MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pedobacter heparinus DSM 2366 chromosome

Total Repeats: 8714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013061	ATT	2	6	1264	1269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013061	TTTTA	2	10	3109	3118	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013061	A	6	6	3127	3132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013061	A	7	7	3152	3158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013061	TAT	2	6	3159	3164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013061	TAA	2	6	3186	3191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013061	ATA	2	6	3192	3197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013061	ATT	2	6	3392	3397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013061	T	6	6	3439	3444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013061	TAA	2	6	4318	4323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013061	A	6	6	4370	4375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013061	CTG	3	9	8186	8194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013061	ATTA	2	8	10150	10157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013061	TTAAA	2	10	10159	10168	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013061	CAA	2	6	10194	10199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013061	TAAA	2	8	10239	10246	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013061	AAT	2	6	12137	12142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013061	T	8	8	12204	12211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013061	A	6	6	12225	12230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013061	TA	3	6	12232	12237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013061	TGT	2	6	15996	16001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013061	AT	3	6	16008	16013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013061	TCT	2	6	16029	16034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013061	AAC	2	6	16092	16097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013061	TAAA	2	8	16124	16131	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013061	TATT	2	8	16192	16199	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013061	AGC	2	6	16204	16209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013061	T	7	7	16228	16234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013061	A	7	7	16268	16274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013061	ATT	2	6	16344	16349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013061	TAA	2	6	16404	16409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013061	ATTAA	2	10	16429	16438	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013061	CAG	2	6	17512	17517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013061	AGA	2	6	17573	17578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013061	ATA	2	6	19967	19972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013061	TGC	2	6	20015	20020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013061	TAC	2	6	20029	20034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013061	GTT	2	6	20068	20073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013061	T	6	6	20088	20093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013061	A	6	6	20139	20144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013061	TAA	2	6	21255	21260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013061	AATT	2	8	24096	24103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013061	ATA	2	6	24133	24138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013061	TA	3	6	24144	24149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013061	TAAAAT	2	12	27825	27836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013061	AGG	2	6	28222	28227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013061	TCG	2	6	28600	28605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013061	AGA	2	6	30474	30479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013061	T	8	8	30501	30508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013061	AATAA	2	10	33149	33158	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013061	ATT	2	6	38572	38577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013061	T	6	6	38576	38581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013061	AAT	2	6	38619	38624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013061	TACT	2	8	38685	38692	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013061	TGC	2	6	39381	39386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013061	TTCAT	2	10	39401	39410	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_013061	TTC	2	6	39413	39418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013061	TAAA	2	8	40765	40772	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013061	T	6	6	40777	40782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013061	ATT	2	6	40794	40799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013061	T	6	6	40798	40803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013061	A	7	7	40819	40825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013061	T	8	8	40841	40848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013061	A	6	6	40852	40857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013061	AATT	2	8	41204	41211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013061	TTA	2	6	41212	41217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013061	A	7	7	41545	41551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013061	A	6	6	41553	41558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013061	ATA	2	6	41575	41580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013061	ACA	2	6	41607	41612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013061	A	6	6	41612	41617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013061	A	7	7	41996	42002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013061	T	7	7	42034	42040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013061	AACT	2	8	42060	42067	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_013061	TAT	2	6	42068	42073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013061	A	6	6	44438	44443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013061	T	6	6	44463	44468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013061	A	9	9	45182	45190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013061	ATT	2	6	47918	47923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013061	AATT	2	8	47985	47992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013061	A	7	7	49129	49135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013061	TAA	2	6	49153	49158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013061	AT	3	6	51938	51943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013061	ACA	2	6	51978	51983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013061	GAA	2	6	53952	53957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013061	GTT	2	6	54469	54474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013061	A	8	8	54550	54557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013061	GCT	2	6	54563	54568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013061	AAG	2	6	54597	54602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013061	TTG	2	6	54629	54634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013061	TAA	2	6	54644	54649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013061	A	6	6	54685	54690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013061	TCGT	2	8	61664	61671	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_013061	AGTTT	2	10	65237	65246	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013061	A	6	6	66317	66322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013061	ATTT	2	8	66339	66346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013061	A	7	7	66348	66354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013061	AAT	2	6	67089	67094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013061	A	6	6	67108	67113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013061	TA	3	6	67782	67787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013061	A	7	7	67838	67844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013061	ATT	2	6	70359	70364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013061	A	7	7	72161	72167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013061	ACT	2	6	72181	72186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013061	TGG	2	6	72212	72217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013061	ATT	2	6	72232	72237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013061	GGA	2	6	73641	73646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013061	AAT	2	6	73658	73663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013061	A	8	8	74714	74721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013061	TAA	2	6	75828	75833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013061	ATA	2	6	78508	78513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013061	ACC	2	6	78566	78571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_013061	