MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas mendocina NK-01 chromosome

Total Repeats: 11338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_015410	CAAC	2	8	3818431	3818438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8002	NC_015410	GCA	2	6	3818914	3818919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_015410	TGC	2	6	3820358	3820363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_015410	CCG	2	6	3820365	3820370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8005	NC_015410	CGG	2	6	3820374	3820379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_015410	ATC	3	9	3820421	3820429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_015410	ATGG	2	8	3820930	3820937	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_015410	A	6	6	3820980	3820985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_015410	TATC	2	8	3821076	3821083	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8010	NC_015410	CTG	2	6	3821940	3821945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_015410	GCTG	2	8	3821952	3821959	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8012	NC_015410	TCAG	2	8	3821972	3821979	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8013	NC_015410	AAC	2	6	3824448	3824453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8014	NC_015410	GCG	2	6	3824509	3824514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8015	NC_015410	GGC	2	6	3824590	3824595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_015410	TGCC	2	8	3824624	3824631	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8017	NC_015410	ACC	2	6	3824638	3824643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8018	NC_015410	GGC	2	6	3824690	3824695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8019	NC_015410	GCC	2	6	3824705	3824710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8020	NC_015410	TCC	2	6	3825521	3825526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8021	NC_015410	GCG	2	6	3825547	3825552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_015410	A	6	6	3825612	3825617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_015410	CCA	2	6	3827743	3827748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8024	NC_015410	CAA	2	6	3830751	3830756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_015410	CG	3	6	3830785	3830790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8026	NC_015410	GCC	2	6	3830805	3830810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8027	NC_015410	CGT	2	6	3832308	3832313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_015410	CAT	2	6	3832339	3832344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_015410	GCC	2	6	3832424	3832429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8030	NC_015410	CAC	2	6	3832434	3832439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8031	NC_015410	TTC	2	6	3834048	3834053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_015410	CGG	2	6	3834062	3834067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8033	NC_015410	CTTG	2	8	3834070	3834077	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8034	NC_015410	CAT	2	6	3834118	3834123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_015410	GCT	2	6	3834134	3834139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_015410	GCC	2	6	3834152	3834157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8037	NC_015410	ACC	2	6	3834202	3834207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8038	NC_015410	GC	3	6	3835453	3835458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8039	NC_015410	CG	3	6	3835475	3835480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8040	NC_015410	AGG	2	6	3835530	3835535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_015410	GGA	2	6	3835836	3835841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_015410	CTC	2	6	3835856	3835861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8043	NC_015410	GTA	2	6	3835889	3835894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_015410	CCG	2	6	3837443	3837448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8045	NC_015410	GAT	2	6	3837484	3837489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_015410	AGC	2	6	3838980	3838985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8047	NC_015410	CAGA	2	8	3838998	3839005	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8048	NC_015410	A	6	6	3839020	3839025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_015410	CA	3	6	3839028	3839033	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8050	NC_015410	GCT	2	6	3839044	3839049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_015410	GC	3	6	3839055	3839060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8052	NC_015410	AAC	2	6	3840913	3840918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_015410	TGA	2	6	3840925	3840930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_015410	GCC	2	6	3840940	3840945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8055	NC_015410	CGT	3	9	3840976	3840984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_015410	CCG	2	6	3841006	3841011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8057	NC_015410	CG	3	6	3841111	3841116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8058	NC_015410	CCG	2	6	3841855	3841860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8059	NC_015410	GCT	2	6	3841881	3841886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_015410	ACGGCA	2	12	3842298	3842309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_015410	CCGTG	2	10	3842733	3842742	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8062	NC_015410	ATC	2	6	3843257	3843262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_015410	GAA	2	6	3843297	3843302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_015410	GCG	2	6	3843303	3843308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_015410	CAT	2	6	3843357	3843362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8066	NC_015410	AAC	2	6	3843484	