MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Persephonella marina EX-H1 plasmid unnamed

Total Repeats: 138

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012439	AAACA	2	10	27	36	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_012439	GTT	2	6	56	61	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012439	GAA	2	6	62	67	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012439	A	8	8	66	73	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012439	TGG	2	6	98	103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012439	ATT	2	6	937	942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012439	GAAA	2	8	964	971	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012439	ATTTC	2	10	4901	4910	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_012439	AGT	2	6	5079	5084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012439	GAA	2	6	5101	5106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012439	ATT	2	6	5124	5129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012439	TTG	2	6	5132	5137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012439	CAA	2	6	5749	5754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012439	TCAAG	2	10	5777	5786	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_012439	T	7	7	5787	5793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012439	AT	4	8	5828	5835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012439	AAT	2	6	5851	5856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012439	T	6	6	5856	5861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012439	A	7	7	5863	5869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012439	CTC	2	6	7101	7106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_012439	TAT	2	6	10385	10390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012439	ATTT	2	8	10392	10399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012439	AAT	2	6	10451	10456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012439	AT	3	6	11232	11237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012439	TA	4	8	11285	11292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012439	GAA	2	6	11324	11329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012439	AAG	2	6	11339	11344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012439	TTTA	2	8	11363	11370	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012439	ATT	2	6	17595	17600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012439	A	6	6	17627	17632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012439	AATT	2	8	17645	17652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012439	TTG	2	6	17660	17665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012439	ATT	2	6	26060	26065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012439	TCC	2	6	26067	26072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_012439	CCT	2	6	36152	36157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_012439	T	7	7	36586	36592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012439	ATTG	2	8	36648	36655	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012439	AAG	2	6	36664	36669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012439	AT	3	6	36673	36678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012439	A	7	7	36690	36696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012439	GAA	2	6	36708	36713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012439	AGG	2	6	36723	36728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012439	GAAGG	2	10	37435	37444	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012439	CAA	2	6	37455	37460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012439	CCT	2	6	38227	38232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_012439	T	6	6	38238	38243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012439	CTTT	2	8	38279	38286	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_012439	AAAT	2	8	38327	38334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012439	TCC	2	6	38363	38368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_012439	CCT	2	6	39114	39119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_012439	TTG	2	6	39130	39135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012439	TCC	2	6	40001	40006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_012439	GAAGG	2	10	40039	40048	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012439	CCT	2	6	40938	40943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_012439	TCC	2	6	41094	41099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_012439	CCT	2	6	41256	41261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_012439	T	6	6	41269	41274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012439	CCT	2	6	41602	41607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_012439	A	6	6	41641	41646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012439	T	6	6	41684	41689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012439	G	6	6	41691	41696	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012439	TAAA	2	8	41763	41770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012439	CAA	2	6	41834	41839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012439	TAA	2	6	41893	41898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012439	CCAAA	2	10	41916	41925	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_012439	A	6	6	41923	41928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012439	GAAA	2	8	41932	41939	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012439	A	7	7	41937	41943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012439	A	6	6	42025	42030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012439	AAC	2	6	42074	42079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_012439	TAA	2	6	42088	42093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012439	CCT	2	6	42436	42441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_012439	A	7	7	45231	45237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012439	T	6	6	45239	45244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012439	T	7	7	45267	45273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012439	A	6	6	45281	45286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012439	AATT	2	8	45300	45307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012439	TTA	2	6	46936	46941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012439	TTA	2	6	46957	46962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012439	TTA	2	6	46978	46983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012439	TTA	2	6	46999	47004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012439	T	7	7	47023	47029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012439	CCG	2	6	47058	47063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_012439	AT	3	6	47103	47108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012439	GAT	4	12	47109	47120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012439	AT	4	8	47119	47126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012439	A	6	6	47127	47132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012439	A	7	7	47136	47142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012439	AATA	2	8	47147	47154	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012439	AT	3	6	47174	47179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012439	T	6	6	47198	47203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012439	TAC	2	6	47252	47257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_012439	A	6	6	47271	47276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012439	CCCG	2	8	47287	47294	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
95	NC_012439	A	8	8	47327	47334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012439	GAAA	2	8	47348	47355	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012439	A	6	6	47353	47358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012439	TCC	2	6	47642	47647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_012439	AT	3	6	47674	47679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012439	AGG	2	6	49126	49131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012439	AGG	2	6	49799	49804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012439	TCA	2	6	50373	50378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_012439	TTG	2	6	50395	50400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012439	GAA	4	12	50406	50417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012439	AGG	2	6	50441	50446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012439	T	8	8	51369	51376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012439	TAA	2	6	51395	51400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012439	TAT	2	6	51427	51432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012439	TAA	2	6	51443	51448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012439	ATA	2	6	51458	51463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012439	TGT	2	6	51467	51472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012439	ATC	2	6	51492	51497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_012439	TTATT	2	10	51517	51526	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012439	ACA	2	6	51530	51535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012439	TAG	2	6	51539	51544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012439	TAA	2	6	51551	51556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012439	ACA	2	6	51568	51573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012439	CCA	2	6	51574	51579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_012439	AATT	2	8	51604	51611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012439	TTGT	2	8	51624	51631	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012439	ATT	2	6	51644	51649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012439	TTATT	2	10	51656	51665	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012439	TAT	2	6	51694	51699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012439	TAT	2	6	51702	51707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012439	AAAAG	2	10	51736	51745	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012439	AAGC	2	8	53163	53170	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_012439	AGAT	2	8	53226	53233	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012439	AGAA	2	8	53245	53252	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012439	GAA	2	6	53297	53302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012439	TACA	2	8	53366	53373	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_012439	T	6	6	53400	53405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012439	AAGG	2	8	53417	53424	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012439	ATT	2	6	53433	53438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012439	TATGAA	2	12	53485	53496	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012439	T	6	6	53516	53521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012439	TTA	2	6	53583	53588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012439	AGT	2	6	53623	53628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012439	ATT	2	6	53675	53680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.