MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 18628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012914	ACACCA	2	12	1022565	1022576	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_012914	CA	3	6	1022608	1022613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3003	NC_012914	AGG	2	6	1022634	1022639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_012914	TTA	2	6	1027282	1027287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_012914	AGC	2	6	1028961	1028966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_012914	TAA	2	6	1028968	1028973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_012914	GAG	2	6	1028990	1028995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_012914	CTT	2	6	1030586	1030591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_012914	TCGCT	2	10	1030608	1030617	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3010	NC_012914	GCA	2	6	1031940	1031945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_012914	T	7	7	1031984	1031990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_012914	ATC	2	6	1032126	1032131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_012914	TTGG	2	8	1032135	1032142	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_012914	GCT	2	6	1032176	1032181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_012914	TCC	2	6	1032189	1032194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_012914	ATT	2	6	1032221	1032226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_012914	GAT	2	6	1032263	1032268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_012914	AGG	2	6	1032332	1032337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_012914	GTA	2	6	1033198	1033203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_012914	T	7	7	1033208	1033214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_012914	CTA	2	6	1033230	1033235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_012914	AC	3	6	1034338	1034343	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3023	NC_012914	A	6	6	1034370	1034375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_012914	T	8	8	1034420	1034427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_012914	ATG	2	6	1034516	1034521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_012914	TGAA	2	8	1036208	1036215	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_012914	T	6	6	1036236	1036241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_012914	TAGT	2	8	1036305	1036312	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_012914	TTA	2	6	1036378	1036383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_012914	CCG	2	6	1036415	1036420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3031	NC_012914	TAGT	2	8	1036471	1036478	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_012914	TTA	2	6	1036545	1036550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_012914	CCG	2	6	1036582	1036587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_012914	GCT	2	6	1036597	1036602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_012914	TAGT	2	8	1036638	1036645	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_012914	ATT	2	6	1036875	1036880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_012914	AG	3	6	1036886	1036891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_012914	GTA	2	6	1036927	1036932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_012914	A	9	9	1037673	1037681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_012914	ATG	2	6	1037736	1037741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_012914	TA	3	6	1037744	1037749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_012914	CAT	2	6	1037754	1037759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_012914	AG	3	6	1037793	1037798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_012914	CCG	2	6	1037818	1037823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3045	NC_012914	CAG	2	6	1037841	1037846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_012914	T	7	7	1038444	1038450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_012914	TCCG	2	8	1038480	1038487	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3048	NC_012914	TA	3	6	1038605	1038610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_012914	AAT	2	6	1038611	1038616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_012914	GCT	2	6	1038635	1038640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_012914	A	6	6	1038677	1038682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_012914	A	6	6	1038689	1038694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_012914	GAG	2	6	1038757	1038762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_012914	GAT	2	6	1038765	1038770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_012914	T	6	6	1039848	1039853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_012914	GAAA	2	8	1039854	1039861	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_012914	TGG	2	6	1039862	1039867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_012914	TGCT	2	8	1040826	1040833	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3059	NC_012914	ATA	2	6	1040877	1040882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_012914	ATG	2	6	1040902	1040907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_012914	GGC	2	6	1040959	1040964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_012914	TAA	2	6	1046856	1046861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_012914	AG	3	6	1053844	1053849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_012914	CT	3	6	1053865	1053870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3065	NC_012914	T	6	6	1053870	1053875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_012914	AAT	2	6	1053926	1053931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_012914	AGG	2	6	1053957	1053962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_012914	AAT	2	6	1055347	1055352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_012914	TAAAA	2	10	1057620	1057629	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_012914	TCT	3	9	1057655	1057663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_012914	TCC	2	6	1059342	1059347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3072	NC_012914	TC	3	6	1061084	1061089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_012914	AAT	2	6	1062562	1062567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_012914	A	7	7	1062583	1062589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_012914	CTT	2	6	1062615	1062620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_012914	GAA	2	6	1062646	1062651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_012914	A	6	6	1062661	1062666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_012914	GA	3	6	1066115	1066120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_012914	CTTT	2	8	1068181	1068188	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3080	NC_012914	A	7	7	1069744	1069750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_012914	A	6	6	1069771	1069776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_012914	GAACG	2	10	1069809	1069818	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3083	NC_012914	T	6	6	1069853	1069858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_012914	GAAA	2	8	1069908	1069915	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_012914	CTTC	2	8	1069942	1069949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3086	NC_012914	TAG	2	6	1069962	1069967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_012914	TTGG	2	8	1069970	1069977	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_012914	ATT	2	6	1071104	1071109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_012914	TG	3	6	1071615	1071620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_012914	A	6	6	1075206	1075211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_012914	AATAAA	2	12	1075270	1075281	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_012914	