MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1 chromosome

Total Repeats: 6538

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010531	ATTG	2	8	978722	978729	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_010531	AAG	2	6	978775	978780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_010531	TCA	2	6	978811	978816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_010531	GCA	2	6	978861	978866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_010531	CTG	2	6	978876	978881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_010531	TG	3	6	978930	978935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_010531	TGG	2	6	978947	978952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_010531	TTC	2	6	978965	978970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_010531	CGG	2	6	979021	979026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_010531	AC	3	6	979069	979074	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4011	NC_010531	CCG	2	6	979081	979086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_010531	TCA	2	6	979115	979120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_010531	TGG	2	6	979132	979137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_010531	CGG	2	6	979202	979207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_010531	GGC	2	6	979251	979256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_010531	AGCC	2	8	979423	979430	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4017	NC_010531	GGACAT	2	12	979481	979492	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4018	NC_010531	TGAAAC	2	12	979699	979710	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4019	NC_010531	A	6	6	983058	983063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_010531	GCCCT	2	10	983064	983073	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4021	NC_010531	ATT	2	6	983076	983081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_010531	GGA	2	6	983093	983098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_010531	TTTC	2	8	983101	983108	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4024	NC_010531	CTA	2	6	983191	983196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_010531	TGAT	2	8	983232	983239	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_010531	GA	3	6	983246	983251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_010531	TGGT	2	8	983281	983288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_010531	ACC	2	6	983355	983360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4029	NC_010531	AGA	2	6	983384	983389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_010531	A	6	6	983400	983405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_010531	ACC	2	6	983482	983487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4032	NC_010531	TGA	2	6	983527	983532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_010531	TGA	2	6	983554	983559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_010531	A	7	7	983583	983589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_010531	T	6	6	984365	984370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_010531	CTT	2	6	989109	989114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_010531	GCTA	2	8	989129	989136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4038	NC_010531	T	6	6	989357	989362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_010531	TATCTT	2	12	989368	989379	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4040	NC_010531	ACA	2	6	991253	991258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_010531	CAA	2	6	991261	991266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_010531	GCCA	2	8	991273	991280	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4043	NC_010531	ACC	2	6	991351	991356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4044	NC_010531	TG	3	6	991703	991708	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_010531	T	6	6	991737	991742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_010531	TTG	2	6	991812	991817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_010531	AAAT	2	8	991826	991833	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_010531	ACT	2	6	991924	991929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_010531	TTTTG	2	10	991981	991990	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_010531	TAA	2	6	992104	992109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_010531	TGA	2	6	992970	992975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_010531	CTG	3	9	993296	993304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_010531	TTA	2	6	993305	993310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_010531	ATTTT	2	10	993320	993329	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_010531	T	6	6	993326	993331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_010531	TTGA	2	8	993365	993372	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_010531	CTG	2	6	993378	993383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_010531	TGC	2	6	993459	993464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_010531	TTC	2	6	993502	993507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_010531	TACATT	2	12	993530	993541	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4061	NC_010531	CAAA	2	8	993546	993553	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4062	NC_010531	ACC	2	6	993555	993560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4063	NC_010531	GCA	2	6	993579	993584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_010531	GTA	2	6	994598	994603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_010531	GTT	2	6	994853	994858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_010531	CTA	2	6	995709	995714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_010531	GCA	2	6	995826	995831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_010531	GCGG	2	8	995838	995845	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4069	NC_010531	CAA	2	6	995875	995880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_010531	GTAAT	2	10	998295	998304	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_010531	TGC	2	6	998412	998417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_010531	T	6	6	998451	998456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_010531	TTC	2	6	998471	998476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_010531	AGGT	2	8	998509	998516	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_010531	ACAG	2	8	998539	998546	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4076	NC_010531	C	6	6	998558	998563	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4077	NC_010531	GCT	2	6	998579	998584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_010531	GCCC	2	8	998585	998592	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4079	NC_010531	TTGA	2	8	998610	998617	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_010531	GCT	2	6	998644	998649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_010531	AATT	2	8	998837	998844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_010531	CGCT	2	8	998853	998860	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4083	NC_010531	TC	3	6	998949	998954	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4084	NC_010531	TTC	2	6	998974	998979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_010531	AGA	2	6	998999	999004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_010531	TAAT	2	8	999104	999111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_010531	GCCCC	2	10	999115	999124	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
4088	NC_010531	CAC	2	6	999174	999179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4089	NC_010531	TGG	2	6	999209	999214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_010531	ATT	2	6	999225	999230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_010531	CAC	2	6	999260	999265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4092	NC_010531	TCA	2	6	999296	999301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_010531	CAC	2	6	999302	999307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4094	NC_010531	GCT	2	6	999313	999318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4096	NC_010531	TGT	2	6	999412	999417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_010531	AAAC	2	8	999507	999514	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4098	NC_010531	ATGG	2	8	999527	999534	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_010531	ATG	2	6	999545	999550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_010531	ACTTT	2	10	999578	999587	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4101	NC_010531	TGC	2	6	999588	999593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_010531	CAA	2	6	999675	999680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_010531	TAA	2	6	999739	999744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_010531	AC	3	6	999774	999779	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4105	NC_010531	GCC	2	6	999831	999836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4106	NC_010531	AAAGCC	2	12	999861	999872	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_010531	GAA	3	9	999965	999973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4109	NC_010531	ATC	2	6	1000196	1000201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_010531	GCA	2	6	1000292	1000297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_010531	TGGC	2	8	1000299	1000306	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4112	NC_010531	GCC	2	6	1000319	1000324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4113	NC_010531	TAA	2	6	1000364	1000369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_010531	AACA	2	8	1000391	1000398	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4115	NC_010531	ATAA	2	8	1000430	1000437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_010531	ACC	2	6	1000598	1000603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4117	NC_010531	CTC	2	6	1000628	1000633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4118	NC_010531	A	6	6	1000640	1000645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_010531	ATTA	2	8	1000679	1000686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_010531	AGC	2	6	1000707	1000712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_010531	A	6	6	1000733	1000738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_010531	GCT	2	6	1000774	1000779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_010531	TCA	2	6	1000833	1000838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_010531	T	6	6	1001821	1001826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_010531	ATC	3	9	1001902	1001910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_010531	CTT	2	6	1001913	1001918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_010531	ACA	2	6	1001941	1001946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_010531	AGC	2	6	1002080	1002085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_010531	TTG	2	6	1002086	1002091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_010531	GAAA	2	8	1002101	1002108	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_010531	CAAA	2	8	1002129	1002136	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4132	NC_010531	TATG	2	8	1002161	1002168	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_010531	A	6	6	1003007	1003012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_010531	CAA	2	6	1003020	1003025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4135	NC_010531	GAGG	2	8	1003041	1003048	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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4247	NC_010531	ATT	2	6	1022246	1022251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4265	NC_010531	GCCA	2	8	1023014	1023021	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4266	NC_010531	TTGAT	2	10	1023066	1023075	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4267	NC_010531	AGT	2	6	1023242	1023247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4381	NC_010531	GCA	2	6	1033806	1033811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4384	NC_010531	AAAG	2	8	1033873	1033880	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4385	NC_010531	GGTT	2	8	1033905	1033912	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4388	NC_010531	T	6	6	1034385	1034390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4389	NC_010531	C	6	6	1034409	1034414	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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4392	NC_010531	TGCC	2	8	1036560	1036567	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4394	NC_010531	CTA	2	6	1044288	1044293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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