MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas brassicacearum subsp. brassicacearum NFM421 chromosome

Total Repeats: 14806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_015379	GGCC	2	8	6108098	6108105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13502	NC_015379	GCTC	2	8	6108119	6108126	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13503	NC_015379	TTCA	2	8	6108139	6108146	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13504	NC_015379	GAGC	2	8	6108164	6108171	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13505	NC_015379	CAC	2	6	6108197	6108202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13506	NC_015379	CAA	2	6	6110343	6110348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13507	NC_015379	CGGG	2	8	6110349	6110356	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13508	NC_015379	TC	3	6	6110441	6110446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13509	NC_015379	CCT	2	6	6110460	6110465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13510	NC_015379	TCA	2	6	6110578	6110583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13511	NC_015379	GGGA	2	8	6110615	6110622	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13512	NC_015379	GCCTG	2	10	6114648	6114657	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13513	NC_015379	GCTC	2	8	6114674	6114681	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13514	NC_015379	CA	3	6	6114714	6114719	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13515	NC_015379	GAGC	2	8	6114732	6114739	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13516	NC_015379	GCG	2	6	6118018	6118023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13517	NC_015379	A	7	7	6118642	6118648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13518	NC_015379	A	8	8	6118652	6118659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13519	NC_015379	TCG	2	6	6118667	6118672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13520	NC_015379	GT	3	6	6118704	6118709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13521	NC_015379	C	6	6	6124169	6124174	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13522	NC_015379	GAGC	2	8	6124180	6124187	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13523	NC_015379	GGC	3	9	6124199	6124207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13524	NC_015379	GCTC	2	8	6124252	6124259	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13525	NC_015379	TTGA	2	8	6124276	6124283	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13526	NC_015379	TGCG	2	8	6124306	6124313	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13527	NC_015379	CCG	2	6	6125341	6125346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13528	NC_015379	AATA	2	8	6125991	6125998	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13529	NC_015379	A	6	6	6125998	6126003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13530	NC_015379	AGT	2	6	6126052	6126057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13531	NC_015379	CGG	2	6	6128018	6128023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13532	NC_015379	CATC	2	8	6128117	6128124	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13533	NC_015379	CGCC	2	8	6128157	6128164	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13534	NC_015379	CAA	2	6	6131664	6131669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13535	NC_015379	GAA	2	6	6131674	6131679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13536	NC_015379	AGCCA	2	10	6133336	6133345	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13537	NC_015379	CAA	2	6	6133376	6133381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13538	NC_015379	A	6	6	6133380	6133385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_015379	T	6	6	6133403	6133408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13540	NC_015379	ACG	2	6	6133844	6133849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13541	NC_015379	CTAC	2	8	6136313	6136320	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13542	NC_015379	ATA	2	6	6136350	6136355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_015379	TAA	2	6	6136362	6136367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13544	NC_015379	AAT	2	6	6136370	6136375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13545	NC_015379	AAC	2	6	6136469	6136474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13546	NC_015379	AAT	2	6	6136487	6136492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13547	NC_015379	TCA	2	6	6136534	6136539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13548	NC_015379	CTC	2	6	6136544	6136549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13549	NC_015379	AG	4	8	6137873	6137880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13550	NC_015379	C	6	6	6139922	6139927	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13551	NC_015379	A	6	6	6140343	6140348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13552	NC_015379	AC	3	6	6140427	6140432	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13553	NC_015379	CGC	2	6	6140511	6140516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13554	NC_015379	TCT	2	6	6141392	6141397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13555	NC_015379	CTT	2	6	6143963	6143968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13556	NC_015379	GCC	2	6	6146777	6146782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13557	NC_015379	GCT	2	6	6147144	6147149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13558	NC_015379	AGG	2	6	6147180	6147185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13559	NC_015379	A	6	6	6147225	6147230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13560	NC_015379	TCA	2	6	6147259	6147264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13561	NC_015379	AAGA	2	8	6147275	6147282	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13562	NC_015379	CTA	2	6	6151590	6151595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13563	NC_015379	TGT	2	6	6151603	6151608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13564	NC_015379	CAAGG	2	10	6151707	6151716	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13565	