MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Pseudomonas fluorescens SBW25 chromosome

Total Repeats: 14384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012660	GGT	2	6	454526	454531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_012660	CG	3	6	454550	454555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_012660	AGG	2	6	454624	454629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_012660	GAC	2	6	454668	454673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_012660	AGGTCA	2	12	454687	454698	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1006	NC_012660	ACG	2	6	454732	454737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_012660	GCC	2	6	454739	454744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_012660	CGG	2	6	454805	454810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_012660	CAAAG	2	10	454827	454836	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1010	NC_012660	GCC	2	6	454879	454884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_012660	TGG	2	6	454900	454905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_012660	A	6	6	454911	454916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_012660	GCT	2	6	454922	454927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_012660	TAT	2	6	454946	454951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_012660	CGG	2	6	455531	455536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_012660	GTC	2	6	455601	455606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_012660	CGG	2	6	458300	458305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_012660	GCC	2	6	458316	458321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_012660	A	6	6	458335	458340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_012660	CG	3	6	458369	458374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_012660	A	6	6	458425	458430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_012660	TCG	2	6	458494	458499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_012660	GT	3	6	458524	458529	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_012660	TTGAA	2	10	458590	458599	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_012660	TGA	2	6	463109	463114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_012660	AC	3	6	464628	464633	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_012660	T	7	7	464767	464773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_012660	GT	3	6	465895	465900	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_012660	AC	3	6	465923	465928	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_012660	GGA	2	6	467260	467265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_012660	A	6	6	467290	467295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_012660	AT	3	6	467324	467329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_012660	CCT	2	6	468267	468272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_012660	TGT	2	6	468283	468288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_012660	GAGC	2	8	468292	468299	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1036	NC_012660	TTG	2	6	468300	468305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_012660	TTG	2	6	468318	468323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_012660	GAGC	2	8	468328	468335	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1039	NC_012660	CAC	2	6	468411	468416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_012660	CGG	2	6	477914	477919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_012660	AGTCG	2	10	477951	477960	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1042	NC_012660	TTG	2	6	479978	479983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_012660	GCG	2	6	480015	480020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_012660	TCGA	2	8	480072	480079	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1045	NC_012660	CAG	2	6	480134	480139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_012660	CAG	2	6	480167	480172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_012660	GGC	2	6	480191	480196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_012660	GCCA	2	8	480264	480271	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_012660	CGT	2	6	480277	480282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_012660	GCTG	2	8	480289	480296	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1051	NC_012660	AGC	3	9	480297	480305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_012660	TGG	2	6	480307	480312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_012660	GTGG	2	8	480347	480354	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_012660	CAG	2	6	480368	480373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_012660	GC	3	6	480445	480450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1056	NC_012660	AC	3	6	480452	480457	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_012660	CACC	2	8	480478	480485	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1058	NC_012660	GCCCGC	2	12	480493	480504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_012660	GTGG	2	8	480635	480642	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_012660	GCT	2	6	480679	480684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_012660	GTGCG	2	10	480706	480715	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1062	NC_012660	A	6	6	480726	480731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_012660	ACA	2	6	480733	480738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_012660	ACA	2	6	480748	480753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_012660	CGG	2	6	480768	480773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_012660	GGC	2	6	480785	480790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_012660	TCA	2	6	480805	480810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_012660	TGCC	2	8	480865	480872	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_012660	ATC	2	6	480887	480892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_012660	GC	4	8	480894	480901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_012660	GAA	2	6	480913	480918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_012660	CGG	2	6	480984	480989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_012660	CAGC	2	8	481009	481016	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_012660	GCCAG	2	10	481032	481041	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1075	NC_012660	CCACAC	2	12	481177	481188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_012660	GC	3	6	481201	481206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_012660	GGC	2	6	481212	481217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_012660	GTC	2	6	481231	481236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_012660	GAT	2	6	481255	481260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1081	NC_012660	CAG	2	6	481423	481428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1083	NC_012660	GCT	2	6	481480	481485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_012660	CGT	2	6	481488	481493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_012660	