MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag2

Total Repeats: 695

Go To Repeat Summary Page

< Previous 12Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014563	CT	3	6	101095	101100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
502	NC_014563	GCT	2	6	101101	101106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_014563	GTTAC	2	10	101174	101183	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
504	NC_014563	TTA	2	6	101187	101192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_014563	ATT	2	6	106731	106736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_014563	CCA	2	6	112039	112044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_014563	CTC	2	6	115745	115750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_014563	ACC	2	6	115781	115786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_014563	GCAG	2	8	115809	115816	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
510	NC_014563	CGC	2	6	115839	115844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_014563	CGG	2	6	115870	115875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_014563	T	6	6	115952	115957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_014563	GGC	2	6	115983	115988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_014563	CAG	2	6	116083	116088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_014563	GAA	2	6	116093	116098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_014563	GTT	2	6	117189	117194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_014563	CAC	2	6	117234	117239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_014563	AAC	2	6	118518	118523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_014563	TCCT	2	8	119416	119423	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
520	NC_014563	GCTG	2	8	119429	119436	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
521	NC_014563	GAA	2	6	121079	121084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_014563	AGA	2	6	122837	122842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_014563	GTT	2	6	125546	125551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_014563	A	7	7	125565	125571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_014563	TGC	2	6	125572	125577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_014563	CAG	2	6	125609	125614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_014563	GCA	3	9	125624	125632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_014563	CTC	2	6	126437	126442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_014563	GCC	2	6	126475	126480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_014563	CAG	2	6	126482	126487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_014563	AGCAG	2	10	126498	126507	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
532	NC_014563	CGG	2	6	126565	126570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_014563	GGAG	2	8	126657	126664	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
534	NC_014563	TTTCTA	2	12	126820	126831	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
535	NC_014563	TAG	2	6	127297	127302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_014563	CTT	2	6	127333	127338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_014563	ATCA	2	8	127346	127353	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
538	NC_014563	GCATAA	2	12	127410	127421	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
539	NC_014563	T	6	6	127429	127434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_014563	ATTT	2	8	127439	127446	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_014563	TATTT	2	10	127471	127480	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_014563	CT	3	6	127573	127578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_014563	AGGA	2	8	128747	128754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_014563	TCT	2	6	129865	129870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_014563	ACAA	2	8	129910	129917	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
546	NC_014563	A	7	7	129934	129940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_014563	GA	3	6	129969	129974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_014563	CTA	2	6	130639	130644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_014563	GCCA	2	8	130649	130656	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
550	NC_014563	CTGGT	2	10	130676	130685	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
551	NC_014563	TGC	2	6	130698	130703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_014563	GCC	2	6	131053	131058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_014563	GCT	2	6	131085	131090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_014563	GCA	2	6	131842	131847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_014563	CTT	2	6	131918	131923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_014563	GTG	2	6	131931	131936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_014563	GGC	2	6	132952	132957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_014563	CAC	2	6	132990	132995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_014563	GCA	2	6	133004	133009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_014563	AAC	2	6	133016	133021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_014563	T	6	6	133112	133117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_014563	GCC	2	6	133148	133153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_014563	AACA	2	8	133162	133169	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
564	NC_014563	AGA	2	6	133239	133244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_014563	ATT	2	6	133294	133299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_014563	TCTGC	2	10	133302	133311	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
567	NC_014563	GCAG	2	8	133313	133320	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
568	NC_014563	GCA	2	6	134323	134328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_014563	CAA	2	6	134338	134343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_014563	T	6	6	134360	134365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_014563	CGA	2	6	134412	134417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_014563	GA	3	6	134416	134421	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_014563	CGA	2	6	134451	134456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_014563	TTC	2	6	134523	134528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_014563	CCT	2	6	135129	135134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_014563	TGGAA	2	10	135624	135633	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
577	NC_014563	AATT	2	8	135644	135651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_014563	GCT	2	6	135674	135679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_014563	CCT	2	6	135714	135719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_014563	GTTCT	3	15	135775	135789	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
581	NC_014563	AAG	2	6	135794	135799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_014563	TG	3	6	135800	135805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
583	NC_014563	CTG	2	6	135831	135836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_014563	A	7	7	135864	135870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_014563	CAG	2	6	135873	135878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_014563	TAT	2	6	135927	135932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_014563	GAA	2	6	135954	135959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_014563	CAT	2	6	136116	136121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_014563	A	7	7	136122	136128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_014563	ATG	2	6	136143	136148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_014563	GCA	2	6	136162	136167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_014563	A	7	7	136167	136173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_014563	CCG	2	6	136177	136182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_014563	AGG	2	6	136187	136192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
595	NC_014563	TCG	2	6	136228	136233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_014563	CTG	2	6	136238	136243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_014563	T	6	6	136298	136303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_014563	ACA	2	6	136334	136339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_014563	TTATCT	2	12	136344	136355	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
