MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas fluorescens SBW25 chromosome

Total Repeats: 14384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012660	AGCA	2	8	1557124	1557131	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3002	NC_012660	CA	4	8	1557782	1557789	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3003	NC_012660	GCG	2	6	1558831	1558836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_012660	GT	3	6	1561300	1561305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_012660	AACC	2	8	1561343	1561350	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3006	NC_012660	GCGCC	2	10	1562972	1562981	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3007	NC_012660	GCA	2	6	1562992	1562997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_012660	ACA	2	6	1565167	1565172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_012660	AGC	2	6	1565193	1565198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_012660	GA	3	6	1565205	1565210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_012660	GCGG	2	8	1568040	1568047	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3012	NC_012660	CGC	2	6	1568052	1568057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3013	NC_012660	TACGG	2	10	1568098	1568107	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3014	NC_012660	TAC	2	6	1568160	1568165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_012660	GC	3	6	1568199	1568204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3016	NC_012660	TTTG	2	8	1568678	1568685	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_012660	GAC	2	6	1569344	1569349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_012660	TCG	2	6	1569353	1569358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_012660	T	6	6	1569369	1569374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_012660	CTGAA	2	10	1569994	1570003	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3021	NC_012660	CGG	2	6	1570007	1570012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_012660	CCG	2	6	1570028	1570033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3023	NC_012660	G	8	8	1570484	1570491	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_012660	TGA	2	6	1570543	1570548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_012660	CTG	2	6	1571493	1571498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_012660	TCC	2	6	1571990	1571995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3027	NC_012660	CCT	2	6	1572191	1572196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3028	NC_012660	GT	4	8	1572201	1572208	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_012660	TGG	2	6	1572209	1572214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_012660	CTAC	2	8	1572249	1572256	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3031	NC_012660	TC	3	6	1576057	1576062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3032	NC_012660	GTG	2	6	1576065	1576070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_012660	GT	3	6	1576619	1576624	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_012660	A	7	7	1576711	1576717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_012660	T	7	7	1576736	1576742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_012660	AAC	2	6	1576760	1576765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_012660	TCG	2	6	1576815	1576820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_012660	TTC	2	6	1576910	1576915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_012660	TG	4	8	1576921	1576928	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_012660	GT	3	6	1576961	1576966	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_012660	GC	3	6	1577937	1577942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3042	NC_012660	GTT	2	6	1578031	1578036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_012660	CCCG	2	8	1579190	1579197	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3044	NC_012660	GTA	2	6	1580842	1580847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_012660	GGA	2	6	1580850	1580855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_012660	CCTGG	2	10	1580872	1580881	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3047	NC_012660	CAT	2	6	1580898	1580903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_012660	GCC	2	6	1581038	1581043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3049	NC_012660	AGG	2	6	1581078	1581083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_012660	GCG	2	6	1581465	1581470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_012660	GGT	2	6	1582673	1582678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_012660	GT	3	6	1582677	1582682	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_012660	GGC	2	6	1583455	1583460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_012660	CGG	2	6	1583481	1583486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_012660	CG	3	6	1583511	1583516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3056	NC_012660	T	7	7	1583518	1583524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_012660	GATT	2	8	1583579	1583586	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_012660	T	6	6	1585592	1585597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_012660	TGA	2	6	1585612	1585617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_012660	GTTT	2	8	1585650	1585657	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_012660	TTA	2	6	1585700	1585705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_012660	GGT	2	6	1585719	1585724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_012660	TTGA	2	8	1585787	1585794	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_012660	T	6	6	1587947	1587952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_012660	CTG	2	6	1587984	1587989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_012660	CCTG	2	8	1588039	1588046	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3067	NC_012660	GCTTG	2	10	1588097	1588106	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3068	NC_012660	T	7	7	1590460	1590466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_012660	CAT	2	6	1590510	1590515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_012660	GGC	2	6	1590560	1590565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_012660	TGC	2	6	1590577	1590582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_012660	GAGT	2	8	1590620	1590627	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_012660	GGC	2	6	1590733	1590738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_012660	CT	3	6	1590817	1590822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3075	NC_012660	AG	3	6	1590833	1590838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_012660	T	6	6	1590842	1590847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_012660	TGC	2	6	1590861	1590866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_012660	CAGT	2	8	1594090	1594097	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3079	NC_012660	AGT	2	6	1594135	1594140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_012660	CGT	2	6	1597319	1597324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_012660	TGT	2	6	1598368	1598373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_012660	GTT	2	6	1598379	1598384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_012660	ACC	2	6	1599769	