MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas brassicacearum subsp. brassicacearum NFM421 chromosome

Total Repeats: 14806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_015379	GAGC	2	8	5244527	5244534	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11502	NC_015379	TGA	2	6	5244563	5244568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_015379	CTG	2	6	5244581	5244586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_015379	A	7	7	5244626	5244632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_015379	A	8	8	5244637	5244644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_015379	T	6	6	5244671	5244676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_015379	TGA	2	6	5244714	5244719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_015379	ACTCC	2	10	5246175	5246184	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
11509	NC_015379	CAG	2	6	5246185	5246190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11510	NC_015379	ATCA	2	8	5246208	5246215	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11511	NC_015379	ACT	2	6	5246251	5246256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11512	NC_015379	CGG	2	6	5246287	5246292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11513	NC_015379	A	6	6	5246337	5246342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_015379	ACG	2	6	5246402	5246407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11515	NC_015379	AGAAA	2	10	5246416	5246425	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_015379	AC	3	6	5246426	5246431	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11517	NC_015379	CTTCT	2	10	5246458	5246467	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11518	NC_015379	AGG	2	6	5246477	5246482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_015379	TGC	2	6	5247176	5247181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11520	NC_015379	AAC	2	6	5247183	5247188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11521	NC_015379	TTG	2	6	5247275	5247280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_015379	GTC	2	6	5247294	5247299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11523	NC_015379	T	6	6	5247319	5247324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_015379	AAT	2	6	5247375	5247380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_015379	ACC	2	6	5247491	5247496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11526	NC_015379	ACA	2	6	5247752	5247757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11527	NC_015379	A	8	8	5247764	5247771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_015379	GCC	2	6	5249154	5249159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11529	NC_015379	AAT	2	6	5249180	5249185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_015379	TTC	2	6	5251863	5251868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11531	NC_015379	AAT	2	6	5253078	5253083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_015379	ACA	2	6	5253105	5253110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11533	NC_015379	TG	3	6	5253118	5253123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_015379	GCTC	2	8	5253149	5253156	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11535	NC_015379	CCG	2	6	5253185	5253190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11536	NC_015379	GGC	2	6	5253202	5253207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11537	NC_015379	CGG	2	6	5253241	5253246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11538	NC_015379	TGG	2	6	5253281	5253286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_015379	T	6	6	5253295	5253300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_015379	CAG	2	6	5253319	5253324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11541	NC_015379	AG	3	6	5253366	5253371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_015379	CGACTG	2	12	5253394	5253405	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11543	NC_015379	GCG	2	6	5253413	5253418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11544	NC_015379	CA	3	6	5253458	5253463	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11545	NC_015379	GAGC	2	8	5254009	5254016	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11546	NC_015379	GGT	2	6	5254031	5254036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_015379	GCTC	2	8	5254081	5254088	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11548	NC_015379	CG	4	8	5255477	5255484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11549	NC_015379	T	7	7	5256858	5256864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_015379	AAC	2	6	5256877	5256882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11551	NC_015379	A	6	6	5260630	5260635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_015379	TGA	2	6	5262066	5262071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_015379	GCC	2	6	5262136	5262141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11554	NC_015379	CTT	2	6	5262151	5262156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11555	NC_015379	GCG	2	6	5262263	5262268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11556	NC_015379	AT	3	6	5262273	5262278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_015379	C	8	8	5262374	5262381	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11558	NC_015379	AG	3	6	5262432	5262437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_015379	TGCC	2	8	5262442	5262449	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11560	NC_015379	GGCG	2	8	5263431	5263438	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11561	NC_015379	GCA	2	6	5263508	5263513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11562	NC_015379	CGGT	2	8	5264310	5264317	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11563	NC_015379	GATCG	2	10	5264347	5264356	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11564	NC_015379	A	6	6	5265775	5265780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_015379	TTGC	2	8	5265804	5265811	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11566	NC_015379	TGC	2	6	5266693	5266698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11567	NC_015379	ACG	2	6	5266734	5266739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11568	NC_015379	TTC	2	6	5266782	5266787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11569	NC_015379	ACA	2	6	5266794	5266799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11570	NC_015379	AAG	2	6	5266866	5266871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_015379	TGC	2	6	5266885	5266890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11572	NC_015379	ATT	2	6	5266904	5266909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_015379	CCT	2	6	5267057	5267062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11574	NC_015379	TAA	2	6	5267252	5267257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_015379	A	6	6	5267256	5267261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_015379	CGGG	2	8	5267279	5267286	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11577	NC_015379	GTT	2	6	5269287	5269292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_015379	GGGC	2	8	5269317	5269324	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11579	NC_015379	CGA	2	6	5269338	5269343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11580	NC_015379	GTA	2	6	5269346	5269351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_015379	CCA	2	6	5269389	5269394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11582	NC_015379	GAGC	2	8	5269407	5269414	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11583	NC_015379	ATT	2	6	5269478	5269483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_015379	CAAC	2	8	5269491	5269498	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11585	NC_015379	AAC	2	6	5269969	5269974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11586	NC_015379	ACA	2	6	5270274	5270279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11587	NC_015379	A	6	6	5270296	5270301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_015379	T	6	6	5270308	5270313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_015379	A	8	8	5270318	5270325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_015379	A	8	8	5270344	5270351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_015379	GCC	2	6	5270398	5270403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11592	NC_015379	TCG	2	6	5270427	5270432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11593	NC_015379	A	6	6	5270445	5270450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_015379	CCT	2	6	5270536	5270541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11595	NC_015379	GCT	2	6	5270599	5270604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11596	NC_015379	CAA	2	6	5270606	5270611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11597	NC_015379	GAC	2	6	5270675	5270680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11598	NC_015379	GAAA	2	8	5271937	5271944	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_015379	T	6	6	5271989	5271994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_015379	TCT	2	6	5271996	5272001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11601	NC_015379	GC	3	6	5272034	5272039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11602	NC_015379	CCT	2	6	5272144	5272149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11603	NC_015379	C	6	6	5272163	5272168	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11604	NC_015379	CAC	2	6	5272909	5272914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11605	NC_015379	TGA	2	6	5273834	5273839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_015379	GGTG	2	8	5274024	5274031	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_015379	GGTT	2	8	5274048	5274055	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_015379	GCTC	2	8	5274073	5274080	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11609	NC_015379	GT	3	6	5274097	5274102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_015379	CGC	2	6	5274122	5274127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11611	NC_015379	CGT	2	6	5275927	5275932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11612	NC_015379	CTCA	2	8	5275991	5275998	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11613	NC_015379	CAG	2	6	5276021	5276026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11614	NC_015379	CCT	2	6	5276277	5276282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11615	NC_015379	TGC	2	6	5276306	5276311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11616	NC_015379	GA	3	6	5277150	5277155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_015379	CGA	2	6	5277159	5277164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11618	NC_015379	AGCA	2	8	5277191	5277198	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11619	NC_015379	AAT	2	6	5277203	5277208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_015379	A	7	7	5278022	5278028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_015379	AAC	2	6	5278049	5278054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11622	NC_015379	T	6	6	5278072	5278077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_015379	C	6	6	5278096	5278101	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11624	NC_015379	TGCA	2	8	5279561	5279568	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11625	NC_015379	TC	3	6	5279660	5279665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11626	NC_015379	CGA	2	6	5279674	5279679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11627	NC_015379	GCG	2	6	5281894	5281899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11628	NC_015379	TC	3	6	5281902	5281907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11630	NC_015379	GAGCT	2	10	5283001	5283010	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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