GAAG	2	8	1075306	1075313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_012914	ATTTT	2	10	1075358	1075367	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_012914	TAA	2	6	1075371	1075376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_012914	TGG	2	6	1075377	1075382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_012914	AGG	2	6	1075418	1075423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_012914	AAC	2	6	1076291	1076296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_012914	AGG	2	6	1076310	1076315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_012914	TAG	2	6	1076318	1076323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_012914	AG	3	6	1076348	1076353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_012914	GCA	2	6	1077906	1077911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_012914	TGC	2	6	1077936	1077941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_012914	AAT	2	6	1077985	1077990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_012914	GCA	2	6	1078066	1078071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_012914	AGG	2	6	1078093	1078098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_012914	ATG	2	6	1083083	1083088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_012914	GCCC	2	8	1083094	1083101	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3108	NC_012914	CGGG	2	8	1083115	1083122	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3109	NC_012914	T	6	6	1083124	1083129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_012914	GAT	2	6	1083144	1083149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_012914	GA	3	6	1083208	1083213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_012914	TA	3	6	1085109	1085114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_012914	CTTG	2	8	1085124	1085131	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3114	NC_012914	GGGA	2	8	1085143	1085150	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_012914	TTTTG	2	10	1086834	1086843	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_012914	TCT	2	6	1086925	1086930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_012914	A	6	6	1086958	1086963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_012914	AGC	2	6	1087015	1087020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_012914	GGTGAA	2	12	1087068	1087079	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_012914	TAT	2	6	1087141	1087146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_012914	GAG	2	6	1087168	1087173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_012914	T	7	7	1088949	1088955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_012914	ATT	2	6	1088990	1088995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_012914	CCG	2	6	1089003	1089008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3125	NC_012914	GAA	2	6	1094434	1094439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_012914	TTC	2	6	1094454	1094459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_012914	TACG	2	8	1094474	1094481	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3128	NC_012914	AAG	2	6	1094510	1094515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_012914	TGA	2	6	1094541	1094546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_012914	ATT	2	6	1094553	1094558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_012914	ATC	2	6	1094574	1094579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_012914	AGT	2	6	1095645	1095650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_012914	AAG	2	6	1095700	1095705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_012914	T	7	7	1096968	1096974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_012914	TGC	2	6	1097015	1097020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3136	NC_012914	ATG	2	6	1097043	1097048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_012914	AAGG	2	8	1097886	1097893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_012914	TA	3	6	1097946	1097951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_012914	CGA	2	6	1097964	1097969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3140	NC_012914	AGG	2	6	1097973	1097978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3141	NC_012914	T	6	6	1098708	1098713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3142	NC_012914	AAG	2	6	1099337	1099342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3143	NC_012914	ATT	2	6	1100954	1100959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3144	NC_012914	TAT	2	6	1100970	1100975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3145	NC_012914	TAC	2	6	1100976	1100981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3147	NC_012914	ACC	2	6	1101025	1101030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3148	NC_012914	ACGC	2	8	1101046	1101053	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3149	NC_012914	GCAG	2	8	1101978	1101985	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3150	NC_012914	CCT	2	6	1101987	1101992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3151	NC_012914	TCC	2	6	1102993	1102998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3152	NC_012914	TGA	2	6	1103005	1103010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3153	NC_012914	CGG	2	6	1103035	1103040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3154	NC_012914	TC	3	6	1105519	1105524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3155	NC_012914	CAG	2	6	1105673	1105678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3157	NC_012914	TTGC	2	8	1107897	1107904	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3158	NC_012914	CT	3	6	1108483	1108488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3159	NC_012914	TCC	2	6	1110745	1110750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3164	NC_012914	ATG	2	6	1110905	1110910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3166	NC_012914	ATT	2	6	1110960	1110965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3175	NC_012914	G	6	6	1112605	1112610	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3178	NC_012914	GCT	2	6	1112803	1112808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3212	NC_012914	AGCC	2	8	1124018	1124025	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3213	NC_012914	CCAAC	2	10	1124044	1124053	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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3232	NC_012914	GCCA	2	8	1136826	1136833	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3245	NC_012914	TTA	2	6	1145371	1145376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3249	NC_012914	TC	3	6	1146527	1146532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3250	NC_012914	CAA	2	6	1146644	1146649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3251	NC_012914	AGGGA	2	10	1146668	1146677	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_012914	CTCG	2	8	1148051	1148058	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3253	NC_012914	TTCAT	2	10	1150294	1150303	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3254	NC_012914	AGG	2	6	1150307	1150312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3255	NC_012914	AGT	2	6	1156761	1156766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3257	NC_012914	GAG	2	6	1158419	1158424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3258	NC_012914	ACC	2	6	1161830	1161835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3259	NC_012914	GGT	2	6	1161842	1161847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3260	NC_012914	T	7	7	1161847	1161853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3261	NC_012914	T	6	6	1161855	1161860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3262	NC_012914	CAT	2	6	1161882	1161887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3263	NC_012914	GGA	2	6	1161907	1161912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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