MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Pantoea sp. At-9b plasmid pPAT9B02

Total Repeats: 2997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014839	CGGG	2	8	29	36	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014839	CTGCGC	2	12	37	48	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014839	GCT	2	6	8515	8520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014839	CTGAA	2	10	8525	8534	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014839	GTG	2	6	8636	8641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014839	CAG	2	6	8746	8751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014839	AGC	2	6	8759	8764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014839	CTG	2	6	8770	8775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014839	CGC	2	6	8788	8793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_014839	TCA	2	6	8807	8812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014839	TGC	2	6	8870	8875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014839	TG	3	6	8876	8881	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014839	GCA	2	6	8907	8912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014839	GTGA	2	8	9094	9101	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014839	ATC	2	6	9103	9108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014839	ACGA	2	8	9119	9126	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014839	AGC	2	6	9738	9743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014839	T	6	6	9764	9769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014839	AAT	2	6	9827	9832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014839	CTG	2	6	10848	10853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014839	TAA	2	6	10867	10872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014839	T	7	7	10954	10960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014839	ACT	2	6	11014	11019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014839	AGA	2	6	11044	11049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014839	T	6	6	11070	11075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014839	ATAA	2	8	11096	11103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014839	AGC	2	6	11130	11135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014839	ACA	2	6	11174	11179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014839	CA	3	6	11178	11183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014839	CT	3	6	11213	11218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014839	CAA	2	6	11226	11231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014839	ACCT	2	8	11233	11240	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014839	GCC	2	6	11509	11514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_014839	TGT	2	6	11558	11563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014839	ATT	2	6	11584	11589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014839	CTG	2	6	11622	11627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014839	AAG	2	6	12362	12367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014839	TAC	2	6	12370	12375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014839	GTTTG	2	10	12378	12387	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014839	GAA	2	6	12392	12397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014839	TAAGC	2	10	12470	12479	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014839	CTG	2	6	12502	12507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014839	ACA	2	6	13931	13936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014839	CTG	2	6	14081	14086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014839	C	6	6	15440	15445	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46	NC_014839	TCA	2	6	15461	15466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014839	AGC	2	6	15470	15475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014839	TG	3	6	15533	15538	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014839	C	7	7	17158	17164	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_014839	CTG	2	6	17178	17183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014839	T	6	6	17204	17209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014839	ATG	2	6	17222	17227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014839	GTC	2	6	17259	17264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014839	AGC	2	6	17311	17316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014839	A	8	8	17335	17342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014839	GCAGC	2	10	17365	17374	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_014839	C	6	6	17413	17418	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
58	NC_014839	GGT	2	6	17450	17455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014839	CTC	2	6	17548	17553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_014839	CGCA	2	8	17576	17583	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014839	TCT	2	6	17604	17609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014839	CAC	2	6	17612	17617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_014839	TTC	2	6	17621	17626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014839	AAC	2	6	17631	17636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014839	CTC	2	6	17645	17650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_014839	CAT	2	6	17651	17656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014839	GTC	2	6	17676	17681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014839	CAA	2	6	17704	17709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014839	TCT	2	6	17766	17771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014839	TCC	2	6	17877	17882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_014839	TAA	2	6	17886	17891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014839	AAG	2	6	18019	18024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014839	T	7	7	18050	18056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014839	ACC	2	6	18108	18113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_014839	GCAA	2	8	18124	18131	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014839	T	6	6	18132	18137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014839	TCA	2	6	18161	18166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014839	A	6	6	19193	19198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014839	ATC	2	6	19210	19215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014839	GAT	2	6	19232	19237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014839	AATG	2	8	19238	19245	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014839	AAT	2	6	19270	19275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014839	ATG	2	6	19317	19322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014839	ATT	2	6	19327	19332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014839	ACT	2	6	20288	20293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014839	AGT	2	6	20304	20309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014839	AAT	2	6	21296	21301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014839	ACCT	2	8	22364	22371	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014839	CAAA	2	8	22445	22452	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014839	ATTT	2	8	22496	22503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014839	ACC	2	6	22520	22525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_014839	A	6	6	22527	22532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014839	A	7	7	22538	22544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014839	TAAAA	2	10	22555	22564	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014839	AAAAT	2	10	23731	23740	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014839	ATT	2	6	23750	23755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014839	A	6	6	23764	23769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014839	CAA	2	6	23770	23775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014839	CATTTA	4	24	23814	23837	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014839	ATG	2	6	23857	23862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014839	ATAA	2	8	23926	23933	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014839	A	6	6	24030	24035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014839	TTTAA	2	10	26422	26431	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014839	A	7	7	27416	27422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014839	TTA	2	6	27437	27442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014839	ACCA	2	8	27498	27505	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_014839	CTAT	2	8	29182	29189	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014839	TAAAT	2	10	31094	31103	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014839	ATA	2	6	31132	31137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014839	AAT	2	6	31196	31201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014839	TAAA	2	8	31202	31209	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014839	CAC	2	6	31243	31248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_014839	AT	3	6	31290	31295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014839	TCA	2	6	31297	31302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014839	AATAA	2	10	31345	31354	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014839	TAAA	2	8	31411	31418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014839	TAA	2	6	31433	31438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014839	A	6	6	31897	31902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014839	GAA	2	6	31915	31920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014839	A	6	6	31945	31950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014839	TCT	2	6	32762	32767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014839	TGT	2	6	32822	32827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014839	AAGA	2	8	32850	32857	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014839	TTG	2	6	33797	33802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014839	TGT	2	6	33811	33816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014839	T	6	6	33846	33851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014839	ATT	2	6	33869	33874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014839	A	6	6	33988	33993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014839	ATT	2	6	34034	34039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014839	TCA	2	6	34050	34055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014839	AATT	2	8	34069	34076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014839	GTT	2	6	34118	34123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014839	TGC	2	6	34140	34145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014839	GTT	2	6	34181	34186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014839	T	6	6	35189	35194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014839	CA	3	6	35208	35213	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_014839	CAA	2	6	35233	35238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014839	A	6	6	35305	35310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014839	A	6	6	35318	35323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014839	A	7	7	35431	35437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014839	CTTT	2	8	35474	35481	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014839	AAT	2	6	35506	35511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014839	CT	3	6	35519	35524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_014839	AACT	2	8	35593	35600	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014839	CTGC	2	8	37302	37309	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_014839	TTGAA	2	10	37330	37339	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014839	TCG	2	6	37341	37346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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153	NC_014839	CA	3	6	37587	37592	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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283	NC_014839	CTT	2	6	81952	81957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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288	NC_014839	ACT	2	6	82129	82134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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