NC_015379	CGCC	2	8	6151729	6151736	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13566	NC_015379	CCG	2	6	6151760	6151765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13567	NC_015379	TCC	2	6	6156012	6156017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13568	NC_015379	AG	3	6	6156027	6156032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_015379	AGC	2	6	6160192	6160197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13570	NC_015379	CCA	2	6	6160228	6160233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13571	NC_015379	GGT	2	6	6160239	6160244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13572	NC_015379	CCA	2	6	6160309	6160314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13573	NC_015379	A	6	6	6160781	6160786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13574	NC_015379	CAGG	2	8	6161453	6161460	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13575	NC_015379	GAC	2	6	6162701	6162706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13576	NC_015379	AAAG	2	8	6163680	6163687	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13577	NC_015379	AC	3	6	6163692	6163697	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13578	NC_015379	AGG	2	6	6163717	6163722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13579	NC_015379	GAA	2	6	6165048	6165053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13580	NC_015379	CA	3	6	6165064	6165069	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13581	NC_015379	CAT	2	6	6165244	6165249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13582	NC_015379	TGG	2	6	6165315	6165320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13583	NC_015379	CCT	2	6	6165395	6165400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13584	NC_015379	CAAAA	2	10	6167785	6167794	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13585	NC_015379	CAG	2	6	6167808	6167813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13586	NC_015379	CTG	2	6	6167898	6167903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13587	NC_015379	GGGAT	2	10	6167909	6167918	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
13588	NC_015379	GGT	2	6	6167921	6167926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13589	NC_015379	GTC	2	6	6167941	6167946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13590	NC_015379	TTCGT	2	10	6168041	6168050	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13591	NC_015379	CA	3	6	6168054	6168059	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13592	NC_015379	GGA	2	6	6168091	6168096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13593	NC_015379	AC	3	6	6168173	6168178	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13594	NC_015379	CGT	2	6	6168191	6168196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13595	NC_015379	AGC	2	6	6168372	6168377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13596	NC_015379	ACG	2	6	6168426	6168431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13597	NC_015379	TGA	2	6	6168506	6168511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13598	NC_015379	CCG	2	6	6168534	6168539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13599	NC_015379	ACC	2	6	6168621	6168626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13600	NC_015379	GTCT	2	8	6168663	6168670	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13601	NC_015379	GC	3	6	6168680	6168685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13602	NC_015379	CTC	2	6	6168740	6168745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13603	NC_015379	AGG	2	6	6168757	6168762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13604	NC_015379	CCA	2	6	6168784	6168789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13605	NC_015379	GGT	2	6	6168844	6168849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13606	NC_015379	ATTTCA	2	12	6169000	6169011	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13607	NC_015379	GCC	2	6	6169034	6169039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13608	NC_015379	GCC	2	6	6169114	6169119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13609	NC_015379	TAA	2	6	6169239	6169244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13610	NC_015379	GCA	2	6	6169287	6169292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13611	NC_015379	TC	3	6	6169365	6169370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13612	NC_015379	ACC	2	6	6169395	6169400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13613	NC_015379	TCA	2	6	6169497	6169502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13614	NC_015379	ACC	2	6	6169546	6169551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13615	NC_015379	CAAC	2	8	6169563	6169570	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13616	NC_015379	CTC	2	6	6169827	6169832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13617	NC_015379	CGACT	2	10	6169904	6169913	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13618	NC_015379	CTTT	2	8	6169928	6169935	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13619	NC_015379	GCT	2	6	6169944	6169949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13620	NC_015379	CCT	2	6	6169960	6169965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13621	NC_015379	GTT	2	6	6170034	6170039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13622	NC_015379	ACG	2	6	6170049	6170054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13623	NC_015379	GT	3	6	6170071	6170076	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13624	NC_015379	GAG	2	6	6170202	6170207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13625	NC_015379	TCGGT	2	10	6170280	6170289	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13626	NC_015379	CAA	2	6	6170468	6170473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13627	NC_015379	GTCA	2	8	6170575	6170582	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13628	NC_015379	GTA	2	6	6170583	6170588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13630	NC_015379	C	6	6	6170608	6170613	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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