MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas brassicacearum subsp. brassicacearum NFM421 chromosome

Total Repeats: 14806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015379	GTC	2	6	1	6	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015379	CCA	2	6	1662	1667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_015379	TTA	2	6	1675	1680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015379	CAG	2	6	2809	2814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015379	GAA	2	6	3937	3942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015379	TACG	2	8	3945	3952	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015379	CAG	2	6	6355	6360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015379	TGGC	2	8	7140	7147	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015379	CGT	2	6	7153	7158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015379	TCC	2	6	7631	7636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_015379	A	8	8	7686	7693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015379	T	8	8	7714	7721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015379	A	6	6	7760	7765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015379	ATTG	2	8	7820	7827	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015379	TAAA	2	8	7878	7885	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015379	T	6	6	9420	9425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015379	TGT	2	6	10233	10238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015379	GCTG	2	8	10251	10258	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015379	GCA	2	6	10291	10296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015379	GC	3	6	10297	10302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015379	A	6	6	10347	10352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015379	AGG	2	6	10375	10380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015379	A	6	6	11959	11964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015379	A	6	6	12049	12054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015379	CAG	2	6	13473	13478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015379	TTCG	2	8	16536	16543	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015379	GTG	2	6	18072	18077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015379	GCT	2	6	19423	19428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015379	GAC	2	6	19462	19467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015379	ACCC	2	8	19493	19500	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_015379	CAGT	2	8	19513	19520	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015379	ACT	2	6	19549	19554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015379	GAG	2	6	19722	19727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015379	TTG	2	6	19728	19733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015379	ACT	2	6	19736	19741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015379	TGA	2	6	19805	19810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015379	AC	3	6	19924	19929	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015379	CCA	2	6	19966	19971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_015379	TTG	2	6	20014	20019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015379	T	6	6	20133	20138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015379	TCAA	2	8	20232	20239	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015379	GA	4	8	21943	21950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015379	TTGA	2	8	22353	22360	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015379	GAG	2	6	22365	22370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015379	A	7	7	23321	23327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015379	CGC	2	6	23328	23333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_015379	GA	3	6	23342	23347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015379	GCG	2	6	23351	23356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015379	T	6	6	23357	23362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015379	T	6	6	24198	24203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015379	GC	3	6	24222	24227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015379	AAT	2	6	24256	24261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015379	GC	3	6	24264	24269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015379	ATTT	2	8	24326	24333	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015379	AGG	2	6	24387	24392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015379	G	6	6	24398	24403	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015379	CAG	2	6	24406	24411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015379	AG	3	6	24437	24442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015379	CGC	2	6	24498	24503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_015379	A	7	7	24607	24613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015379	CCG	2	6	24614	24619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_015379	T	7	7	24629	24635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015379	ACC	2	6	25793	25798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_015379	CAA	2	6	25810	25815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015379	A	7	7	25814	25820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015379	CCA	2	6	25837	25842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_015379	AAC	2	6	25848	25853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015379	CCCG	2	8	25896	25903	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_015379	GT	3	6	25947	25952	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015379	A	6	6	25970	25975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015379	GTT	2	6	25997	26002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015379	GTT	2	6	26099	26104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015379	CGG	2	6	26526	26531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015379	GTTC	2	8	26576	26583	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015379	TGG	2	6	26641	26646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015379	CGGT	2	8	26697	26704	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015379	TTG	2	6	26754	26759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015379	GGC	2	6	28530	28535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015379	GCA	2	6	28563	28568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015379	GGCG	2	8	28598	28605	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015379	CAG	2	6	28613	28618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015379	TTGG	2	8	29687	29694	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015379	TCG	2	6	33325	33330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015379	GGCG	2	8	33439	33446	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015379	CCGC	2	8	34588	34595	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_015379	TAG	2	6	34656	34661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015379	TCAG	2	8	34693	34700	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015379	GGC	2	6	34724	34729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015379	GC	3	6	34750	34755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015379	CTA	2	6	34776	34781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015379	TAG	2	6	34809	34814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015379	GCG	2	6	34825	34830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015379	CA	3	6	35241	35246	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015379	A	8	8	35258	35265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015379	T	6	6	35292	35297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015379	CAC	2	6	35298	35303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_015379	GC	3	6	37896	37901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015379	ATTT	2	8	37933	37940	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015379	A	6	6	37984	37989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015379	TGT	2	6	40257	40262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015379	GCTC	2	8	40287	40294	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015379	GAGC	2	8	40333	40340	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015379	CT	3	6	41078	41083	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015379	CGA	2	6	43159	43164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015379	GA	3	6	43172	43177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015379	TTA	2	6	43180	43185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015379	CTG	2	6	44253	44258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015379	GTC	2	6	45602	45607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015379	CCG	2	6	45635	45640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_015379	CGAG	2	8	48490	48497	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015379	CAGCC	2	10	48577	48586	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
112	NC_015379	AAT	2	6	48664	48669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015379	TGT	2	6	48737	48742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015379	AAG	2	6	48816	48821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015379	T	8	8	48829	48836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015379	GCG	2	6	49509	49514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015379	CGTTTC	2	12	49541	49552	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015379	TA	3	6	49564	49569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015379	TG	3	6	49583	49588	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015379	CGAC	2	8	49624	49631	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015379	TGGC	2	8	50639	50646	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015379	GCC	2	6	50724	50729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_015379	T	6	6	50731	50736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015379	GTCT	2	8	50778	50785	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015379	CGC	2	6	54494	54499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_015379	GC	3	6	54498	54503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015379	ATC	2	6	54509	54514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015379	CCAAAT	2	12	55372	55383	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015379	AATG	2	8	60222	60229	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015379	T	7	7	60344	60350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015379	ACC	2	6	60419	60424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_015379	TGCA	2	8	60503	60510	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015379	TTAA	2	8	60511	60518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015379	TAA	2	6	60544	60549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015379	A	6	6	60548	60553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015379	GGA	2	6	60629	60634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015379	GTC	2	6	60977	60982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015379	AGC	2	6	61693	61698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015379	CTG	2	6	61710	61715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015379	GAG	2	6	61724	61729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015379	CTGA	2	8	61761	61768	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015379	TCA	2	6	61852	61857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015379	TCC	2	6	61959	61964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_015379	TTG	2	6	61983	61988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015379	GA	3	6	62073	62078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015379	C	6	6	62220	62225	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
147	NC_015379	T	6	6	62247	62252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015379	GGGGCA	2	12	62297	62308	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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