MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Phenylobacterium zucineum HLK1 chromosome

Total Repeats: 12092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_011144	GC	3	6	3957780	3957785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12002	NC_011144	AAG	2	6	3959410	3959415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12003	NC_011144	GCG	2	6	3959429	3959434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12004	NC_011144	CG	3	6	3959444	3959449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12005	NC_011144	GGT	2	6	3959456	3959461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12006	NC_011144	CG	3	6	3959484	3959489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12007	NC_011144	G	6	6	3959496	3959501	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12008	NC_011144	C	6	6	3961222	3961227	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12009	NC_011144	G	6	6	3961926	3961931	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12010	NC_011144	CCG	2	6	3961940	3961945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12011	NC_011144	CGCTC	2	10	3961968	3961977	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12012	NC_011144	CCTCTC	2	12	3961994	3962005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12013	NC_011144	GAG	2	6	3962019	3962024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12014	NC_011144	C	6	6	3962036	3962041	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12015	NC_011144	AG	3	6	3962059	3962064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12016	NC_011144	GA	3	6	3962082	3962087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12017	NC_011144	GA	3	6	3962094	3962099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12018	NC_011144	GCC	2	6	3962114	3962119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12019	NC_011144	GAC	2	6	3967171	3967176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12020	NC_011144	GCC	2	6	3967231	3967236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12021	NC_011144	GCC	2	6	3967284	3967289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12022	NC_011144	GCG	2	6	3967296	3967301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12023	NC_011144	CTC	2	6	3967356	3967361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12024	NC_011144	CCTCTC	2	12	3967365	3967376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12025	NC_011144	G	6	6	3967385	3967390	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12026	NC_011144	AGG	2	6	3967393	3967398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12027	NC_011144	GCCT	2	8	3967401	3967408	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12028	NC_011144	GC	3	6	3967421	3967426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12029	NC_011144	GAGAGG	2	12	3967433	3967444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12030	NC_011144	GCC	2	6	3967789	3967794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12031	NC_011144	GC	3	6	3967799	3967804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12032	NC_011144	CG	3	6	3968506	3968511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12033	NC_011144	GC	3	6	3968561	3968566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12034	NC_011144	CGG	3	9	3968604	3968612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12035	NC_011144	GA	3	6	3968616	3968621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12036	NC_011144	GGCT	2	8	3970253	3970260	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12037	NC_011144	GC	3	6	3970287	3970292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12038	NC_011144	CGC	2	6	3970315	3970320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12039	NC_011144	CGCC	2	8	3970347	3970354	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12040	NC_011144	GCC	2	6	3974301	3974306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12041	NC_011144	GAC	2	6	3974307	3974312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12042	NC_011144	CG	3	6	3974959	3974964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12043	NC_011144	CCT	2	6	3974978	3974983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12044	NC_011144	GCC	2	6	3975021	3975026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12045	NC_011144	GAT	2	6	3979235	3979240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12046	NC_011144	GGA	2	6	3979286	3979291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12047	NC_011144	GCC	2	6	3981805	3981810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12048	NC_011144	CGC	3	9	3985560	3985568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12049	NC_011144	TGA	2	6	3985602	3985607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12050	NC_011144	CG	3	6	3985616	3985621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12051	NC_011144	GCC	2	6	3985635	3985640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12052	NC_011144	GGC	2	6	3985653	3985658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12053	NC_011144	GC	3	6	3985727	3985732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12054	NC_011144	C	6	6	3985740	3985745	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12055	NC_011144	CCT	2	6	3985762	3985767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12056	NC_011144	GAG	2	6	3985798	3985803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12057	NC_011144	GGCG	2	8	3985809	3985816	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12058	NC_011144	GCCGC	2	10	3987786	3987795	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12059	NC_011144	CGG	2	6	3987831	3987836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12060	NC_011144	C	6	6	3987843	3987848	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12061	NC_011144	CCG	2	6	3987857	3987862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12062	NC_011144	CG	3	6	3987899	3987904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12063	NC_011144	CT	3	6	3987909	3987914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12064	NC_011144	CG	3	6	3987921	3987926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12065	NC_011144	CGG	3	9	3987965	3987973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12066	NC_011144	CG	3	6	3988006	3988011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12067	NC_011144	CTA	2	6	3989638	3989643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12069	NC_011144	GGGA	2	8	3991370	3991377	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12070	NC_011144	CT	3	6	3991385	3991390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12071	NC_011144	GAA	2	6	3991507	3991512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12072	NC_011144	TCGC	2	8	3992961	3992968	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12073	NC_011144	CGTC	2	8	3993009	3993016	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12074	NC_011144	GAG	2	6	3993058	3993063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12075	NC_011144	CGG	2	6	3993075	3993080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12076	NC_011144	GGGCG	2	10	3993083	3993092	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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12086	NC_011144	CCG	2	6	3995991	3995996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12087	NC_011144	CCT	2	6	3996001	3996006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12088	NC_011144	ACGG	2	8	3996027	3996034	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12089	NC_011144	CGG	2	6	3996045	3996050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12090	NC_011144	CCCG	2	8	3996061	3996068	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12091	NC_011144	TCC	2	6	3996098	3996103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12092	NC_011144	GCCC	2	8	3996107	3996114	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.