GTTAAA	2	12	82913	82924	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013061	CAA	2	6	82926	82931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013061	AAT	2	6	82959	82964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013061	TAT	2	6	82968	82973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013061	TAA	2	6	83014	83019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013061	GAT	2	6	83028	83033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013061	TGT	2	6	83057	83062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013061	CA	3	6	85565	85570	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013061	AC	3	6	85575	85580	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_013061	TTC	2	6	85582	85587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013061	GAA	2	6	85641	85646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013061	CTTT	2	8	85650	85657	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_013061	GAA	2	6	85660	85665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013061	AT	3	6	85677	85682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013061	AGCA	2	8	85694	85701	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_013061	TTG	2	6	85729	85734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013061	A	7	7	85755	85761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013061	T	6	6	85803	85808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013061	T	6	6	85824	85829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013061	ATA	2	6	85835	85840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013061	T	6	6	85855	85860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013061	TGT	2	6	85869	85874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013061	AT	3	6	85900	85905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013061	ATT	2	6	85961	85966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013061	T	6	6	85979	85984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013061	TAA	2	6	90594	90599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013061	A	6	6	90612	90617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013061	T	6	6	90651	90656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013061	ATA	2	6	91602	91607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013061	CA	3	6	93732	93737	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_013061	T	7	7	95653	95659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013061	ATAGA	2	10	95746	95755	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013061	AT	3	6	95845	95850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013061	CTG	2	6	95856	95861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_013061	A	7	7	95897	95903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013061	ACT	2	6	95937	95942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_013061	TAA	2	6	96041	96046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013061	AGA	2	6	96060	96065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013061	TCT	2	6	96125	96130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_013061	TTAT	2	8	96131	96138	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013061	AAAG	2	8	96275	96282	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013061	CAA	2	6	96291	96296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_013061	CTTT	2	8	96417	96424	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_013061	CAA	2	6	96441	96446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_013061	CCT	2	6	98192	98197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_013061	TTTA	2	8	98198	98205	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_013061	CTTT	2	8	98212	98219	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
160	NC_013061	ATT	2	6	98270	98275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_013061	ATT	2	6	98280	98285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_013061	TAT	2	6	99751	99756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_013061	AT	3	6	102481	102486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_013061	AAT	2	6	102517	102522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_013061	TCT	2	6	102527	102532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_013061	TA	3	6	102556	102561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_013061	A	6	6	105832	105837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_013061	A	8	8	107416	107423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_013061	ATA	2	6	107444	107449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_013061	TGA	2	6	113611	113616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
175	NC_013061	A	6	6	114055	114060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_013061	ACC	2	6	114270	114275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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187	NC_013061	TAA	2	6	114597	114602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_013061	ATA	2	6	115840	115845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_013061	A	6	6	131610	131615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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274	NC_013061	T	7	7	169307	169313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_013061	T	7	7	170517	170523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_013061	AT	3	6	170546	170551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_013061	ATT	2	6	171572	171577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_013061	A	6	6	182929	182934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_013061	T	6	6	182937	182942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_013061	TTAT	3	12	182987	182998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_013061	A	7	7	183070	183076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_013061	A	6	6	183104	183109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_013061	TAAA	2	8	184462	184469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_013061	T	8	8	184506	184513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_013061	A	6	6	184680	184685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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430	NC_013061	ATC	3	9	295191	295199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
431	NC_013061	A	7	7	295285	295291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_013061	GTT	2	6	300837	300842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
433	NC_013061	ATT	2	6	300843	300848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_013061	TTTA	3	12	304479	304490	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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436	NC_013061	CTG	2	6	305587	305592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
437	NC_013061	TGT	2	6	305614	305619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
438	NC_013061	AAGGCA	2	12	305624	305635	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
439	NC_013061	TAA	2	6	306619	306624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_013061	GGT	2	6	307990	307995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_013061	T	6	6	310324	310329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_013061	T	7	7	311531	311537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_013061	ATT	2	6	311612	311617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_013061	T	6	6	312143	312148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_013061	CACT	2	8	312324	312331	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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456	NC_013061	GCT	2	6	312407	312412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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460	NC_013061	GAA	2	6	313900	313905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
461	NC_013061	AATAAA	2	12	313910	313921	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_013061	T	6	6	313954	313959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_013061	CCTG	2	8	313968	313975	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
464	NC_013061	GCT	2	6	314045	314050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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466	NC_013061	CTA	2	6	315006	315011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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475	NC_013061	T	7	7	326755	326761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_013061	T	8	8	329625	329632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_013061	A	6	6	329633	329638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_013061	TTA	2	6	329651	329656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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492	NC_013061	T	6	6	335856	335861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
493	NC_013061	A	6	6	335862	335867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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