1599774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3084	NC_012660	GTG	2	6	1599879	1599884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_012660	ACC	2	6	1599888	1599893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3086	NC_012660	CTGA	2	8	1599895	1599902	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3087	NC_012660	GCG	2	6	1602815	1602820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_012660	CAT	2	6	1603794	1603799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_012660	GCC	2	6	1603881	1603886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3090	NC_012660	GAG	2	6	1603892	1603897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_012660	ATC	2	6	1604672	1604677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_012660	GCT	2	6	1606373	1606378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_012660	GT	3	6	1606848	1606853	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_012660	CT	3	6	1606994	1606999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3095	NC_012660	ACC	2	6	1607028	1607033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3096	NC_012660	TCTG	2	8	1607087	1607094	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3097	NC_012660	CCT	2	6	1607131	1607136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3098	NC_012660	TAA	2	6	1607228	1607233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_012660	TCG	2	6	1607299	1607304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_012660	GTG	2	6	1607310	1607315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_012660	AGAC	2	8	1607385	1607392	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3102	NC_012660	ACT	2	6	1607555	1607560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_012660	CCG	2	6	1608796	1608801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3104	NC_012660	ACTA	2	8	1608853	1608860	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3105	NC_012660	AGA	2	6	1608871	1608876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_012660	TCTA	2	8	1610550	1610557	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3107	NC_012660	TGG	2	6	1610560	1610565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_012660	GCC	2	6	1610662	1610667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3109	NC_012660	ACC	2	6	1610848	1610853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3110	NC_012660	ACT	2	6	1610858	1610863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_012660	GC	3	6	1610869	1610874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3112	NC_012660	CGCT	2	8	1610896	1610903	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3113	NC_012660	CTA	2	6	1612713	1612718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_012660	TA	3	6	1612720	1612725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_012660	CGA	2	6	1612917	1612922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_012660	ATT	2	6	1612927	1612932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_012660	GT	3	6	1612966	1612971	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_012660	GTGC	2	8	1612981	1612988	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3119	NC_012660	CTTG	2	8	1612995	1613002	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3120	NC_012660	CCT	2	6	1613069	1613074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3121	NC_012660	GAG	2	6	1613086	1613091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_012660	GCG	2	6	1613684	1613689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_012660	AG	3	6	1613697	1613702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_012660	T	6	6	1615387	1615392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_012660	GTCG	2	8	1615444	1615451	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3126	NC_012660	TCG	2	6	1615492	1615497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_012660	T	6	6	1616994	1616999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_012660	CAC	2	6	1618794	1618799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3129	NC_012660	GCA	2	6	1619934	1619939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_012660	CGG	2	6	1619978	1619983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_012660	GCT	2	6	1619994	1619999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_012660	CCG	2	6	1621166	1621171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3133	NC_012660	AGG	2	6	1621181	1621186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_012660	ATG	2	6	1621247	1621252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_012660	CGT	2	6	1621261	1621266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3136	NC_012660	CT	3	6	1621339	1621344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3137	NC_012660	CCA	2	6	1624142	1624147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3138	NC_012660	A	6	6	1624907	1624912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_012660	GCTTT	2	10	1624924	1624933	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3140	NC_012660	ATG	2	6	1624950	1624955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3142	NC_012660	TC	3	6	1625044	1625049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3145	NC_012660	T	7	7	1625159	1625165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3146	NC_012660	ATT	2	6	1625241	1625246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3164	NC_012660	A	7	7	1627606	1627612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3251	NC_012660	GGCTT	2	10	1642188	1642197	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3254	NC_012660	AACGG	2	10	1644671	1644680	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3255	NC_012660	TCTA	2	8	1646013	1646020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3256	NC_012660	TCAG	2	8	1646073	1646080	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3257	NC_012660	TTG	2	6	1646085	1646090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3259	NC_012660	ACA	2	6	1649263	1649268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3260	NC_012660	TGTGT	2	10	1650207	1650216	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3261	NC_012660	GGT	2	6	1650317	1650322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3263	NC_012660	GGT	2	6	1650497	1650502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3265	NC_012660	TGTGT	2	10	1650747	1650756	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3266	NC_012660	TGTGT	2	10	1650866	1650875	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3267	NC_012660	GGT	2	6	1650976	1650981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3391	NC_012660	GGC	3	9	1720742	1720750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3392	NC_012660	C	6	6	1720750	1720755	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3393	NC_012660	CAT	2	6	1720919	1720924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3395	NC_012660	GCC	2	6	1720938	1720943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3396	NC_012660	CGGCAG	2	12	1721591	1721602	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3397	NC_012660	GTA	2	6	1721626	1721631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3400	NC_012660	TA	3	6	1721687	1721692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3478	NC_012660	CCT	2	6	1748284	1748289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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