MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag3

Total Repeats: 1706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014258	AAC	2	6	33	38	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014258	TAT	2	6	47	52	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014258	TCA	2	6	60	65	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014258	CCG	2	6	2715	2720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_014258	TGG	2	6	3134	3139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014258	GAC	2	6	3174	3179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014258	GC	3	6	3180	3185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014258	AAT	2	6	4021	4026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014258	TAACA	2	10	4034	4043	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014258	TAA	2	6	4045	4050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014258	GAA	2	6	4103	4108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014258	T	6	6	5030	5035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014258	CTT	2	6	6109	6114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014258	TC	3	6	6124	6129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014258	ATG	2	6	6190	6195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014258	TCA	2	6	6201	6206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014258	TAA	2	6	12047	12052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014258	AAACAA	2	12	12340	12351	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014258	GTT	2	6	12353	12358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014258	ATA	2	6	12365	12370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014258	ATTTA	2	10	12379	12388	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014258	TCA	2	6	12404	12409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014258	GTCAG	2	10	16337	16346	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014258	TAATCA	2	12	17380	17391	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014258	TGA	2	6	17422	17427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014258	CTT	2	6	17452	17457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014258	AAT	2	6	17491	17496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014258	T	7	7	18122	18128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014258	TTA	2	6	18154	18159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014258	GCG	2	6	19093	19098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014258	ATT	2	6	19100	19105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014258	ATT	2	6	19109	19114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014258	GCT	2	6	19123	19128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014258	AATA	2	8	19146	19153	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014258	ATT	2	6	19168	19173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014258	GT	3	6	19185	19190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014258	AATA	2	8	19222	19229	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014258	CAC	2	6	19236	19241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_014258	CTG	2	6	21371	21376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014258	T	7	7	23656	23662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014258	TACC	2	8	24429	24436	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014258	GGC	2	6	24459	24464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014258	T	6	6	24467	24472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014258	TAT	2	6	25825	25830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014258	CGC	2	6	25868	25873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_014258	AATC	2	8	25882	25889	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014258	CGC	2	6	25897	25902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_014258	GAA	2	6	26369	26374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014258	AAT	2	6	26375	26380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014258	TTC	2	6	26401	26406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014258	TG	3	6	27047	27052	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014258	TCA	2	6	28320	28325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014258	TTA	2	6	28352	28357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014258	GTT	2	6	32243	32248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014258	TAA	2	6	32258	32263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014258	AGC	2	6	32282	32287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014258	ATC	2	6	32291	32296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014258	AAT	2	6	32313	32318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014258	ATT	2	6	33260	33265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014258	AATA	2	8	33272	33279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014258	ATTT	2	8	33292	33299	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014258	CCAG	2	8	33334	33341	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014258	CGTA	2	8	33759	33766	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014258	ACGCG	2	10	34977	34986	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_014258	CTGA	2	8	34999	35006	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014258	AAT	2	6	35072	35077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014258	TAA	2	6	35088	35093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014258	TGA	2	6	35127	35132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014258	AAC	2	6	35180	35185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014258	AATA	2	8	35739	35746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014258	T	6	6	37207	37212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014258	GC	3	6	37227	37232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014258	GGA	2	6	37241	37246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014258	GAG	2	6	38028	38033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014258	AAT	2	6	38045	38050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014258	ATC	2	6	38076	38081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014258	CTG	2	6	38163	38168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014258	GA	3	6	38180	38185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014258	TAAG	2	8	38212	38219	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014258	CA	3	6	38222	38227	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014258	ATG	2	6	41915	41920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014258	TTC	2	6	41934	41939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014258	AAT	2	6	42164	42169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014258	GAT	2	6	42196	42201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014258	TGA	2	6	43660	43665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014258	GCC	2	6	43750	43755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_014258	GC	3	6	43767	43772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014258	GTT	2	6	43803	43808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014258	CAG	2	6	44583	44588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014258	AACG	2	8	45092	45099	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014258	AGC	2	6	45102	45107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014258	GCCA	2	8	45182	45189	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014258	TCC	2	6	45198	45203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_014258	CATG	2	8	45254	45261	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014258	TGG	2	6	45346	45351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014258	