MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas mendocina NK-01 chromosome

Total Repeats: 11338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_015410	CTGCGT	2	12	3398647	3398658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_015410	CTG	2	6	3398702	3398707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_015410	CG	3	6	3398719	3398724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7004	NC_015410	GGC	2	6	3399599	3399604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7005	NC_015410	GCTC	2	8	3399701	3399708	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7006	NC_015410	TCC	2	6	3399714	3399719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7007	NC_015410	CGC	2	6	3400970	3400975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7008	NC_015410	AC	3	6	3402530	3402535	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7009	NC_015410	CCTGC	2	10	3402576	3402585	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7010	NC_015410	CAT	2	6	3404385	3404390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_015410	CAG	2	6	3404406	3404411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7012	NC_015410	GCCG	2	8	3404974	3404981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7013	NC_015410	AGC	2	6	3407054	3407059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_015410	CTG	2	6	3407899	3407904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7015	NC_015410	CGGAGC	2	12	3407934	3407945	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_015410	GGC	2	6	3409919	3409924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_015410	GGAC	2	8	3409957	3409964	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7018	NC_015410	CG	3	6	3409984	3409989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7019	NC_015410	TA	3	6	3412917	3412922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_015410	CAC	2	6	3412988	3412993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7021	NC_015410	GAA	2	6	3413004	3413009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_015410	TGG	2	6	3414143	3414148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_015410	CGC	2	6	3414161	3414166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7024	NC_015410	AGCG	2	8	3414919	3414926	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7025	NC_015410	GCAG	2	8	3414932	3414939	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7026	NC_015410	GCG	2	6	3415022	3415027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7027	NC_015410	GCA	2	6	3416454	3416459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7028	NC_015410	TGA	2	6	3416489	3416494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_015410	GATC	2	8	3417414	3417421	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7030	NC_015410	ATG	2	6	3417448	3417453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_015410	AGG	2	6	3417476	3417481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_015410	GTC	2	6	3419024	3419029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7033	NC_015410	GAA	2	6	3419043	3419048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_015410	GCA	2	6	3419113	3419118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7035	NC_015410	C	6	6	3419142	3419147	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7036	NC_015410	CAC	2	6	3419154	3419159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7037	NC_015410	AAC	2	6	3420469	3420474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7038	NC_015410	GCG	2	6	3423941	3423946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7039	NC_015410	CCG	2	6	3423954	3423959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7040	NC_015410	CCT	2	6	3424905	3424910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7041	NC_015410	TTG	2	6	3424919	3424924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_015410	CGAGCC	2	12	3425046	3425057	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7043	NC_015410	GGC	2	6	3425069	3425074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7044	NC_015410	CAG	2	6	3425112	3425117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7045	NC_015410	TCGC	2	8	3425126	3425133	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7046	NC_015410	GCA	2	6	3425847	3425852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7047	NC_015410	GCCC	2	8	3425859	3425866	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7048	NC_015410	CCA	2	6	3425878	3425883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7049	NC_015410	CAG	2	6	3427161	3427166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7050	NC_015410	GCC	2	6	3427170	3427175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7051	NC_015410	TA	3	6	3427618	3427623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_015410	GCAC	2	8	3430618	3430625	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7053	NC_015410	GCG	2	6	3436823	3436828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7054	NC_015410	GAC	2	6	3436907	3436912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7055	NC_015410	GC	3	6	3436932	3436937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7056	NC_015410	CGC	2	6	3437703	3437708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7057	NC_015410	AGG	2	6	3437715	3437720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_015410	GGTG	2	8	3437732	3437739	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_015410	G	6	6	3437751	3437756	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_015410	CAG	3	9	3437782	3437790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7061	NC_015410	ACG	2	6	3437807	3437812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7062	NC_015410	CGC	2	6	3438632	3438637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7063	NC_015410	ACC	2	6	3438655	3438660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7064	NC_015410	CA	3	6	3440477	3440482	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7065	NC_015410	CTG	2	6	3441422	3441427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7066	NC_015410	GAT	2	6	3441462	3441467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_015410	T	6	6	3441479	3441484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_015410	TC	3	6	3441600	3441605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7069	NC_015410	CGG	2	6	3441632	3441637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7070	NC_015410	T	6	6	3441639	3441644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_015410	T	6	6	3443216	3443221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_015410	CGG	2	6	3443227	3443232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7073	NC_015410	GC	4	8	3443268	3443275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7074	NC_015410	TAA	2	6	3443394	3443399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_015410	