MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pectobacterium wasabiae WPP163 chromosome

Total Repeats: 17184

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_013421	AAC	2	6	4981659	4981664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17002	NC_013421	CAC	2	6	4981672	4981677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17003	NC_013421	TCA	2	6	4981678	4981683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17004	NC_013421	AAT	2	6	4981689	4981694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17005	NC_013421	GAG	2	6	4981697	4981702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17006	NC_013421	TAT	2	6	4983646	4983651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17007	NC_013421	T	6	6	4984308	4984313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17008	NC_013421	A	7	7	4984317	4984323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17009	NC_013421	CAT	2	6	4984371	4984376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17010	NC_013421	T	6	6	4984416	4984421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17011	NC_013421	AAT	2	6	4984449	4984454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17012	NC_013421	GA	3	6	4984458	4984463	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17013	NC_013421	AAAT	2	8	4984464	4984471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17014	NC_013421	A	8	8	4984512	4984519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17015	NC_013421	AAT	2	6	4984526	4984531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17016	NC_013421	ATAG	2	8	4984536	4984543	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17017	NC_013421	TTGT	2	8	4984552	4984559	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17018	NC_013421	T	6	6	4984564	4984569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17019	NC_013421	GAAT	2	8	4984570	4984577	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17020	NC_013421	TTAAA	2	10	4984598	4984607	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17021	NC_013421	T	7	7	4984616	4984622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17022	NC_013421	A	10	10	4984632	4984641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17023	NC_013421	G	6	6	4984732	4984737	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17024	NC_013421	AGAA	2	8	4984761	4984768	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17025	NC_013421	AAT	2	6	4984774	4984779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17026	NC_013421	T	6	6	4984840	4984845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17029	NC_013421	GA	3	6	4984911	4984916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17030	NC_013421	CAA	2	6	4986141	4986146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17031	NC_013421	AAAC	2	8	4986163	4986170	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17032	NC_013421	CTG	2	6	4986434	4986439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17033	NC_013421	CTG	2	6	4989069	4989074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17034	NC_013421	GAG	2	6	4989096	4989101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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17037	NC_013421	CAGT	2	8	4991869	4991876	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17038	NC_013421	ACTG	2	8	4991881	4991888	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17039	NC_013421	T	6	6	4991892	4991897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17040	NC_013421	CAC	2	6	4991931	4991936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17041	NC_013421	GCG	2	6	4992025	4992030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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17044	NC_013421	GCC	2	6	4994133	4994138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17045	NC_013421	CCT	2	6	4994174	4994179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17046	NC_013421	TGC	2	6	4995921	4995926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17047	NC_013421	TA	3	6	4995940	4995945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17048	NC_013421	T	8	8	4996011	4996018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17049	NC_013421	T	6	6	4996022	4996027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17050	NC_013421	ATT	2	6	4996070	4996075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17051	NC_013421	GCAG	2	8	4996133	4996140	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17052	NC_013421	TATTGT	2	12	4996192	4996203	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17053	NC_013421	TTTTA	2	10	4996219	4996228	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17054	NC_013421	TACA	2	8	4996274	4996281	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17055	NC_013421	ATG	2	6	4996329	4996334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17056	NC_013421	TAA	2	6	4998797	4998802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17057	NC_013421	GGC	2	6	5001324	5001329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17058	NC_013421	TA	5	10	5002719	5002728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17059	NC_013421	TA	3	6	5002735	5002740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17060	NC_013421	AGC	2	6	5002751	5002756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17061	NC_013421	CTG	2	6	5004147	5004152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17062	NC_013421	GAC	2	6	5004203	5004208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17063	NC_013421	GAA	2	6	5004364	5004369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17064	NC_013421	ACT	2	6	5004427	5004432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17068	NC_013421	TG	4	8	5006761	5006768	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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17074	NC_013421	CAAAA	2	10	5008447	5008456	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17075	NC_013421	ATA	2	6	5008458	5008463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17079	NC_013421	TTA	2	6	5010485	5010490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17081	NC_013421	T	8	8	5010546	5010553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17082	NC_013421	T	6	6	5010626	5010631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17083	NC_013421	T	6	6	5011091	5011096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17084	NC_013421	GTT	2	6	5011097	5011102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17087	NC_013421	TAT	2	6	5023866	5023871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17089	NC_013421	T	7	7	5025922	5025928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17092	NC_013421	T	6	6	5027205	5027210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17093	NC_013421	T	9	9	5027237	5027245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17094	NC_013421	GTT	2	6	5027276	5027281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17096	NC_013421	A	6	6	5027394	5027399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17097	NC_013421	TTGT	2	8	5027426	5027433	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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17099	NC_013421	TCC	2	6	5027496	5027501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17100	NC_013421	AGG	2	6	5027572	5027577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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17102	NC_013421	CGT	2	6	5028703	5028708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17103	NC_013421	CT	3	6	5028732	5028737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17104	NC_013421	AG	3	6	5028774	5028779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17105	NC_013421	AG	3	6	5030719	5030724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17106	NC_013421	TTATA	2	10	5034183	5034192	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17108	NC_013421	TAA	2	6	5034249	5034254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17109	NC_013421	TTTA	2	8	5035159	5035166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17110	NC_013421	TCAC	2	8	5035206	5035213	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17111	NC_013421	TTCC	2	8	5035246	5035253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17112	NC_013421	GCC	2	6	5035257	5035262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17113	NC_013421	ATT	2	6	5035277	5035282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17114	NC_013421	TA	3	6	5035288	5035293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17115	NC_013421	TTAT	2	8	5035294	5035301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17116	NC_013421	AG	3	6	5035307	5035312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17117	NC_013421	TGA	2	6	5037536	5037541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17118	NC_013421	TTC	2	6	5037737	5037742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17119	NC_013421	A	8	8	5037753	5037760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17120	NC_013421	CGA	2	6	5037804	5037809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17121	NC_013421	CTT	2	6	5037820	5037825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17122	NC_013421	CAGC	2	8	5039210	5039217	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17123	NC_013421	CGTGAT	2	12	5039985	5039996	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17124	NC_013421	CT	3	6	5040135	5040140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17125	NC_013421	TTA	2	6	5042807	5042812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17126	NC_013421	T	6	6	5042885	5042890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17127	NC_013421	GGAATA	2	12	5043793	5043804	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17128	NC_013421	CAT	2	6	5044866	5044871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17129	NC_013421	CGTT	2	8	5044878	5044885	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.