8	1735059	1735066	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_015410	TCG	2	6	1735127	1735132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_015410	TGG	2	6	1736066	1736071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_015410	CTGC	2	8	1736081	1736088	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3131	NC_015410	TCA	2	6	1736635	1736640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3133	NC_015410	CTAT	2	8	1736721	1736728	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3257	NC_015410	A	6	6	1812208	1812213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3258	NC_015410	GGCA	2	8	1812777	1812784	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3259	NC_015410	AGGA	2	8	1812884	1812891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3264	NC_015410	GCCA	2	8	1822972	1822979	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3265	NC_015410	GACG	2	8	1822997	1823004	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3266	NC_015410	TGCT	2	8	1823010	1823017	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3267	NC_015410	GTG	2	6	1823018	1823023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3268	NC_015410	TCAG	2	8	1823034	1823041	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3269	NC_015410	CG	4	8	1823158	1823165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3270	NC_015410	CAT	2	6	1823216	1823221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3282	NC_015410	CGG	2	6	1828560	1828565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3283	NC_015410	TGC	2	6	1828610	1828615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3285	NC_015410	CTG	2	6	1835717	1835722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3286	NC_015410	TGG	2	6	1837115	1837120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3296	NC_015410	GT	3	6	1841190	1841195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3297	NC_015410	A	7	7	1841219	1841225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3298	NC_015410	GTT	2	6	1841257	1841262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3303	NC_015410	GA	3	6	1842030	1842035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3381	NC_015410	GGGT	2	8	1879126	1879133	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3382	NC_015410	TAC	2	6	1879230	1879235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3389	NC_015410	GC	3	6	1886903	1886908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3390	NC_015410	GTT	2	6	1887030	1887035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3391	NC_015410	TGCC	2	8	1887251	1887258	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3392	NC_015410	CCA	2	6	1887301	1887306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3393	NC_015410	GCA	2	6	1887314	1887319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3395	NC_015410	CGC	2	6	1888284	1888289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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