GAG	2	6	3443404	3443409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_015410	ACA	2	6	3443410	3443415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7077	NC_015410	CGC	2	6	3444684	3444689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7078	NC_015410	T	6	6	3444713	3444718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_015410	GGA	2	6	3444758	3444763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_015410	CGGCT	2	10	3445047	3445056	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7081	NC_015410	GCA	2	6	3445068	3445073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7082	NC_015410	GCAA	2	8	3445122	3445129	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7083	NC_015410	GCA	2	6	3445142	3445147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7084	NC_015410	GC	3	6	3445734	3445739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7085	NC_015410	AATC	2	8	3445831	3445838	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7086	NC_015410	ACC	2	6	3449071	3449076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7087	NC_015410	TCA	2	6	3451411	3451416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7089	NC_015410	CTAC	2	8	3454616	3454623	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7090	NC_015410	AGG	2	6	3454689	3454694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_015410	GCTC	2	8	3457461	3457468	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7092	NC_015410	CGG	2	6	3457521	3457526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7093	NC_015410	GGA	2	6	3457572	3457577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_015410	ACG	2	6	3458416	3458421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7096	NC_015410	C	6	6	3458498	3458503	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7097	NC_015410	GCCTG	2	10	3459590	3459599	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7098	NC_015410	GTT	2	6	3459618	3459623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_015410	GCA	2	6	3459678	3459683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7101	NC_015410	TCG	2	6	3459735	3459740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7102	NC_015410	ACA	2	6	3459871	3459876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_015410	TCG	2	6	3459926	3459931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7104	NC_015410	ACC	2	6	3459975	3459980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7105	NC_015410	GAC	2	6	3460667	3460672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7106	NC_015410	TTTC	2	8	3462122	3462129	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7107	NC_015410	GACAA	2	10	3463902	3463911	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7108	NC_015410	TCA	2	6	3463983	3463988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7109	NC_015410	T	6	6	3466748	3466753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_015410	GCA	2	6	3466883	3466888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7111	NC_015410	CAA	2	6	3466946	3466951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7112	NC_015410	A	6	6	3466993	3466998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_015410	CGA	2	6	3467010	3467015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7114	NC_015410	TGTT	2	8	3468515	3468522	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_015410	CGC	2	6	3468546	3468551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7116	NC_015410	GCC	2	6	3469342	3469347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7117	NC_015410	CCT	2	6	3472625	3472630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7118	NC_015410	AGCGC	2	10	3472737	3472746	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7119	NC_015410	A	8	8	3472801	3472808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_015410	AAT	3	9	3473960	3473968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_015410	CGC	2	6	3474872	3474877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7122	NC_015410	GGC	2	6	3475052	3475057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7123	NC_015410	TC	3	6	3478445	3478450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7124	NC_015410	AGT	2	6	3478451	3478456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7128	NC_015410	ATGA	2	8	3479491	3479498	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7129	NC_015410	GGC	2	6	3479517	3479522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7130	NC_015410	GCGAG	2	10	3479552	3479561	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7131	NC_015410	ACAT	2	8	3479729	3479736	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7132	NC_015410	GATA	2	8	3480766	3480773	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7133	NC_015410	GCG	2	6	3480794	3480799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7134	NC_015410	GTC	2	6	3483836	3483841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7139	NC_015410	C	6	6	3485493	3485498	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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7149	NC_015410	CTCGC	2	10	3494211	3494220	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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7152	NC_015410	CCTG	2	8	3494275	3494282	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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7158	NC_015410	CCG	2	6	3494591	3494596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7162	NC_015410	GAC	2	6	3507690	3507695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7164	NC_015410	CG	4	8	3508816	3508823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7168	NC_015410	TAAT	2	8	3510228	3510235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7172	NC_015410	CGG	2	6	3510576	3510581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7176	NC_015410	TAA	2	6	3510822	3510827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7253	NC_015410	TCC	2	6	3514615	3514620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7254	NC_015410	CTC	2	6	3514706	3514711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7262	NC_015410	GGC	2	6	3515373	3515378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7263	NC_015410	GCT	2	6	3515407	3515412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7264	NC_015410	CT	3	6	3515411	3515416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7265	NC_015410	TCG	2	6	3515513	3515518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7380	NC_015410	ACTC	2	8	3564155	3564162	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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7389	NC_015410	GAT	3	9	3570978	3570986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7391	NC_015410	CACT	2	8	3575511	3575518	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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