600	NC_014563	AAT	2	6	136363	136368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_014563	TGG	2	6	136375	136380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_014563	CTC	2	6	136417	136422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_014563	ATAC	2	8	136423	136430	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
604	NC_014563	TCCA	2	8	136440	136447	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
605	NC_014563	AC	3	6	136451	136456	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
606	NC_014563	GTT	2	6	136457	136462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_014563	CAG	2	6	136502	136507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_014563	TCC	2	6	141018	141023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_014563	A	8	8	141027	141034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_014563	T	6	6	141692	141697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_014563	A	6	6	141717	141722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_014563	T	7	7	141767	141773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_014563	A	7	7	141778	141784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_014563	TTAT	2	8	141817	141824	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_014563	T	6	6	141871	141876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_014563	TATT	2	8	141881	141888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_014563	ATG	2	6	141907	141912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_014563	ATTA	2	8	141928	141935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_014563	GGA	2	6	141943	141948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_014563	TGC	2	6	142049	142054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_014563	GCA	2	6	142058	142063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_014563	A	7	7	142766	142772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_014563	GCA	2	6	142778	142783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_014563	CAT	2	6	142822	142827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_014563	CCG	2	6	142950	142955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_014563	ATC	2	6	143068	143073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_014563	ACA	2	6	143110	143115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_014563	A	7	7	143212	143218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_014563	TCC	2	6	144926	144931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_014563	TCGC	2	8	145122	145129	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
631	NC_014563	ATT	2	6	145144	145149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_014563	AGTC	2	8	145222	145229	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
633	NC_014563	TCA	2	6	145287	145292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_014563	GGC	2	6	145293	145298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_014563	TAT	3	9	145316	145324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_014563	TGCAT	2	10	145525	145534	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
637	NC_014563	TAAC	2	8	145536	145543	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
638	NC_014563	A	6	6	147470	147475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_014563	T	6	6	147540	147545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_014563	TAT	2	6	147553	147558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_014563	CTG	2	6	147578	147583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_014563	AAT	2	6	147641	147646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_014563	TTTA	2	8	147665	147672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_014563	GCA	2	6	147715	147720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
645	NC_014563	ATT	2	6	147854	147859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
646	NC_014563	GACA	2	8	147888	147895	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
647	NC_014563	CAT	2	6	148831	148836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
648	NC_014563	ATT	2	6	148861	148866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
649	NC_014563	TGTC	2	8	148992	148999	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
650	NC_014563	ATT	3	9	149069	149077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
651	NC_014563	C	6	6	149091	149096	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
652	NC_014563	TGT	2	6	149126	149131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
653	NC_014563	TTC	2	6	149149	149154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
654	NC_014563	TGA	2	6	149170	149175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
655	NC_014563	GA	3	6	149199	149204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
656	NC_014563	ACT	2	6	149718	149723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
657	NC_014563	GCG	3	9	149749	149757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
658	NC_014563	CAGT	2	8	149831	149838	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
659	NC_014563	GCC	2	6	149865	149870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
660	NC_014563	TTCGG	2	10	149953	149962	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
661	NC_014563	GTCA	2	8	150327	150334	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
662	NC_014563	CAGC	2	8	150548	150555	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
663	NC_014563	AT	3	6	150659	150664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
664	NC_014563	GCG	2	6	150693	150698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
665	NC_014563	AGC	2	6	150743	150748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
666	NC_014563	ATT	2	6	150794	150799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
667	NC_014563	T	6	6	150814	150819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
668	NC_014563	GGC	2	6	150859	150864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
669	NC_014563	GA	3	6	150899	150904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
670	NC_014563	TCAT	2	8	152850	152857	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
671	NC_014563	TGT	2	6	152876	152881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
672	NC_014563	AAT	2	6	152936	152941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
673	NC_014563	AAT	2	6	155940	155945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
674	NC_014563	GTC	2	6	156890	156895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
675	NC_014563	A	7	7	157109	157115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
676	NC_014563	ATT	2	6	160180	160185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
677	NC_014563	TATTT	2	10	160209	160218	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
678	NC_014563	A	6	6	161410	161415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
679	NC_014563	TCA	2	6	161431	161436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
680	NC_014563	ACT	2	6	161470	161475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
681	NC_014563	CAA	2	6	161531	161536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
682	NC_014563	A	7	7	161547	161553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
683	NC_014563	TGAT	2	8	161565	161572	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
684	NC_014563	A	7	7	161581	161587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
685	NC_014563	AAAT	2	8	161624	161631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
686	NC_014563	TAA	2	6	161672	161677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
687	NC_014563	CAT	2	6	162473	162478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
688	NC_014563	T	7	7	162478	162484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
689	NC_014563	CCT	2	6	162535	162540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
690	NC_014563	TCAG	2	8	162549	162556	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
691	NC_014563	T	6	6	162561	162566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
692	NC_014563	TTGT	2	8	162861	162868	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
693	NC_014563	GCA	2	6	162892	162897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
694	NC_014563	CTGG	2	8	162904	162911	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
695	NC_014563	CCGG	2	8	164230	164237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

< Previous 12Next >