MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Photorhabdus asymbiotica plasmid pPAU1

Total Repeats: 144

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012961	TAG	2	6	1094	1099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012961	TGC	2	6	1180	1185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012961	ATT	2	6	1198	1203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012961	T	6	6	1272	1277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012961	A	6	6	1297	1302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012961	CTG	2	6	1348	1353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012961	TTA	2	6	1371	1376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012961	ATTT	2	8	1407	1414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012961	T	6	6	1427	1432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012961	A	6	6	1433	1438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012961	AAT	2	6	1458	1463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012961	ATT	2	6	1488	1493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012961	ATAA	2	8	1494	1501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012961	ATT	2	6	1511	1516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012961	TAT	2	6	1545	1550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012961	TTTA	2	8	1576	1583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012961	TA	3	6	1586	1591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012961	TTAA	2	8	1607	1614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012961	TTG	2	6	1619	1624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012961	TCT	2	6	1663	1668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012961	TG	3	6	1704	1709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012961	A	7	7	1728	1734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012961	ATG	2	6	1784	1789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012961	AAC	2	6	1863	1868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012961	TTG	2	6	1876	1881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012961	TAA	2	6	1959	1964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012961	AGTA	2	8	2032	2039	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012961	ATT	2	6	2127	2132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012961	T	7	7	2131	2137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012961	TA	3	6	2165	2170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012961	TAAT	2	8	2188	2195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012961	TTAA	2	8	2199	2206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012961	T	6	6	2218	2223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012961	AAC	2	6	2225	2230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012961	A	7	7	2242	2248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012961	TGCT	2	8	3817	3824	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_012961	AAT	2	6	3903	3908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012961	A	7	7	3948	3954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012961	TGA	2	6	3971	3976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012961	TAC	2	6	3987	3992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_012961	ATG	2	6	4030	4035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012961	TA	3	6	4708	4713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012961	TA	3	6	4716	4721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012961	ATA	2	6	6029	6034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012961	TGTA	2	8	6039	6046	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012961	ATA	2	6	6062	6067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012961	TAAT	2	8	6068	6075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012961	AATA	2	8	6125	6132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012961	AGA	2	6	6145	6150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012961	ATTT	2	8	6177	6184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012961	TC	3	6	6210	6215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012961	TCA	2	6	6231	6236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012961	ATT	2	6	6243	6248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012961	TGA	2	6	6249	6254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012961	TTG	2	6	7320	7325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012961	TCA	2	6	7352	7357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012961	TAAA	2	8	7385	7392	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012961	A	6	6	7404	7409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012961	ATG	2	6	7434	7439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012961	TCT	2	6	8411	8416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012961	TAT	2	6	8469	8474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012961	ATC	2	6	8537	8542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012961	GAC	2	6	8558	8563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012961	CAGT	2	8	8650	8657	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_012961	CAA	2	6	8684	8689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012961	TCA	2	6	8719	8724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012961	TGAT	2	8	8741	8748	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012961	TTA	2	6	9757	9762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012961	CT	3	6	10474	10479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_012961	GGC	2	6	10514	10519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_012961	ACC	2	6	10529	10534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_012961	GCG	2	6	11550	11555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012961	CTT	2	6	11556	11561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012961	CT	3	6	11579	11584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_012961	TTAC	2	8	11980	11987	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_012961	T	6	6	12027	12032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012961	TGA	2	6	12075	12080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012961	A	7	7	12083	12089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012961	TCT	2	6	13564	13569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012961	TA	3	6	13654	13659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012961	GAG	2	6	13801	13806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012961	AAATC	2	10	13826	13835	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_012961	A	6	6	13910	13915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012961	T	6	6	14025	14030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012961	ATT	2	6	18343	18348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012961	ACG	2	6	18371	18376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_012961	TTA	2	6	18379	18384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012961	TTC	2	6	20517	20522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_012961	TCC	2	6	20896	20901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_012961	CAA	2	6	25758	25763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_012961	TCG	2	6	25814	25819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_012961	AAT	2	6	26191	26196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012961	TTA	2	6	26208	26213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012961	CTTA	2	8	26774	26781	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_012961	AAC	2	6	26791	26796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012961	TA	3	6	26809	26814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012961	CTC	2	6	26875	26880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_012961	TAA	2	6	26980	26985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012961	TTA	2	6	26991	26996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012961	CAA	2	6	27042	27047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_012961	TGCT	2	8	27084	27091	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_012961	AATT	2	8	27102	27109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012961	T	8	8	27115	27122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012961	TAAG	2	8	27475	27482	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012961	TTA	2	6	27488	27493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012961	AGT	2	6	27510	27515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012961	AT	3	6	27539	27544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012961	ATA	2	6	27562	27567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012961	TTA	2	6	27602	27607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012961	ACA	2	6	27690	27695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012961	ACTT	2	8	27767	27774	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_012961	TGA	2	6	27822	27827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012961	AGT	2	6	27855	27860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012961	TTTTG	2	10	27943	27952	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012961	ATT	2	6	27986	27991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012961	TC	3	6	28031	28036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_012961	TAGGT	2	10	28074	28083	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012961	AGGTT	2	10	28084	28093	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012961	CGA	2	6	28143	28148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012961	T	7	7	28399	28405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012961	TAG	2	6	28453	28458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012961	AAG	2	6	28473	28478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012961	CCA	2	6	28498	28503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_012961	ACC	2	6	28535	28540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_012961	GTT	3	9	28593	28601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012961	ATT	2	6	28636	28641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012961	GTT	2	6	28642	28647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012961	CTG	2	6	28676	28681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012961	TGA	2	6	28720	28725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012961	T	8	8	28753	28760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012961	A	7	7	28765	28771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012961	AT	3	6	28773	28778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012961	A	6	6	28788	28793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012961	ATA	2	6	28880	28885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012961	TTA	2	6	28891	28896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012961	GTT	2	6	28928	28933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012961	TGCAA	2	10	28946	28955	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_012961	TTGG	2	8	28957	28964	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012961	AAT	2	6	29016	29021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012961	AG	3	6	29106	29111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012961	GAAAA	2	10	29149	29158	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012961	ATTT	2	8	29228	29235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012961	GTGA	2	8	29278	29285	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012961	GTT	2	6	29290	29295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.