MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas brassicacearum subsp. brassicacearum NFM421 chromosome

Total Repeats: 14806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_015379	GCC	2	6	5873797	5873802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13002	NC_015379	CGAG	2	8	5873810	5873817	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13003	NC_015379	CGA	2	6	5873839	5873844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13004	NC_015379	GAGC	2	8	5873879	5873886	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13005	NC_015379	GCTC	2	8	5873951	5873958	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13006	NC_015379	GCC	2	6	5874006	5874011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13007	NC_015379	CTA	2	6	5874087	5874092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13008	NC_015379	GCC	2	6	5874094	5874099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13009	NC_015379	ATGG	2	8	5874205	5874212	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_015379	CGG	2	6	5874220	5874225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_015379	GTG	2	6	5874279	5874284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_015379	GCC	2	6	5874329	5874334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13013	NC_015379	GCA	2	6	5874365	5874370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_015379	A	6	6	5875582	5875587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_015379	ACC	2	6	5881277	5881282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13016	NC_015379	GTT	2	6	5881295	5881300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_015379	TCG	2	6	5881315	5881320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_015379	GAG	2	6	5881336	5881341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_015379	GC	3	6	5882805	5882810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13020	NC_015379	GAGC	2	8	5882874	5882881	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13021	NC_015379	CGATGG	2	12	5882889	5882900	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13022	NC_015379	CGAG	2	8	5882938	5882945	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13023	NC_015379	GCA	2	6	5882970	5882975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13024	NC_015379	CTT	2	6	5887719	5887724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13025	NC_015379	CGG	2	6	5887755	5887760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13026	NC_015379	CGA	2	6	5887762	5887767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13027	NC_015379	CAG	2	6	5889407	5889412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13028	NC_015379	AAC	2	6	5889416	5889421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13029	NC_015379	CGC	2	6	5889445	5889450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13030	NC_015379	GAAA	2	8	5889497	5889504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_015379	GCA	2	6	5889516	5889521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13032	NC_015379	TTTG	2	8	5889593	5889600	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_015379	GAG	2	6	5889622	5889627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_015379	A	6	6	5889928	5889933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_015379	T	6	6	5889950	5889955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_015379	C	7	7	5889971	5889977	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13037	NC_015379	CCA	2	6	5890019	5890024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13038	NC_015379	GCTC	2	8	5890037	5890044	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13039	NC_015379	CA	3	6	5890066	5890071	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13040	NC_015379	CACC	2	8	5890077	5890084	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13041	NC_015379	CAC	2	6	5890216	5890221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13042	NC_015379	GAGC	2	8	5890235	5890242	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13043	NC_015379	CAA	2	6	5892354	5892359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13044	NC_015379	A	7	7	5892372	5892378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_015379	CGCC	2	8	5892394	5892401	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13046	NC_015379	ACG	2	6	5894017	5894022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13047	NC_015379	GCC	2	6	5894032	5894037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13048	NC_015379	ATT	2	6	5894044	5894049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_015379	CGC	2	6	5894077	5894082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13050	NC_015379	GCG	2	6	5894091	5894096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13051	NC_015379	GAT	2	6	5894118	5894123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_015379	GCCA	2	8	5894157	5894164	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13053	NC_015379	GCTG	2	8	5894240	5894247	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13054	NC_015379	AC	3	6	5895557	5895562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13055	NC_015379	A	7	7	5895586	5895592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_015379	TGA	2	6	5895631	5895636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_015379	AAG	2	6	5896392	5896397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_015379	TGGC	2	8	5896404	5896411	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13059	NC_015379	TGC	2	6	5896458	5896463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13060	NC_015379	AG	3	6	5896500	5896505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_015379	TGGG	2	8	5896542	5896549	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_015379	GCA	2	6	5897689	5897694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13063	NC_015379	CAA	2	6	5897709	5897714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13064	NC_015379	TA	3	6	5897720	5897725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_015379	TCC	2	6	