CCTA	2	8	45414	45421	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014258	ACA	2	6	45463	45468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014258	GCTGA	2	10	45480	45489	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_014258	AGG	2	6	45510	45515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014258	GGT	2	6	45599	45604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014258	GGCG	2	8	45665	45672	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014258	TAA	2	6	45688	45693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014258	TTTC	2	8	45755	45762	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014258	CGG	2	6	46438	46443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014258	TTA	2	6	46445	46450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014258	AAG	2	6	46495	46500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014258	GCC	2	6	46704	46709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_014258	TAA	2	6	46712	46717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014258	TGC	2	6	46781	46786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014258	CAGC	2	8	46927	46934	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014258	AAT	2	6	46969	46974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014258	CCCT	2	8	47004	47011	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
113	NC_014258	CTT	2	6	47104	47109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014258	GA	3	6	47117	47122	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014258	GAA	2	6	47254	47259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014258	TAA	2	6	47273	47278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014258	CAG	2	6	47393	47398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014258	CTG	2	6	47407	47412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014258	GACAT	2	10	47426	47435	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014258	ATG	2	6	47488	47493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014258	GC	3	6	47514	47519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014258	CTG	2	6	47540	47545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014258	TGC	2	6	47551	47556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014258	TCAGC	2	10	47565	47574	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_014258	GT	3	6	47592	47597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014258	T	6	6	47597	47602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014258	GTAA	2	8	47604	47611	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014258	ATGC	2	8	47658	47665	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_014258	TGA	2	6	47669	47674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014258	ATAAC	2	10	47735	47744	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_014258	GA	3	6	47828	47833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014258	TGC	2	6	47847	47852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014258	ATC	2	6	47935	47940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014258	TG	3	6	48501	48506	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014258	GTTAA	2	10	48539	48548	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014258	TAG	2	6	48555	48560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014258	TCATT	2	10	48580	48589	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_014258	GCA	2	6	48660	48665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014258	GAC	2	6	48731	48736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_014258	TGA	2	6	48794	48799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014258	ACAT	2	8	48828	48835	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014258	TAG	2	6	48844	48849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014258	T	6	6	48950	48955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014258	TCT	2	6	49054	49059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_014258	CT	3	6	49107	49112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_014258	AAT	2	6	49248	49253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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433	NC_014258	A	7	7	98582	98588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_014258	ATC	2	6	98623	98628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
435	NC_014258	ACA	2	6	98705	98710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
436	NC_014258	CT	3	6	98739	98744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
437	NC_014258	GA	4	8	98774	98781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
438	NC_014258	TGC	2	6	99895	99900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
439	NC_014258	AGA	2	6	100845	100850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
440	NC_014258	CT	3	6	102159	102164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
441	NC_014258	TAG	2	6	102173	102178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
442	NC_014258	CTG	2	6	102179	102184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_014258	GGCT	2	8	102201	102208	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
444	NC_014258	CGCC	2	8	102231	102238	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
445	NC_014258	GCCC	2	8	102305	102312	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
446	NC_014258	CAGC	2	8	102333	102340	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
447	NC_014258	TTG	2	6	103360	103365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
448	NC_014258	GAT	2	6	103390	103395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_014258	GCT	2	6	105300	105305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
451	NC_014258	TAAT	2	8	105384	105391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_014258	CAG	2	6	105465	105470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
453	NC_014258	ATT	2	6	105471	105476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_014258	TGT	2	6	105492	105497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
455	NC_014258	TAA	2	6	105511	105516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_014258	ATT	2	6	105532	105537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_014258	CCA	2	6	105553	105558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
458	NC_014258	A	6	6	105566	105571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_014258	CTG	2	6	105581	105586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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461	NC_014258	CCG	2	6	106153	106158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
462	NC_014258	ATTC	2	8	106203	106210	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
463	NC_014258	ATA	2	6	106219	106224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_014258	CGC	2	6	106246	106251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
465	NC_014258	TAT	2	6	106337	106342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_014258	TGGCA	2	10	106348	106357	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
467	NC_014258	TTA	2	6	107627	107632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_014258	CAG	2	6	107666	107671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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470	NC_014258	TGG	2	6	108861	108866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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492	NC_014258	CAGAT	2	10	119891	119900	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
493	NC_014258	A	6	6	119904	119909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
494	NC_014258	GCC	2	6	119910	119915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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