CAG	2	6	481498	481503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_012660	GCAGG	2	10	481504	481513	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1087	NC_012660	GCT	2	6	481516	481521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_012660	CGG	2	6	481539	481544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_012660	CGG	2	6	481548	481553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_012660	GCA	2	6	481641	481646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_012660	ATC	2	6	481668	481673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1093	NC_012660	GCA	2	6	486237	486242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_012660	CATT	2	8	486295	486302	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1095	NC_012660	ACA	2	6	487101	487106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_012660	CA	3	6	487169	487174	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_012660	TAG	2	6	487309	487314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_012660	GC	3	6	487393	487398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_012660	CTA	2	6	487417	487422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_012660	TAG	2	6	487450	487455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_012660	GGT	2	6	487739	487744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_012660	CTGTT	2	10	488329	488338	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1103	NC_012660	CAG	2	6	490602	490607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_012660	CTG	2	6	490622	490627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_012660	GAA	2	6	494044	494049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_012660	CGT	2	6	494057	494062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_012660	TGC	2	6	495897	495902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_012660	TTG	2	6	495954	495959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_012660	TGT	2	6	495973	495978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_012660	TTG	2	6	495991	495996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_012660	AGC	2	6	496030	496035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_012660	GCT	2	6	496088	496093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_012660	CT	3	6	497829	497834	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_012660	CGGCC	2	10	497950	497959	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1115	NC_012660	A	6	6	497963	497968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_012660	GC	3	6	497975	497980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_012660	GGC	2	6	500374	500379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_012660	GGA	2	6	500388	500393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_012660	GATT	2	8	500436	500443	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_012660	GTCA	2	8	500495	500502	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_012660	GCC	2	6	504574	504579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_012660	AAT	2	6	504656	504661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_012660	TTG	2	6	504811	504816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_012660	ACC	2	6	504841	504846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_012660	GTCA	2	8	504889	504896	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1126	NC_012660	CTAC	2	8	504921	504928	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_012660	TCG	2	6	506478	506483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_012660	GTTGA	2	10	506498	506507	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_012660	GA	3	6	506506	506511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_012660	T	7	7	506540	506546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_012660	CGC	2	6	506559	506564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_012660	AGG	2	6	506624	506629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_012660	G	6	6	506628	506633	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_012660	C	6	6	506653	506658	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1135	NC_012660	TGG	2	6	510689	510694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_012660	T	7	7	510733	510739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_012660	GCCT	2	8	510749	510756	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1138	NC_012660	CGC	2	6	510781	510786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1139	NC_012660	AGC	2	6	511714	511719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1153	NC_012660	AGT	2	6	520028	520033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1162	NC_012660	T	6	6	530299	530304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1177	NC_012660	T	6	6	541132	541137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1252	NC_012660	T	6	6	589886	589891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1253	NC_012660	ATT	2	6	589892	589897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1256	NC_012660	GGC	2	6	593667	593672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1259	NC_012660	CGA	2	6	593799	593804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1260	NC_012660	TCGT	2	8	593818	593825	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1261	NC_012660	GCC	2	6	593899	593904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1262	NC_012660	GTG	2	6	596581	596586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1263	NC_012660	CAA	2	6	601256	601261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1264	NC_012660	T	6	6	601337	601342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1265	NC_012660	A	6	6	601358	601363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1267	NC_012660	A	7	7	601548	601554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1268	NC_012660	A	6	6	601594	601599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1269	NC_012660	CAC	2	6	601702	601707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1270	NC_012660	GCA	2	6	601712	601717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1271	NC_012660	CAA	2	6	601719	601724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1272	NC_012660	CGT	2	6	601731	601736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1273	NC_012660	GC	3	6	601742	601747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1274	NC_012660	A	6	6	601788	601793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1275	NC_012660	TTG	2	6	601850	601855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1401	NC_012660	CGG	2	6	693687	693692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1402	NC_012660	G	9	9	695054	695062	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1403	NC_012660	C	6	6	695066	695071	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1404	NC_012660	GCT	2	6	695095	695100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1405	NC_012660	A	6	6	696797	696802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1407	NC_012660	TGT	2	6	698188	698193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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