MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudonocardia dioxanivorans CB1190 plasmid pPSED03

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015313	GGC	2	6	18	23	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015313	GCG	2	6	32	37	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015313	GT	4	8	41	48	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015313	GC	3	6	55	60	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015313	C	6	6	161	166	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6	NC_015313	GGA	2	6	195	200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015313	GGA	2	6	206	211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015313	GGA	2	6	215	220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015313	TCC	2	6	232	237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_015313	TCC	2	6	244	249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_015313	GGAG	2	8	298	305	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015313	GGA	2	6	311	316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015313	TA	3	6	340	345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015313	TCC	2	6	386	391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_015313	TCC	2	6	395	400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_015313	GGA	2	6	454	459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015313	GGA	2	6	466	471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015313	GGA	2	6	476	481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015313	GGA	2	6	485	490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015313	TCC	2	6	504	509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_015313	GGC	2	6	522	527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015313	GGC	2	6	544	549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015313	TTG	2	6	553	558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015313	CCG	2	6	578	583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_015313	AGG	2	6	709	714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015313	GGACA	2	10	734	743	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015313	GCTG	2	8	763	770	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015313	TGC	2	6	790	795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015313	CG	3	6	805	810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015313	CGC	2	6	828	833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_015313	GAA	2	6	846	851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015313	GTCT	2	8	921	928	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015313	CGG	2	6	942	947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015313	ATCG	2	8	1004	1011	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015313	CCG	2	6	1030	1035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_015313	CG	3	6	1042	1047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015313	GTC	2	6	1319	1324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015313	CGA	2	6	1388	1393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015313	GCGT	2	8	1434	1441	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015313	TA	3	6	1442	1447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015313	TCG	2	6	1492	1497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015313	GGC	2	6	4263	4268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015313	TCG	2	6	4278	4283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015313	AAAT	2	8	4306	4313	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015313	GAT	2	6	4319	4324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015313	ACC	2	6	4343	4348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_015313	CGC	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_015313	TAA	2	6	4378	4383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015313	TCC	2	6	5165	5170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_015313	CGGC	2	8	5204	5211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015313	TC	3	6	5244	5249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015313	CG	3	6	5375	5380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015313	ACG	2	6	5440	5445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015313	CGG	2	6	5457	5462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015313	GCAGC	2	10	6621	6630	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_015313	CAC	2	6	6637	6642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_015313	AG	4	8	6695	6702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015313	GCGTC	2	10	6784	6793	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_015313	GCC	2	6	6812	6817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_015313	GCT	2	6	6818	6823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015313	CCG	2	6	8875	8880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_015313	AACG	2	8	8897	8904	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015313	CCG	2	6	8930	8935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_015313	GTA	2	6	8940	8945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015313	ACTC	2	8	11413	11420	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015313	CTCA	2	8	11433	11440	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015313	CGG	2	6	11506	11511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015313	TCG	2	6	11519	11524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015313	TCG	2	6	11596	11601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015313	TA	3	6	11611	11616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015313	GCC	2	6	11678	11683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015313	CGCGC	2	10	11751	11760	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
73	NC_015313	CCG	2	6	11802	11807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_015313	ATAG	2	8	11854	11861	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015313	GCAC	2	8	11866	11873	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015313	AG	3	6	13575	13580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015313	GCA	2	6	14047	14052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015313	CAT	2	6	14160	14165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015313	TCG	2	6	14180	14185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015313	CGA	2	6	14196	14201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015313	CTG	2	6	14327	14332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015313	ATG	2	6	14369	14374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015313	TGG	2	6	14520	14525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015313	AT	3	6	14527	14532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015313	CCG	2	6	14624	14629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_015313	CGG	2	6	14638	14643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015313	CCG	2	6	14671	14676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_015313	CGC	2	6	14693	14698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_015313	GGA	2	6	14712	14717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015313	TCC	2	6	14731	14736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_015313	TCC	2	6	14740	14745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_015313	TCC	2	6	14750	14755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_015313	TCC	2	6	14762	14767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_015313	GGA	2	6	14821	14826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015313	GGA	2	6	14830	14835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015313	TCC	2	6	14849	14854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_015313	GGC	2	6	14867	14872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015313	GGC	2	6	14888	14893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015313	CCG	2	6	14923	14928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_015313	CGG	2	6	14937	14942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015313	AT	3	6	15034	15039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015313	CCA	2	6	15041	15046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.