MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Planctomyces brasiliensis DSM 5305 chromosome

Total Repeats: 15716

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_015174	GTT	2	6	5918506	5918511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15502	NC_015174	CGC	2	6	5918526	5918531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15503	NC_015174	CGA	2	6	5918541	5918546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15504	NC_015174	GAAAT	2	10	5919053	5919062	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15505	NC_015174	CCGG	2	8	5919087	5919094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15506	NC_015174	CTG	2	6	5919111	5919116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15507	NC_015174	GACC	2	8	5919126	5919133	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15508	NC_015174	TGAC	2	8	5919139	5919146	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15509	NC_015174	CTG	2	6	5919210	5919215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15510	NC_015174	ATCAAG	2	12	5919269	5919280	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15511	NC_015174	CGG	2	6	5919320	5919325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15512	NC_015174	G	6	6	5919361	5919366	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15513	NC_015174	AGTC	2	8	5920230	5920237	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15514	NC_015174	CCA	2	6	5920399	5920404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15515	NC_015174	CAA	2	6	5922867	5922872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15516	NC_015174	GCGT	2	8	5922895	5922902	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15517	NC_015174	T	6	6	5922905	5922910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15518	NC_015174	GTCA	2	8	5922992	5922999	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15519	NC_015174	C	10	10	5923041	5923050	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15520	NC_015174	GCT	2	6	5923072	5923077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15521	NC_015174	TCC	2	6	5923099	5923104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15522	NC_015174	AGTT	2	8	5923107	5923114	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15523	NC_015174	AGG	2	6	5924733	5924738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15524	NC_015174	CTA	2	6	5924799	5924804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15525	NC_015174	CAT	2	6	5926283	5926288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15526	NC_015174	TGA	2	6	5928756	5928761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15527	NC_015174	GA	3	6	5928772	5928777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15528	NC_015174	GAG	2	6	5928795	5928800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15529	NC_015174	ATA	2	6	5928845	5928850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15530	NC_015174	ACG	2	6	5928851	5928856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15531	NC_015174	GA	3	6	5928970	5928975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15532	NC_015174	TCG	2	6	5929048	5929053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15533	NC_015174	GTC	2	6	5936581	5936586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15534	NC_015174	TGT	2	6	5936587	5936592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15535	NC_015174	AATT	2	8	5937688	5937695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15536	NC_015174	TGG	2	6	5937697	5937702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15537	NC_015174	TGGG	2	8	5937736	5937743	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15538	NC_015174	AC	3	6	5937798	5937803	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15539	NC_015174	CGTC	2	8	5937843	5937850	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15540	NC_015174	TCG	2	6	5938364	5938369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15541	NC_015174	CTG	2	6	5938379	5938384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15542	NC_015174	ATCA	2	8	5938944	5938951	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15543	NC_015174	CTT	2	6	5938986	5938991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15544	NC_015174	CAGA	2	8	5940010	5940017	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15545	NC_015174	CAA	2	6	5940062	5940067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15546	NC_015174	GAAT	2	8	5940170	5940177	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15547	NC_015174	GGCA	2	8	5940183	5940190	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15548	NC_015174	GCT	2	6	5940283	5940288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15549	NC_015174	GGA	2	6	5942070	5942075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15550	NC_015174	CCG	2	6	5942081	5942086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15551	NC_015174	AAT	2	6	5942092	5942097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15552	NC_015174	CGGG	2	8	5942113	5942120	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15553	NC_015174	A	6	6	5943597	5943602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15554	NC_015174	AAG	2	6	5943765	5943770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15555	NC_015174	CGC	2	6	5943864	5943869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15556	NC_015174	AG	3	6	5943882	5943887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15557	NC_015174	A	6	6	5943911	5943916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15558	NC_015174	CCG	2	6	5943938	5943943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15559	NC_015174	ATG	2	6	5943996	5944001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15560	NC_015174	CCGA	2	8	5945097	5945104	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15561	NC_015174	ACA	2	6	5945172	5945177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15562	NC_015174	ACGA	2	8	5945193	5945200	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15563	NC_015174	GGC	2	6	5945209	5945214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15564	NC_015174	TCT	2	6	5945216	