5897741	5897746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13066	NC_015379	CTG	2	6	5898110	5898115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13067	NC_015379	ATTCC	2	10	5898117	5898126	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13068	NC_015379	ATT	2	6	5898277	5898282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_015379	GAGC	2	8	5898589	5898596	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13070	NC_015379	GT	3	6	5898611	5898616	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_015379	ATCGAT	2	12	5898625	5898636	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13072	NC_015379	TGAC	2	8	5898637	5898644	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13073	NC_015379	GCTC	2	8	5898660	5898667	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13074	NC_015379	T	6	6	5898674	5898679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_015379	CGTG	2	8	5899360	5899367	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13076	NC_015379	GCC	2	6	5899459	5899464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13077	NC_015379	CGCC	2	8	5899476	5899483	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13078	NC_015379	GGCG	2	8	5899496	5899503	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13079	NC_015379	A	6	6	5900037	5900042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_015379	CCCT	2	8	5900088	5900095	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13081	NC_015379	GGC	2	6	5900492	5900497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13082	NC_015379	GAG	2	6	5900529	5900534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_015379	GAT	2	6	5900548	5900553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_015379	AGA	2	6	5900581	5900586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_015379	GTG	2	6	5900658	5900663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_015379	AAT	2	6	5900676	5900681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_015379	AGCT	2	8	5900818	5900825	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13088	NC_015379	G	7	7	5900832	5900838	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_015379	CTC	2	6	5904077	5904082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13090	NC_015379	AACG	2	8	5906017	5906024	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13091	NC_015379	CAC	2	6	5906032	5906037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13092	NC_015379	A	7	7	5907138	5907144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_015379	ACCG	2	8	5907176	5907183	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13094	NC_015379	CGGCAC	2	12	5908900	5908911	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13095	NC_015379	TCA	2	6	5908919	5908924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13096	NC_015379	GCGG	2	8	5908931	5908938	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13097	NC_015379	GCC	2	6	5909014	5909019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13098	NC_015379	GCC	2	6	5909056	5909061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13099	NC_015379	GGCC	2	8	5912987	5912994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13100	NC_015379	C	6	6	5913158	5913163	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13101	NC_015379	T	7	7	5914497	5914503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_015379	AAC	2	6	5914526	5914531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13103	NC_015379	TAA	2	6	5914584	5914589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13104	NC_015379	TC	3	6	5914600	5914605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13105	NC_015379	TTC	2	6	5914766	5914771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13106	NC_015379	GCG	2	6	5914839	5914844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13107	NC_015379	GGC	2	6	5914877	5914882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13108	NC_015379	CCT	2	6	5914885	5914890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13109	NC_015379	ACA	2	6	5914917	5914922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13110	NC_015379	ATC	2	6	5915004	5915009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13111	NC_015379	CAT	2	6	5915017	5915022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_015379	TTATCT	2	12	5915116	5915127	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13113	NC_015379	AGTC	2	8	5915203	5915210	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13114	NC_015379	GGCGG	2	10	5915235	5915244	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
13115	NC_015379	ACC	2	6	5915251	5915256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13116	NC_015379	T	6	6	5915262	5915267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_015379	AAT	2	6	5915406	5915411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_015379	TCCC	2	8	5915463	5915470	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13119	NC_015379	GAC	2	6	5916787	5916792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13120	NC_015379	GAGC	2	8	5919292	5919299	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13121	NC_015379	GTCA	2	8	5919319	5919326	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13122	NC_015379	TGC	2	6	5919334	5919339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13123	NC_015379	CCAG	2	8	5921687	5921694	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13124	NC_015379	AAGA	2	8	5921701	5921708	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13125	NC_015379	CGTT	2	8	5921754	5921761	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13126	NC_015379	CAG	2	6	5921765	5921770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13127	NC_015379	GAT	2	6	5923718	5923723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13128	NC_015379	GAC	2	6	5924354	5924359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13130	NC_015379	A	6	6	5926084	5926089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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