3843489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_015410	ACC	2	6	3844922	3844927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8068	NC_015410	ATC	3	9	3844932	3844940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8069	NC_015410	ACA	2	6	3844953	3844958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8070	NC_015410	T	6	6	3845016	3845021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_015410	GCT	2	6	3845068	3845073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8072	NC_015410	CGG	2	6	3845092	3845097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8073	NC_015410	CAAG	2	8	3846171	3846178	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8074	NC_015410	GGCC	2	8	3846201	3846208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8075	NC_015410	GTC	2	6	3847623	3847628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8076	NC_015410	CCA	2	6	3848404	3848409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8077	NC_015410	CGGC	2	8	3848454	3848461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8078	NC_015410	GCCG	2	8	3848484	3848491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8079	NC_015410	ATTC	2	8	3848492	3848499	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8080	NC_015410	CG	3	6	3849564	3849569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8081	NC_015410	CCA	2	6	3849625	3849630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8082	NC_015410	TGT	3	9	3850975	3850983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_015410	GCA	2	6	3851018	3851023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8084	NC_015410	GTTG	2	8	3851034	3851041	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_015410	CGC	2	6	3853491	3853496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8086	NC_015410	GCC	2	6	3853503	3853508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8087	NC_015410	AGC	2	6	3853513	3853518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8088	NC_015410	CGT	2	6	3855292	3855297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8089	NC_015410	CG	3	6	3855329	3855334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8090	NC_015410	GC	3	6	3857016	3857021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8091	NC_015410	CGC	2	6	3857034	3857039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8092	NC_015410	CTG	2	6	3858704	3858709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8093	NC_015410	CGA	2	6	3859117	3859122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8094	NC_015410	T	6	6	3859151	3859156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_015410	CAC	2	6	3859157	3859162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8096	NC_015410	CA	3	6	3860221	3860226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8097	NC_015410	ATG	2	6	3860451	3860456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_015410	AGC	2	6	3860507	3860512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_015410	TGC	2	6	3860516	3860521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8100	NC_015410	GGC	2	6	3860528	3860533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8101	NC_015410	CTT	2	6	3860546	3860551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_015410	CAC	2	6	3860566	3860571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8103	NC_015410	TCG	2	6	3860582	3860587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8104	NC_015410	CTG	2	6	3860593	3860598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8105	NC_015410	ATC	2	6	3860649	3860654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8106	NC_015410	C	6	6	3861520	3861525	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8107	NC_015410	CTG	2	6	3861707	3861712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8108	NC_015410	ATCC	2	8	3861714	3861721	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8109	NC_015410	ACC	2	6	3861724	3861729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8110	NC_015410	GAA	2	6	3862833	3862838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_015410	TTC	2	6	3862868	3862873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_015410	CAC	2	6	3864562	3864567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8113	NC_015410	CA	3	6	3864572	3864577	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8114	NC_015410	TGA	2	6	3866322	3866327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_015410	T	7	7	3866336	3866342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_015410	GCGT	2	8	3868729	3868736	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8117	NC_015410	CTC	2	6	3868821	3868826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8118	NC_015410	GCGCA	2	10	3868869	3868878	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8119	NC_015410	GGC	2	6	3868886	3868891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8120	NC_015410	CACT	2	8	3868898	3868905	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8121	NC_015410	TGG	2	6	3868933	3868938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_015410	GCT	2	6	3868953	3868958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8123	NC_015410	TAG	2	6	3869181	3869186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_015410	GGT	2	6	3869210	3869215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_015410	AAC	2	6	3870291	3870296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8126	NC_015410	CCTGC	2	10	3871660	3871669	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8127	NC_015410	CTGG	2	8	3871712	3871719	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8128	NC_015410	CCG	2	6	3871834	3871839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8129	NC_015410	A	6	6	3871911	3871916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_015410	GCT	2	6	3871933	3871938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8259	NC_015410	ACAAG	2	10	3948495	3948504	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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