5945221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15565	NC_015174	CGTG	2	8	5945243	5945250	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15566	NC_015174	C	6	6	5945388	5945393	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15567	NC_015174	TGCC	2	8	5946377	5946384	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15568	NC_015174	CGTT	2	8	5946406	5946413	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15569	NC_015174	TC	3	6	5946415	5946420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15570	NC_015174	CTGA	2	8	5946864	5946871	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15571	NC_015174	CAA	2	6	5946921	5946926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15572	NC_015174	CAAT	2	8	5947052	5947059	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15573	NC_015174	T	6	6	5947122	5947127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15574	NC_015174	GAC	2	6	5947142	5947147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15575	NC_015174	TGC	2	6	5947177	5947182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15576	NC_015174	ACA	2	6	5948852	5948857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15577	NC_015174	GCA	2	6	5951399	5951404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15578	NC_015174	T	6	6	5951456	5951461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15579	NC_015174	CAG	2	6	5951500	5951505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15580	NC_015174	CCGA	2	8	5951575	5951582	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15581	NC_015174	TCTGT	2	10	5951598	5951607	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15582	NC_015174	GCA	3	9	5955490	5955498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15583	NC_015174	G	6	6	5956214	5956219	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15584	NC_015174	CAGG	2	8	5956246	5956253	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15585	NC_015174	GGA	2	6	5956265	5956270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15586	NC_015174	T	6	6	5956416	5956421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15587	NC_015174	CAGG	2	8	5956516	5956523	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15588	NC_015174	AAC	2	6	5956552	5956557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15589	NC_015174	ATG	2	6	5956568	5956573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15590	NC_015174	CGC	2	6	5956597	5956602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15591	NC_015174	CCT	2	6	5956653	5956658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15592	NC_015174	AAT	2	6	5958534	5958539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15593	NC_015174	CGA	2	6	5958581	5958586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15594	NC_015174	GGA	2	6	5958609	5958614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15595	NC_015174	CAG	2	6	5959560	5959565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15596	NC_015174	CCA	2	6	5959655	5959660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15597	NC_015174	A	7	7	5959769	5959775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15598	NC_015174	TTTCT	2	10	5959822	5959831	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15599	NC_015174	CCA	2	6	5960469	5960474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15600	NC_015174	AAAC	2	8	5960585	5960592	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15601	NC_015174	GC	3	6	5960607	5960612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15602	NC_015174	TTTCT	2	10	5960638	5960647	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15603	NC_015174	TTTA	2	8	5960671	5960678	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15604	NC_015174	CACCT	2	10	5960681	5960690	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
15605	NC_015174	CAC	2	6	5961226	5961231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15606	NC_015174	TC	3	6	5961264	5961269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15607	NC_015174	CTG	2	6	5961270	5961275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15608	NC_015174	ATCG	2	8	5961288	5961295	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15609	NC_015174	GGAA	2	8	5961296	5961303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15610	NC_015174	TG	3	6	5961371	5961376	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15611	NC_015174	TCGA	2	8	5961484	5961491	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15612	NC_015174	TC	3	6	5961503	5961508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15613	NC_015174	TCC	2	6	5961513	5961518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15614	NC_015174	GTG	2	6	5961527	5961532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15615	NC_015174	TCTCG	2	10	5962848	5962857	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15616	NC_015174	GCT	2	6	5962884	5962889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15617	NC_015174	TCG	2	6	5962913	5962918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15618	NC_015174	CGC	2	6	5962970	5962975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15619	NC_015174	GCCG	2	8	5962980	5962987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15620	NC_015174	CTT	2	6	5963725	5963730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15621	NC_015174	TAAC	2	8	5963856	5963863	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15622	NC_015174	CAA	2	6	5963868	5963873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15623	NC_015174	A	7	7	5963872	5963878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15624	NC_015174	AGGC	2	8	5963892	5963899	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15625	NC_015174	TCTG	2	8	5965321	5965328	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15626	NC_015174	GAC	2	6	5965433	5965438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15627	NC_015174	CAGG	2	8	5965446	5965453	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15628	NC_015174	CGA	2	6	5965553	5965558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15630	NC_015174	CCG	2	6	5965712	5965717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.